More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_2876 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_2876  ribokinase-like domain-containing protein  100 
 
 		 312 aa  641    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.421827  normal  0.258562 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2125  2-keto-3-deoxygluconate kinase  55.21 
 
 		 298 aa  325  5e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.190245  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2510  carbohydrate kinase, PfkB  52.82 
 
 		 307 aa  316  4e-85  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3085  2-keto-3-deoxygluconate kinase  52.51 
 
 		 311 aa  310  2e-83  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.235741  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2782  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  52.49 
 
 		 307 aa  305  6e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.191154  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4546  PfkB domain protein  50.82 
 
 		 311 aa  283  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00872695  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0399  ribokinase-like domain-containing protein  50.81 
 
 		 326 aa  283  2.0000000000000002e-75  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0392221  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1269  2-keto-3-deoxygluconate kinase  50 
 
 		 296 aa  283  3.0000000000000004e-75  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0299866 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3070  ribokinase-like domain-containing protein  50.16 
 
 		 312 aa  282  6.000000000000001e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.062959 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000918  2-dehydro-3-deoxygluconate kinase  47.1 
 
 		 309 aa  277  1e-73  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0082  PfkB domain protein  47.88 
 
 		 310 aa  277  2e-73  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0086  PfkB domain protein  47.56 
 
 		 310 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3887  PfkB domain protein  47.56 
 
 		 310 aa  273  2.0000000000000002e-72  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0101  ribokinase-like domain-containing protein  45.83 
 
 		 314 aa  270  2.9999999999999997e-71  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4070  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  45.83 
 
 		 314 aa  270  2.9999999999999997e-71  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.254909 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4062  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  45.83 
 
 		 314 aa  270  2.9999999999999997e-71  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3923  2-keto-3-deoxygluconate kinase  45.78 
 
 		 309 aa  268  7e-71  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3006  ribokinase-like domain-containing protein  46.45 
 
 		 325 aa  266  4e-70  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000170854 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4750  ribokinase-like domain-containing protein  45.6 
 
 		 310 aa  265  7e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03374  ketodeoxygluconokinase  46.13 
 
 		 309 aa  263  2e-69  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0187  PfkB domain protein  46.13 
 
 		 309 aa  263  2e-69  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0191  ribokinase-like domain-containing protein  46.13 
 
 		 309 aa  263  2e-69  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3729  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  46.13 
 
 		 309 aa  263  2e-69  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03327  hypothetical protein  46.13 
 
 		 309 aa  263  2e-69  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3831  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  46.13 
 
 		 309 aa  263  2e-69  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.15496 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4014  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  46.13 
 
 		 309 aa  263  3e-69  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3932  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  46.13 
 
 		 309 aa  263  3e-69  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4890  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  45.98 
 
 		 309 aa  262  6e-69  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.327816  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4075  PfkB domain protein  43.97 
 
 		 310 aa  257  1e-67  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3280  2-keto-3-deoxygluconate kinase  41.83 
 
 		 312 aa  257  2e-67  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.3989  normal  0.0530742 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0130  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  43.17 
 
 		 322 aa  255  7e-67  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.760619 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06349  hypothetical protein  46.01 
 
 		 314 aa  251  1e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1308  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  42.81 
 
 		 331 aa  248  1e-64  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000271255  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1665  ribokinase-like domain-containing protein  50.17 
 
 		 311 aa  246  3e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.304244  normal  0.0158043 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0939  2-keto-3-deoxygluconate kinase  45.42 
 
 		 318 aa  245  8e-64  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000170609  hitchhiker  0.00670311 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1367  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  42.47 
 
 		 309 aa  244  9.999999999999999e-64  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000226917  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0260  2-keto-3-deoxygluconate kinase  42.91 
 
 		 325 aa  231  1e-59  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1890  2-keto-3-deoxygluconate kinase  42.52 
 
 		 309 aa  224  1e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0103461  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3673  2-keto-3-deoxygluconate kinase  43.75 
 
 		 290 aa  218  1e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.151137  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0858  2-dehydro-3-deoxygluconokinase, putative  42.38 
 
 		 305 aa  209  6e-53  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.341435  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0849  putative 2-dehydro-3-deoxygluconokinase  42.05 
 
 		 305 aa  207  1e-52  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2656  2-keto-3-deoxygluconate kinase  38.13 
 
 		 312 aa  205  1e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000000000013903  normal  0.883759 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3657  PfkB  36.49 
 
 		 307 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5084  ribokinase-like domain-containing protein  40.79 
 
 		 311 aa  199  5e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.599555  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04804  sugar kinase  42.52 
 
 		 258 aa  199  7e-50  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3107  ribokinase-like domain-containing protein  37.33 
 
 		 313 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2368  ribokinase-like domain-containing protein  40.26 
 
 		 305 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3109  PfkB domain protein  38.61 
 
 		 306 aa  197  3e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.205766  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3890  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  39.93 
 
 		 304 aa  196  5.000000000000001e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.413281  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2477  ribokinase-like domain-containing protein  38.36 
 
 		 325 aa  195  6e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000321874 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2141  ribokinase-like domain-containing protein  43.48 
 
 		 302 aa  195  9e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.117677  normal  0.398688 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3864  2-keto-3-deoxygluconate kinase  38.67 
 
 		 295 aa  195  9e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0735701 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2840  PfkB domain protein  38.74 
 
 		 306 aa  186  5e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2574  2-keto-3-deoxygluconate kinase  38.49 
 
 		 299 aa  184  2.0000000000000003e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.751635  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0836  PfkB  36.84 
 
 		 315 aa  181  2e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.252584  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2321  ribokinase-like domain-containing protein  36.75 
 
 		 310 aa  180  2.9999999999999997e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.96044 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2414  ribokinase-like domain-containing protein  43.33 
 
 		 302 aa  179  4e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.322028  normal  0.348643 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5059  ribokinase-like domain-containing protein  39.2 
 
 		 305 aa  175  9.999999999999999e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.542139 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1969  PfkB  31.86 
 
 		 318 aa  171  2e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.151768  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1857  ribokinase-like domain-containing protein  38.74 
 
 		 297 aa  165  1.0000000000000001e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.96427  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4495  2-keto-3-deoxygluconate kinase  37.92 
 
 		 304 aa  159  6e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.964854  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0490  2-keto-3-deoxygluconate kinase  43.31 
 
 		 250 aa  155  6e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0275  PfkB domain-containing protein  36.72 
 
 		 312 aa  155  6e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0115  PfkB domain protein  27.8 
 
 		 313 aa  123  4e-27  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2438  PfkB domain protein  32.99 
 
 		 323 aa  122  5e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2753  PfkB  33.22 
 
 		 308 aa  122  7e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.116104  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05074  putative fructokinase-like protein (sugar kinase)  32.48 
 
 		 309 aa  121  9.999999999999999e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4023  PfkB  31.01 
 
 		 311 aa  119  4.9999999999999996e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.102186  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4198  PfkB domain protein  31.14 
 
 		 308 aa  119  4.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4308  PfkB domain protein  31.14 
 
 		 308 aa  119  4.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.600778  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4769  2-Keto-3-deoxygluconate kinase  30.22 
 
 		 311 aa  117  3e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1489  ribokinase-like domain-containing protein  31.86 
 
 		 308 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.538606  normal  0.0997526 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3217  PfkB domain protein  27.51 
 
 		 312 aa  115  8.999999999999998e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5081  ribokinase family sugar kinase  29.83 
 
 		 308 aa  113  5e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.89362  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2566  ribokinase-like domain-containing protein  30.27 
 
 		 316 aa  110  3e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.255946  normal  0.104834 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6298  PfkB  29.83 
 
 		 308 aa  109  6e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1781  ribokinase-like domain-containing protein  29.83 
 
 		 308 aa  109  6e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.630486  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1806  ribokinase-like domain-containing protein  29.83 
 
 		 308 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.420282 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4283  aminoimidazole riboside kinase  26.38 
 
 		 319 aa  108  9.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1721  ribokinase-like domain-containing protein  29.83 
 
 		 308 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5091  PfkB  29.71 
 
 		 309 aa  108  1e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.170499  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2278  PfkB domain protein  27.33 
 
 		 327 aa  108  1e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.741137  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4464  aminoimidazole riboside kinase  26.06 
 
 		 319 aa  107  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.680577  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4395  aminoimidazole riboside kinase  26.86 
 
 		 319 aa  107  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4397  aminoimidazole riboside kinase  26.06 
 
 		 319 aa  107  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0949  ribokinase-like domain-containing protein  30.67 
 
 		 301 aa  106  5e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.206012 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1694  ribokinase-like domain-containing protein  30.41 
 
 		 308 aa  106  5e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1849  PfkB domain protein  29.49 
 
 		 316 aa  105  7e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0541004  normal  0.0446674 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1870  PfkB domain protein  30.34 
 
 		 315 aa  105  1e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0114143  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1996  PfkB family kinase  30.34 
 
 		 315 aa  105  1e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2260  carbohydrate kinase  29.67 
 
 		 308 aa  105  1e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.11211  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0936  PfkB  29.73 
 
 		 308 aa  104  2e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0963  PfkB  29.73 
 
 		 308 aa  104  2e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.371081  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3592  PfkB domain protein  27.27 
 
 		 311 aa  104  2e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0720957  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2905  aminoimidazole riboside kinase  27.72 
 
 		 306 aa  104  2e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00998461  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4312  aminoimidazole riboside kinase  25.73 
 
 		 319 aa  104  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1860  ribokinase-like domain-containing protein  30.34 
 
 		 315 aa  104  2e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.335723  decreased coverage  0.00000390561 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0369  ribokinase-like domain-containing protein  26.39 
 
 		 322 aa  103  3e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1419  PfkB family kinase  29.96 
 
 		 315 aa  103  3e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.997387  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2380  ribokinase-like domain-containing protein  29.43 
 
 		 316 aa  103  4e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>