More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_3923 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_3923  ribokinase-like domain-containing protein  100 
 
 		 314 aa  625  1e-178  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3222  ribokinase-like domain-containing protein  92.04 
 
 		 314 aa  576  1.0000000000000001e-163  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.830633  normal  0.0230782 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3467  ribokinase-like domain-containing protein  50.8 
 
 		 312 aa  293  2e-78  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0258  ribokinase-like domain-containing protein  34.72 
 
 		 380 aa  196  3e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1461  kinase yeiC, putative  29.61 
 
 		 321 aa  170  3e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0117652  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1733  PfkB family kinase  28.95 
 
 		 321 aa  166  5e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000174723  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1351  ribokinase-like domain-containing protein  30.14 
 
 		 374 aa  157  2e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.759267  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2951  ribokinase-like domain-containing protein  29.79 
 
 		 363 aa  156  4e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0358  PfkB  39.67 
 
 		 377 aa  155  1e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.660775  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3302  hypothetical protein  28.81 
 
 		 313 aa  152  1e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0135155  normal  0.0377447 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2463  hypothetical protein  28.81 
 
 		 313 aa  151  1e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0259659  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2313  hypothetical protein  28.81 
 
 		 313 aa  151  1e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0218939  decreased coverage  0.000211753 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0139  transcriptional regulator, MarR family  29.25 
 
 		 360 aa  150  2e-35  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2725  ribokinase-like domain-containing protein  29.45 
 
 		 363 aa  150  2e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000788266 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1032  ribokinase-like domain-containing protein  28.33 
 
 		 318 aa  150  3e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000268353  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1445  ribokinase-like domain-containing protein  28.42 
 
 		 363 aa  150  3e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4622  ribokinase-like domain-containing protein  36.1 
 
 		 369 aa  149  5e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0428968  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02095  predicted kinase  28.14 
 
 		 313 aa  149  8e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.308891  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1482  hypothetical protein  28.14 
 
 		 313 aa  149  8e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0391896  hitchhiker  0.00000306075 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02054  hypothetical protein  28.14 
 
 		 313 aa  149  8e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.272027  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2303  hypothetical protein  28.14 
 
 		 313 aa  149  8e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0379956  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1492  PfkB domain protein  28.47 
 
 		 313 aa  148  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.104134  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1913  PfkB domain protein  26.1 
 
 		 363 aa  144  3e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.154738  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0555  PfkB domain protein  23.92 
 
 		 306 aa  133  3e-30  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0294  ribokinase-like domain-containing protein  28.06 
 
 		 372 aa  127  2.0000000000000002e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0301  ribokinase-like domain-containing protein  28.06 
 
 		 372 aa  127  2.0000000000000002e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1498  PfkB domain protein  29.66 
 
 		 362 aa  126  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000282324  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2164  PfkB domain protein  31.91 
 
 		 313 aa  125  8.000000000000001e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02089  predicted kinase  28.97 
 
 		 362 aa  123  4e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.114091  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0806  hypothetical protein  28.97 
 
 		 362 aa  123  4e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02048  hypothetical protein  28.97 
 
 		 362 aa  123  4e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0826049  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1488  hypothetical protein  28.97 
 
 		 362 aa  123  4e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000467798  hitchhiker  0.00751025 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2296  hypothetical protein  28.97 
 
 		 362 aa  123  4e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3296  hypothetical protein  28.28 
 
 		 362 aa  120  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.170772  normal  0.250376 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2307  hypothetical protein  28.28 
 
 		 362 aa  119  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.945779  hitchhiker  0.00150581 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1959  PfkB domain protein  29.08 
 
 		 314 aa  119  7.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.13744 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0899  ribokinase-like domain-containing protein  26.56 
 
 		 307 aa  115  1.0000000000000001e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3179  ribokinase  29.12 
 
 		 303 aa  105  8e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1368  ribokinase  29.8 
 
 		 305 aa  104  2e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.176905  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3580  ribokinase  28.86 
 
 		 303 aa  100  2e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0663  PfkB domain protein  22.19 
 
 		 315 aa  101  2e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3771  ribokinase  28.31 
 
 		 303 aa  100  3e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0659  ribokinase  28.31 
 
 		 303 aa  100  3e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2170  PfkB domain protein  27.6 
 
 		 314 aa  99.8  5e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.68008  normal  0.0885177 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0344  ribokinase  27.54 
 
 		 308 aa  98.6  1e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3648  ribokinase  28.05 
 
 		 303 aa  97.8  2e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.16351  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0317  kinase, PfkB family  24.45 
 
 		 382 aa  95.1  1e-18  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.196123 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0162  ribokinase  27.12 
 
 		 309 aa  95.1  1e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0865  ribokinase  29.59 
 
 		 305 aa  93.6  3e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.657252 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0200  ribokinase  30 
 
 		 313 aa  94  3e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.933367 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0749  ribokinase  26.79 
 
 		 306 aa  92.4  8e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00000000720941  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1960  ribokinase  30.8 
 
 		 302 aa  92  1e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0122509  normal  0.0586965 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2559  carbohydrate kinase  27.87 
 
 		 321 aa  91.3  2e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.270626  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0810  ribokinase  26.84 
 
 		 303 aa  90.9  3e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3307  ribokinase  27.17 
 
 		 303 aa  90.5  3e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0646  ribokinase  27.17 
 
 		 303 aa  90.5  3e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.497411 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0518  ribokinase  29.57 
 
 		 307 aa  90.5  4e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2458  ribokinase  30.24 
 
 		 302 aa  89.7  6e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3232  ribokinase  30.58 
 
 		 302 aa  89.7  6e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.493529  normal  0.585828 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1980  ribokinase  28 
 
 		 302 aa  89.4  7e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3477  ribokinase  27.27 
 
 		 303 aa  88.2  1e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1119  ribokinase  27.12 
 
 		 302 aa  87.8  2e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.970785  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3488  ribokinase  29.9 
 
 		 302 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.232463  normal  0.188896 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3869  ribokinase  28.57 
 
 		 299 aa  87.4  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.559054 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03638  ribokinase  27.16 
 
 		 309 aa  86.3  7e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00223583  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03583  hypothetical protein  27.16 
 
 		 309 aa  86.3  7e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00147711  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4120  ribokinase  27.16 
 
 		 314 aa  85.9  8e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.444588  normal  0.199768 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3342  ribokinase  28.29 
 
 		 308 aa  85.9  9e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.133779  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4242  ribokinase  27.16 
 
 		 309 aa  85.5  0.000000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.459204  hitchhiker  0.00710658 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4215  ribokinase  27.16 
 
 		 309 aa  85.5  0.000000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3968  ribokinase  27.16 
 
 		 309 aa  85.5  0.000000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.112559  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4268  ribokinase  27.16 
 
 		 309 aa  85.5  0.000000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00050994  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5188  ribokinase  27.16 
 
 		 314 aa  85.5  0.000000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.034479  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4167  ribokinase  27.16 
 
 		 309 aa  85.5  0.000000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.895072  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17480  sugar kinase, ribokinase  25.85 
 
 		 304 aa  85.5  0.000000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.402042  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4640  ribokinase  29.57 
 
 		 305 aa  84.7  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.162899  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3350  hypothetical protein  29.7 
 
 		 315 aa  84.3  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.373497 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4182  ribokinase  27.07 
 
 		 306 aa  83.6  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4124  ribokinase  27.07 
 
 		 306 aa  83.6  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4074  ribokinase  27.07 
 
 		 306 aa  83.6  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.532803  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4003  ribokinase  27.07 
 
 		 306 aa  83.6  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4019  ribokinase  27.07 
 
 		 306 aa  83.6  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39280  ribokinase  27.65 
 
 		 308 aa  83.2  0.000000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.145597  normal  0.325767 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3591  rfaE bifunctional protein  29.39 
 
 		 488 aa  83.2  0.000000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00169311  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3974  ribokinase  25.93 
 
 		 308 aa  82.4  0.000000000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00187599  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4097  ribokinase  26.45 
 
 		 309 aa  82  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7623  ribokinase  28.87 
 
 		 308 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.921063  normal  0.354799 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4218  ribokinase  26.45 
 
 		 309 aa  81.6  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.980767 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1282  putative ribokinase  28.82 
 
 		 345 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.331017 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4897  ribokinase  27.24 
 
 		 318 aa  81.6  0.00000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00647815  hitchhiker  0.000000886041 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4277  ribokinase  26.45 
 
 		 309 aa  81.6  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.136431  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4168  ribokinase  26.45 
 
 		 309 aa  81.6  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0404  ribokinase  25.68 
 
 		 307 aa  81.6  0.00000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000422627  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0253  ribokinase  27.45 
 
 		 304 aa  81.3  0.00000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0225  ribokinase  28.63 
 
 		 317 aa  81.6  0.00000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4112  ribokinase  27.57 
 
 		 309 aa  81.6  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3196  ribokinase  25.93 
 
 		 316 aa  80.9  0.00000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.20247  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0259  ribokinase  27.45 
 
 		 304 aa  81.3  0.00000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0007  ribokinase  28.69 
 
 		 306 aa  80.9  0.00000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.328015  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2451  ribokinase  28.07 
 
 		 344 aa  80.5  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.909418  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>