More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_39280 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_39280  ribokinase  100 
 
 		 308 aa  604  9.999999999999999e-173  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.145597  normal  0.325767 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3342  ribokinase  97.4 
 
 		 308 aa  590  1e-168  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.133779  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1960  ribokinase  67 
 
 		 302 aa  385  1e-106  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0122509  normal  0.0586965 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2155  carbohydrate kinase, PfkB  64.9 
 
 		 306 aa  380  1e-104  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00604172  normal  0.881399 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1923  ribokinase  65.78 
 
 		 305 aa  376  1e-103  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.254632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3232  ribokinase  65.33 
 
 		 302 aa  372  1e-102  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.493529  normal  0.585828 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3488  ribokinase  64.33 
 
 		 302 aa  369  1e-101  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.232463  normal  0.188896 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2458  ribokinase  64 
 
 		 302 aa  367  1e-100  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2371  ribokinase  66.11 
 
 		 306 aa  351  1e-95  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0559074  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0576  putative ribokinase  59.34 
 
 		 312 aa  335  7.999999999999999e-91  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.588326 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4160  ribokinase  58.75 
 
 		 310 aa  334  1e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.233177 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4749  ribokinase  60.74 
 
 		 309 aa  331  9e-90  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.396985 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1233  ribokinase  62.75 
 
 		 309 aa  325  8.000000000000001e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.567948  normal  0.0906963 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1130  ribokinase  60.74 
 
 		 311 aa  322  6e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1507  ribokinase  59.06 
 
 		 308 aa  322  6e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1610  ribokinase  60.74 
 
 		 311 aa  322  6e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.231434  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1526  ribokinase  58.72 
 
 		 308 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.395922  normal  0.909431 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1587  ribokinase  60.4 
 
 		 311 aa  318  7.999999999999999e-86  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.338475  normal  0.646425 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1627  ribokinase  59.93 
 
 		 310 aa  300  3e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1013  putative ribokinase protein  55.7 
 
 		 315 aa  294  1e-78  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.340196  normal  0.195927 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0943  ribokinase  57.72 
 
 		 321 aa  288  9e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.826251  normal  0.172047 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0878  ribokinase  57.05 
 
 		 321 aa  288  1e-76  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0605401  normal  0.165576 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1871  ribokinase  59.87 
 
 		 324 aa  282  4.0000000000000003e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.215166  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2471  ribokinase  58.28 
 
 		 297 aa  281  1e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1858  ribokinase  59.53 
 
 		 324 aa  280  3e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1383  ribokinase  56.25 
 
 		 309 aa  277  2e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1343  ribokinase  56.11 
 
 		 309 aa  276  3e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3225  ribokinase  44.52 
 
 		 311 aa  267  2e-70  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.195342  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2023  ribokinase  58.25 
 
 		 297 aa  265  5e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0518  ribokinase  44.59 
 
 		 307 aa  259  4e-68  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2526  ribokinase  46.69 
 
 		 301 aa  253  2.0000000000000002e-66  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0344  ribokinase  46.38 
 
 		 308 aa  252  5.000000000000001e-66  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7623  ribokinase  54.97 
 
 		 308 aa  251  7e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.921063  normal  0.354799 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4591  ribokinase  50.52 
 
 		 295 aa  249  5e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1368  ribokinase  47.51 
 
 		 305 aa  248  8e-65  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.176905  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3869  ribokinase  47.32 
 
 		 299 aa  245  6.999999999999999e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.559054 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000338  ribokinase  46.05 
 
 		 305 aa  241  7.999999999999999e-63  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0162  ribokinase  41.53 
 
 		 309 aa  241  1e-62  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6608  ribokinase  54.03 
 
 		 308 aa  238  9e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.487327  normal  0.393887 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0007  ribokinase  45.7 
 
 		 306 aa  238  1e-61  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.328015  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06142  ribokinase  45.85 
 
 		 305 aa  238  1e-61  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5761  ribokinase  53.85 
 
 		 308 aa  237  2e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6126  ribokinase  53.85 
 
 		 308 aa  237  2e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.425434 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3974  ribokinase  44.41 
 
 		 308 aa  236  4e-61  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00187599  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4234  ribokinase  45.51 
 
 		 308 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000102528  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3765  ribokinase  50.51 
 
 		 304 aa  233  2.0000000000000002e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0637373 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3631  ribokinase  42.52 
 
 		 304 aa  233  3e-60  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2909  ribokinase  49.34 
 
 		 302 aa  233  4.0000000000000004e-60  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0179509 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1884  ribokinase  40.91 
 
 		 310 aa  232  6e-60  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0118065  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0225  ribokinase  43.12 
 
 		 317 aa  231  8.000000000000001e-60  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2689  ribokinase  39.24 
 
 		 345 aa  231  9e-60  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1603  ribokinase  40.58 
 
 		 310 aa  231  1e-59  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0000677641  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6290  ribokinase  46.67 
 
 		 320 aa  231  1e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.631078 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3477  ribokinase  45.21 
 
 		 303 aa  231  1e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1539  ribokinase  46.33 
 
 		 320 aa  230  3e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.385923  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0008  ribokinase  44.52 
 
 		 308 aa  229  4e-59  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000914124  normal  0.985734 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4524  ribokinase  44.74 
 
 		 308 aa  229  4e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00216955  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0749  ribokinase  40.67 
 
 		 306 aa  229  4e-59  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00000000720941  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0008  ribokinase  44.52 
 
 		 308 aa  229  4e-59  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0252287  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4209  ribokinase  44.52 
 
 		 308 aa  229  5e-59  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.847437  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3280  ribokinase  49.83 
 
 		 305 aa  229  6e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4640  ribokinase  45.42 
 
 		 305 aa  228  7e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.162899  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4019  ribokinase  41.86 
 
 		 306 aa  228  1e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4124  ribokinase  41.86 
 
 		 306 aa  228  1e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4003  ribokinase  41.86 
 
 		 306 aa  228  1e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4074  ribokinase  41.86 
 
 		 306 aa  228  1e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.532803  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4182  ribokinase  41.86 
 
 		 306 aa  228  1e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04580  Ribokinase  38.74 
 
 		 306 aa  226  3e-58  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0556  ribokinase family sugar kinase  38.69 
 
 		 308 aa  225  7e-58  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.987541  hitchhiker  0.0000000000000234776 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0354  ribokinase  44.69 
 
 		 308 aa  223  3e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4897  ribokinase  45.3 
 
 		 318 aa  222  7e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00647815  hitchhiker  0.000000886041 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4171  ribokinase  44.85 
 
 		 310 aa  221  9.999999999999999e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000241058  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3307  ribokinase  43.56 
 
 		 303 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0646  ribokinase  43.56 
 
 		 303 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.497411 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3167  ribokinase  44.74 
 
 		 295 aa  220  3e-56  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3580  ribokinase  43.19 
 
 		 303 aa  218  1e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3350  hypothetical protein  48.31 
 
 		 315 aa  218  1e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.373497 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3332  ribokinase  45.1 
 
 		 297 aa  217  2e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6906  ribokinase  46 
 
 		 328 aa  217  2e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.135806  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3648  ribokinase  42.86 
 
 		 303 aa  217  2e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.16351  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3771  ribokinase  43.19 
 
 		 303 aa  216  2.9999999999999998e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0659  ribokinase  43.19 
 
 		 303 aa  216  2.9999999999999998e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3179  ribokinase  40.2 
 
 		 303 aa  215  9.999999999999999e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4168  ribokinase  46.2 
 
 		 309 aa  213  2.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0220  ribokinase  47.54 
 
 		 305 aa  213  2.9999999999999995e-54  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.328501  normal  0.180212 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4112  ribokinase  46.2 
 
 		 309 aa  213  2.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4218  ribokinase  46.2 
 
 		 309 aa  213  2.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.980767 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4277  ribokinase  46.2 
 
 		 309 aa  213  2.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.136431  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6950  ribokinase  46.67 
 
 		 308 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1183  ribokinase  44.67 
 
 		 310 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.451251  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1257  ribokinase  44.67 
 
 		 310 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4097  ribokinase  46.2 
 
 		 309 aa  213  4.9999999999999996e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2451  ribokinase  44.67 
 
 		 344 aa  212  4.9999999999999996e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.909418  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1554  ribokinase  44.33 
 
 		 310 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4120  ribokinase  45 
 
 		 314 aa  212  5.999999999999999e-54  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.444588  normal  0.199768 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0252  ribokinase  41.86 
 
 		 307 aa  212  5.999999999999999e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.377165  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03638  ribokinase  45 
 
 		 309 aa  212  7e-54  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00223583  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4268  ribokinase  45 
 
 		 309 aa  212  7e-54  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00050994  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4242  ribokinase  45 
 
 		 309 aa  212  7e-54  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.459204  hitchhiker  0.00710658 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3968  ribokinase  45 
 
 		 309 aa  212  7e-54  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.112559  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>