More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_0899 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010003  Pmob_0899  ribokinase-like domain-containing protein  100 
 
 		 307 aa  610  9.999999999999999e-175  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0258  ribokinase-like domain-containing protein  42.37 
 
 		 380 aa  218  8.999999999999998e-56  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1445  ribokinase-like domain-containing protein  29.57 
 
 		 363 aa  154  2e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1913  PfkB domain protein  32.34 
 
 		 363 aa  146  4.0000000000000006e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.154738  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2951  ribokinase-like domain-containing protein  28.06 
 
 		 363 aa  145  1e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3467  ribokinase-like domain-containing protein  30.13 
 
 		 312 aa  145  1e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1351  ribokinase-like domain-containing protein  28.71 
 
 		 374 aa  142  7e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.759267  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2164  PfkB domain protein  29.47 
 
 		 313 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0555  PfkB domain protein  31.49 
 
 		 306 aa  139  6e-32  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2725  ribokinase-like domain-containing protein  28.66 
 
 		 363 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000788266 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0663  PfkB domain protein  30.07 
 
 		 315 aa  128  1.0000000000000001e-28  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02095  predicted kinase  27.57 
 
 		 313 aa  123  5e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.308891  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2303  hypothetical protein  27.57 
 
 		 313 aa  123  5e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0379956  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02054  hypothetical protein  27.57 
 
 		 313 aa  123  5e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.272027  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1482  hypothetical protein  27.57 
 
 		 313 aa  123  5e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0391896  hitchhiker  0.00000306075 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4622  ribokinase-like domain-containing protein  27.6 
 
 		 369 aa  122  5e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0428968  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3222  ribokinase-like domain-containing protein  26.64 
 
 		 314 aa  122  9.999999999999999e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.830633  normal  0.0230782 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3302  hypothetical protein  27.24 
 
 		 313 aa  120  3e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0135155  normal  0.0377447 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2463  hypothetical protein  27.24 
 
 		 313 aa  120  3e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0259659  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2313  hypothetical protein  27.24 
 
 		 313 aa  120  3e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0218939  decreased coverage  0.000211753 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3923  ribokinase-like domain-containing protein  26.56 
 
 		 314 aa  119  6e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1492  PfkB domain protein  27.24 
 
 		 313 aa  119  7e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.104134  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2307  hypothetical protein  26.07 
 
 		 362 aa  115  6.9999999999999995e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.945779  hitchhiker  0.00150581 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0139  transcriptional regulator, MarR family  27.87 
 
 		 360 aa  112  6e-24  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1498  PfkB domain protein  25.74 
 
 		 362 aa  112  7.000000000000001e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000282324  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02089  predicted kinase  25.74 
 
 		 362 aa  112  8.000000000000001e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.114091  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1488  hypothetical protein  25.74 
 
 		 362 aa  112  8.000000000000001e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000467798  hitchhiker  0.00751025 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2296  hypothetical protein  25.74 
 
 		 362 aa  112  8.000000000000001e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02048  hypothetical protein  25.74 
 
 		 362 aa  112  8.000000000000001e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0826049  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0806  hypothetical protein  25.74 
 
 		 362 aa  112  8.000000000000001e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3296  hypothetical protein  25.74 
 
 		 362 aa  112  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.170772  normal  0.250376 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1959  PfkB domain protein  25.73 
 
 		 314 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.13744 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0358  PfkB  25.4 
 
 		 377 aa  101  2e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.660775  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2170  PfkB domain protein  24.76 
 
 		 314 aa  99.4  6e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.68008  normal  0.0885177 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0301  ribokinase-like domain-containing protein  26.07 
 
 		 372 aa  95.5  1e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0294  ribokinase-like domain-containing protein  26.07 
 
 		 372 aa  95.5  1e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1461  kinase yeiC, putative  26.13 
 
 		 321 aa  92.8  7e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0117652  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1032  ribokinase-like domain-containing protein  25 
 
 		 318 aa  92.8  7e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000268353  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1733  PfkB family kinase  24.36 
 
 		 321 aa  91.3  2e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000174723  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4641  ribokinase  24.56 
 
 		 298 aa  89.7  5e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.184783  unclonable  5.38833e-26 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0317  kinase, PfkB family  23.2 
 
 		 382 aa  88.2  2e-16  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.196123 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0276  PfkB domain protein  26.96 
 
 		 304 aa  87.8  2e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0697  ribokinase  24.2 
 
 		 298 aa  87  3e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0813613  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0579  ribokinase  25.62 
 
 		 298 aa  86.7  5e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0575  ribokinase  23.84 
 
 		 298 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2559  carbohydrate kinase  21.43 
 
 		 321 aa  84.3  0.000000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.270626  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0794  ribokinase  23.13 
 
 		 298 aa  83.2  0.000000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00121525  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0576  ribokinase  23.49 
 
 		 298 aa  82.8  0.000000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0560  ribokinase  24.2 
 
 		 298 aa  83.2  0.000000000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000679387  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0733  ribokinase  23.49 
 
 		 298 aa  82  0.00000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0722  ribokinase  23.49 
 
 		 298 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.83177e-24 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0632  ribokinase  22.78 
 
 		 298 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0665  ribokinase  22.78 
 
 		 298 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17480  sugar kinase, ribokinase  23.75 
 
 		 304 aa  80.5  0.00000000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.402042  normal  1 
 
 
-
 
NC_006693  CNH02430  conserved hypothetical protein  26.37 
 
 		 759 aa  70.5  0.00000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0162  ribokinase  23.64 
 
 		 309 aa  70.5  0.00000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4749  ribokinase  23.39 
 
 		 309 aa  69.7  0.00000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.396985 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3631  ribokinase  25.34 
 
 		 304 aa  67.8  0.0000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1802  ribokinase family sugar kinase  28.23 
 
 		 306 aa  67.8  0.0000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00331295  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0924  ribokinase-like domain-containing protein  25.89 
 
 		 305 aa  66.6  0.0000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.108155  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2838  fructokinase  23.13 
 
 		 324 aa  65.5  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.050359  normal  0.34699 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3225  ribokinase  25.56 
 
 		 311 aa  65.1  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.195342  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0996  PfkB domain protein  25.08 
 
 		 333 aa  64.3  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0041  ribokinase-like domain-containing protein  24.46 
 
 		 304 aa  65.1  0.000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2919  PfkB  25.39 
 
 		 325 aa  63.5  0.000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000103669  normal  0.041423 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3332  ribokinase  20.91 
 
 		 297 aa  63.5  0.000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1960  ribokinase  23.57 
 
 		 302 aa  63.5  0.000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0122509  normal  0.0586965 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1470  ribokinase-like domain-containing protein  24.12 
 
 		 298 aa  63.5  0.000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3342  ribokinase  23.23 
 
 		 308 aa  63.2  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.133779  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2029  PfkB domain-containing protein  24.83 
 
 		 323 aa  63.2  0.000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.159361  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39280  ribokinase  23.67 
 
 		 308 aa  63.5  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.145597  normal  0.325767 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4043  ribokinase-like domain-containing protein  25.83 
 
 		 303 aa  63.2  0.000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1507  ribokinase  22.41 
 
 		 308 aa  63.2  0.000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39540  sugar kinase, ribokinase  24.02 
 
 		 296 aa  62.8  0.000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.893162 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0869  ribokinase-like domain-containing protein  26.28 
 
 		 290 aa  62.4  0.000000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3488  ribokinase  22.64 
 
 		 302 aa  62.4  0.000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.232463  normal  0.188896 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0005  ribokinase, putative  22.14 
 
 		 313 aa  62  0.00000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0831175  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1025  PfkB domain protein  24.41 
 
 		 333 aa  62  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00743339 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1587  ribokinase  24.16 
 
 		 311 aa  62  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.338475  normal  0.646425 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1264  PfkB  27.75 
 
 		 313 aa  62.4  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0795  PfkB domain protein  27.02 
 
 		 315 aa  61.6  0.00000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4655  ribokinase  26.86 
 
 		 319 aa  62  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.128299  normal  0.557505 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18371  putative carbohydrate kinase  26.15 
 
 		 332 aa  62.4  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.455738  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1233  ribokinase  21.92 
 
 		 309 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.567948  normal  0.0906963 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0646  ribokinase-like domain-containing protein  22.51 
 
 		 328 aa  60.8  0.00000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1435  ribokinase-like domain-containing protein  23.05 
 
 		 293 aa  61.2  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000559808 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1526  ribokinase  22.41 
 
 		 308 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.395922  normal  0.909431 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0386  ribokinase-like domain-containing protein  22.47 
 
 		 302 aa  60.8  0.00000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00477103 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2458  ribokinase  22.64 
 
 		 302 aa  60.8  0.00000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3232  ribokinase  23.31 
 
 		 302 aa  60.5  0.00000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.493529  normal  0.585828 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0367  ribokinase-like domain-containing protein  27 
 
 		 296 aa  60.8  0.00000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000567214 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0225  PfkB domain protein  22.31 
 
 		 319 aa  60.8  0.00000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000145112  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1130  ribokinase  24.16 
 
 		 311 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1610  ribokinase  24.16 
 
 		 311 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.231434  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1140  ribokinase-like domain-containing protein  26.96 
 
 		 274 aa  60.5  0.00000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1117  ribokinase-like domain-containing protein  23.59 
 
 		 305 aa  60.1  0.00000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.145837 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0558  PfkB domain protein  22.11 
 
 		 295 aa  60.5  0.00000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1627  ribokinase  22.14 
 
 		 310 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4447  ribokinase  23.26 
 
 		 334 aa  59.7  0.00000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2110  1-phosphofructokinase  27.27 
 
 		 311 aa  59.7  0.00000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>