More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SaurJH1_0301 on replicon NC_009632
Organism: Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009487  SaurJH9_0294  ribokinase-like domain-containing protein  100 
 
 		 372 aa  771    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0301  ribokinase-like domain-containing protein  100 
 
 		 372 aa  771    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0258  ribokinase-like domain-containing protein  34.08 
 
 		 380 aa  203  3e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1913  PfkB domain protein  33.88 
 
 		 363 aa  197  2.0000000000000003e-49  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.154738  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2164  PfkB domain protein  35.95 
 
 		 313 aa  195  1e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0139  transcriptional regulator, MarR family  30.25 
 
 		 360 aa  172  1e-41  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1445  ribokinase-like domain-containing protein  30.62 
 
 		 363 aa  170  3e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2725  ribokinase-like domain-containing protein  30.51 
 
 		 363 aa  167  2e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000788266 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1351  ribokinase-like domain-containing protein  30.9 
 
 		 374 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.759267  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4622  ribokinase-like domain-containing protein  30.36 
 
 		 369 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0428968  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2951  ribokinase-like domain-containing protein  31.12 
 
 		 363 aa  163  5.0000000000000005e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0358  PfkB  31.68 
 
 		 377 aa  152  7e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.660775  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1498  PfkB domain protein  31.02 
 
 		 362 aa  141  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000282324  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02089  predicted kinase  31.02 
 
 		 362 aa  140  3e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.114091  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2296  hypothetical protein  31.02 
 
 		 362 aa  140  3e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02048  hypothetical protein  31.02 
 
 		 362 aa  140  3e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0826049  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1488  hypothetical protein  31.02 
 
 		 362 aa  140  3e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000467798  hitchhiker  0.00751025 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0806  hypothetical protein  31.02 
 
 		 362 aa  140  3e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2307  hypothetical protein  31.02 
 
 		 362 aa  140  3e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.945779  hitchhiker  0.00150581 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3467  ribokinase-like domain-containing protein  29.03 
 
 		 312 aa  139  7.999999999999999e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3296  hypothetical protein  30.42 
 
 		 362 aa  138  2e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.170772  normal  0.250376 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3222  ribokinase-like domain-containing protein  28.39 
 
 		 314 aa  132  6.999999999999999e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.830633  normal  0.0230782 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0317  kinase, PfkB family  26.82 
 
 		 382 aa  131  2.0000000000000002e-29  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.196123 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3923  ribokinase-like domain-containing protein  28.06 
 
 		 314 aa  127  3e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1959  PfkB domain protein  27.78 
 
 		 314 aa  123  4e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.13744 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0555  PfkB domain protein  25.97 
 
 		 306 aa  122  9.999999999999999e-27  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2559  carbohydrate kinase  27.92 
 
 		 321 aa  122  9.999999999999999e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.270626  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02095  predicted kinase  29.63 
 
 		 313 aa  119  9.999999999999999e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.308891  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02054  hypothetical protein  29.63 
 
 		 313 aa  119  9.999999999999999e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.272027  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1482  hypothetical protein  29.63 
 
 		 313 aa  119  9.999999999999999e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0391896  hitchhiker  0.00000306075 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2303  hypothetical protein  29.63 
 
 		 313 aa  119  9.999999999999999e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0379956  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1492  PfkB domain protein  29.26 
 
 		 313 aa  118  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.104134  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1032  ribokinase-like domain-containing protein  28.86 
 
 		 318 aa  117  3e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000268353  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2463  hypothetical protein  29.26 
 
 		 313 aa  117  3e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0259659  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2170  PfkB domain protein  27.3 
 
 		 314 aa  117  3e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.68008  normal  0.0885177 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2313  hypothetical protein  29.26 
 
 		 313 aa  117  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0218939  decreased coverage  0.000211753 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3302  hypothetical protein  28.89 
 
 		 313 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0135155  normal  0.0377447 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1733  PfkB family kinase  28.38 
 
 		 321 aa  109  9.000000000000001e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000174723  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1461  kinase yeiC, putative  28.04 
 
 		 321 aa  107  3e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0117652  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0663  PfkB domain protein  25.67 
 
 		 315 aa  95.1  2e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0899  ribokinase-like domain-containing protein  26.07 
 
 		 307 aa  88.2  2e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0518  ribokinase  26.34 
 
 		 307 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1264  PfkB  25.68 
 
 		 313 aa  81.3  0.00000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0008  ribokinase  24.17 
 
 		 308 aa  75.9  0.0000000000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000914124  normal  0.985734 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0008  ribokinase  24.17 
 
 		 308 aa  75.9  0.0000000000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0252287  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4209  ribokinase  24.17 
 
 		 308 aa  75.9  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.847437  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17480  sugar kinase, ribokinase  24.62 
 
 		 304 aa  73.9  0.000000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.402042  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03638  ribokinase  25 
 
 		 309 aa  72  0.00000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00223583  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4215  ribokinase  25.11 
 
 		 309 aa  72.4  0.00000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03583  hypothetical protein  25 
 
 		 309 aa  72  0.00000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00147711  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4120  ribokinase  25 
 
 		 314 aa  72.4  0.00000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.444588  normal  0.199768 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3307  ribokinase  27.64 
 
 		 303 aa  72.8  0.00000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0646  ribokinase  27.64 
 
 		 303 aa  72.8  0.00000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.497411 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4897  ribokinase  25.51 
 
 		 318 aa  71.6  0.00000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00647815  hitchhiker  0.000000886041 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3968  ribokinase  25 
 
 		 309 aa  71.6  0.00000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.112559  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5188  ribokinase  25 
 
 		 314 aa  72  0.00000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.034479  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4167  ribokinase  25 
 
 		 309 aa  71.6  0.00000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.895072  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4242  ribokinase  25 
 
 		 309 aa  71.6  0.00000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.459204  hitchhiker  0.00710658 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4268  ribokinase  25 
 
 		 309 aa  71.6  0.00000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00050994  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0404  ribokinase  26.59 
 
 		 307 aa  71.2  0.00000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000422627  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1434  ribokinase-like domain-containing protein  26.5 
 
 		 295 aa  71.2  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00349214 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1011  ribokinase-like domain-containing protein  26.43 
 
 		 398 aa  69.3  0.0000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39280  ribokinase  25.21 
 
 		 308 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.145597  normal  0.325767 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4168  ribokinase  25.96 
 
 		 309 aa  69.3  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4218  ribokinase  25.96 
 
 		 309 aa  69.3  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.980767 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4277  ribokinase  25.96 
 
 		 309 aa  69.3  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.136431  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01230  fructokinase  26.41 
 
 		 311 aa  68.6  0.0000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.826599  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4112  ribokinase  25.96 
 
 		 309 aa  68.6  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3477  ribokinase  26.55 
 
 		 303 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3342  ribokinase  25.21 
 
 		 308 aa  67.8  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.133779  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4097  ribokinase  25.53 
 
 		 309 aa  67  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4074  ribokinase  22.27 
 
 		 306 aa  66.6  0.0000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.532803  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4182  ribokinase  22.27 
 
 		 306 aa  66.6  0.0000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4019  ribokinase  22.27 
 
 		 306 aa  66.6  0.0000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4124  ribokinase  22.27 
 
 		 306 aa  66.6  0.0000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4003  ribokinase  22.27 
 
 		 306 aa  66.6  0.0000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1285  ribokinase  25.19 
 
 		 307 aa  66.2  0.0000000009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000150833  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04580  Ribokinase  26.55 
 
 		 306 aa  65.9  0.000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3217  PfkB domain protein  25.89 
 
 		 312 aa  65.5  0.000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18220  Fructokinase  29.1 
 
 		 320 aa  65.9  0.000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.749798  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4234  ribokinase  23.73 
 
 		 308 aa  65.9  0.000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000102528  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0344  ribokinase  24.44 
 
 		 308 aa  65.9  0.000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0162  ribokinase  26.55 
 
 		 309 aa  65.1  0.000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4591  ribokinase  23.08 
 
 		 295 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1264  hypothetical protein  32.26 
 
 		 321 aa  63.9  0.000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4524  ribokinase  23.31 
 
 		 308 aa  63.5  0.000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00216955  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2283  ribokinase  22.85 
 
 		 310 aa  62.4  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.269259 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1509  ribokinase-like domain-containing protein  26.28 
 
 		 294 aa  62.4  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0113854 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0300  ribokinase family sugar kinase  27.8 
 
 		 320 aa  62.8  0.00000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.750208  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4122  PfkB  24.83 
 
 		 320 aa  61.6  0.00000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3738  ribokinase  25.94 
 
 		 404 aa  61.2  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3749  ribokinase  25.94 
 
 		 404 aa  61.2  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3859  ribokinase  25.94 
 
 		 404 aa  61.2  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3974  ribokinase  22.98 
 
 		 308 aa  60.8  0.00000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00187599  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1612  ribokinase family sugar kinase  25 
 
 		 340 aa  60.8  0.00000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0874983  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3816  ribokinase  25.94 
 
 		 404 aa  61.2  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0869  ribokinase-like domain-containing protein  24.64 
 
 		 290 aa  60.5  0.00000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0943  ribokinase  23.63 
 
 		 321 aa  60.5  0.00000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.826251  normal  0.172047 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0632  ribokinase  26.18 
 
 		 298 aa  59.7  0.00000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0665  ribokinase  26.18 
 
 		 298 aa  59.7  0.00000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>