More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_0300 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010816  BLD_0300  ribokinase family sugar kinase  100 
 
 		 320 aa  647    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.750208  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1334  putative ribokinase  52.47 
 
 		 353 aa  325  5e-88  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.588315 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0083  ribokinase-like domain-containing protein  47.15 
 
 		 324 aa  231  1e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0187  PfkB domain protein  47.35 
 
 		 327 aa  220  3e-56  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2012  PfkB domain protein  48.03 
 
 		 320 aa  207  3e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0768209  hitchhiker  0.000616715 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3342  ribokinase  39.46 
 
 		 308 aa  189  5e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.133779  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3225  ribokinase  36.27 
 
 		 311 aa  188  8e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.195342  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39280  ribokinase  38.8 
 
 		 308 aa  189  8e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.145597  normal  0.325767 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1368  ribokinase  34.98 
 
 		 305 aa  179  5.999999999999999e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.176905  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0576  putative ribokinase  38.41 
 
 		 312 aa  177  3e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.588326 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0949  PfkB  42.28 
 
 		 301 aa  175  9.999999999999999e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4160  ribokinase  38.08 
 
 		 310 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.233177 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39540  sugar kinase, ribokinase  40.13 
 
 		 296 aa  174  1.9999999999999998e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.893162 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2588  PfkB domain-containing protein  41.3 
 
 		 311 aa  173  3.9999999999999995e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.02383  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04580  Ribokinase  34.44 
 
 		 306 aa  172  5e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0007  ribokinase  35.2 
 
 		 306 aa  172  7.999999999999999e-42  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.328015  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03638  ribokinase  36.18 
 
 		 309 aa  171  2e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00223583  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4120  ribokinase  36.18 
 
 		 314 aa  170  2e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.444588  normal  0.199768 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03583  hypothetical protein  36.18 
 
 		 309 aa  171  2e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00147711  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0865  ribokinase  36.86 
 
 		 305 aa  170  2e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.657252 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4242  ribokinase  36.18 
 
 		 309 aa  170  3e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.459204  hitchhiker  0.00710658 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4268  ribokinase  36.18 
 
 		 309 aa  170  3e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00050994  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3968  ribokinase  36.18 
 
 		 309 aa  170  3e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.112559  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5188  ribokinase  36.18 
 
 		 314 aa  170  4e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.034479  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1402  ribokinase  42.3 
 
 		 318 aa  169  5e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0972031 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0344  ribokinase  33.99 
 
 		 308 aa  169  8e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2100  ribokinase  36.16 
 
 		 307 aa  168  1e-40  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000338  ribokinase  34.54 
 
 		 305 aa  168  1e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4167  ribokinase  35.86 
 
 		 309 aa  168  1e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.895072  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4112  ribokinase  36.93 
 
 		 309 aa  168  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4215  ribokinase  35.86 
 
 		 309 aa  167  2e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1013  putative ribokinase protein  36.39 
 
 		 315 aa  167  2e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.340196  normal  0.195927 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01080  sugar kinase, ribokinase  38.36 
 
 		 349 aa  167  2e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1960  ribokinase  36.45 
 
 		 302 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0122509  normal  0.0586965 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4218  ribokinase  36.6 
 
 		 309 aa  166  5e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.980767 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2155  carbohydrate kinase, PfkB  35.2 
 
 		 306 aa  166  5e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00604172  normal  0.881399 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4168  ribokinase  36.6 
 
 		 309 aa  166  5e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4277  ribokinase  36.6 
 
 		 309 aa  166  5e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.136431  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4097  ribokinase  36.18 
 
 		 309 aa  164  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0943  ribokinase  37.02 
 
 		 321 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.826251  normal  0.172047 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0200  ribokinase  36.59 
 
 		 313 aa  164  1.0000000000000001e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.933367 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4897  ribokinase  35.18 
 
 		 318 aa  164  2.0000000000000002e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00647815  hitchhiker  0.000000886041 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4209  ribokinase  33.77 
 
 		 308 aa  163  3e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.847437  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0008  ribokinase  33.77 
 
 		 308 aa  163  3e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0252287  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0008  ribokinase  33.77 
 
 		 308 aa  163  3e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000914124  normal  0.985734 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3631  ribokinase  34.22 
 
 		 304 aa  163  4.0000000000000004e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2526  ribokinase  37 
 
 		 301 aa  163  4.0000000000000004e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06142  ribokinase  33.77 
 
 		 305 aa  163  4.0000000000000004e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4171  ribokinase  33.77 
 
 		 310 aa  162  5.0000000000000005e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000241058  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3974  ribokinase  33.77 
 
 		 308 aa  163  5.0000000000000005e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00187599  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3167  ribokinase  36.63 
 
 		 295 aa  162  6e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4112  ribokinase  35.2 
 
 		 314 aa  162  9e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.137764  normal  0.0163752 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3280  ribokinase  36.96 
 
 		 305 aa  161  1e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0069  PfkB domain protein  38.72 
 
 		 299 aa  161  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2909  ribokinase  38.28 
 
 		 302 aa  161  1e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0179509 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4524  ribokinase  34.1 
 
 		 308 aa  161  2e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00216955  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0465  ribokinase  37.04 
 
 		 299 aa  160  2e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4234  ribokinase  33.77 
 
 		 308 aa  160  4e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000102528  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3869  ribokinase  36.3 
 
 		 299 aa  159  6e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.559054 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0162  ribokinase  34.75 
 
 		 309 aa  158  9e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0878  ribokinase  35.57 
 
 		 321 aa  158  1e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0605401  normal  0.165576 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2689  ribokinase  31.07 
 
 		 345 aa  158  1e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0518  ribokinase  33.66 
 
 		 307 aa  158  1e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1383  ribokinase  37.75 
 
 		 309 aa  157  3e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0220  ribokinase  38.36 
 
 		 305 aa  157  3e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.328501  normal  0.180212 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0354  ribokinase  33.99 
 
 		 308 aa  156  3e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1923  ribokinase  36.21 
 
 		 305 aa  156  4e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.254632  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1603  ribokinase  33.01 
 
 		 310 aa  156  4e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0000677641  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1343  ribokinase  38.03 
 
 		 309 aa  156  4e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6290  ribokinase  33.78 
 
 		 320 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.631078 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0053  PfkB domain protein  36.54 
 
 		 299 aa  155  6e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0373513 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1507  ribokinase  37.09 
 
 		 308 aa  155  7e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3332  ribokinase  35.53 
 
 		 297 aa  155  8e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1539  ribokinase  33.78 
 
 		 320 aa  155  8e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.385923  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0252  ribokinase  40.41 
 
 		 307 aa  155  9e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.377165  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1526  ribokinase  37.42 
 
 		 308 aa  155  1e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.395922  normal  0.909431 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2877  ribokinase-like domain-containing protein  38.98 
 
 		 300 aa  154  2e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.98714  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0253  ribokinase  34.11 
 
 		 304 aa  154  2.9999999999999998e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1884  ribokinase  33.01 
 
 		 310 aa  153  2.9999999999999998e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0118065  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0259  ribokinase  34.11 
 
 		 304 aa  154  2.9999999999999998e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1011  ribokinase-like domain-containing protein  32.75 
 
 		 398 aa  152  5e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3570  PfkB  37.54 
 
 		 297 aa  152  5.9999999999999996e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.498935  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2837  ribokinase  36.21 
 
 		 302 aa  152  7e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1285  ribokinase  34.44 
 
 		 307 aa  152  7e-36  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000150833  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0558  PfkB domain protein  34.34 
 
 		 295 aa  152  8e-36  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7070  PfkB domain protein  40.4 
 
 		 283 aa  150  2e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3544  ribokinase-like domain-containing protein  39.18 
 
 		 285 aa  150  2e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.336922  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3488  ribokinase  35.86 
 
 		 302 aa  151  2e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.232463  normal  0.188896 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2283  ribokinase  34.11 
 
 		 310 aa  150  3e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.269259 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4749  ribokinase  36.96 
 
 		 309 aa  150  3e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.396985 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1124  ribokinase  32.4 
 
 		 403 aa  150  3e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3539  PfkB  39.18 
 
 		 285 aa  150  3e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.460191  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3612  ribokinase-like domain-containing protein  39.18 
 
 		 285 aa  150  3e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.388195  normal  0.822465 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2838  ribokinase  34.23 
 
 		 314 aa  150  3e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.760591  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0556  ribokinase family sugar kinase  32.3 
 
 		 308 aa  150  4e-35  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.987541  hitchhiker  0.0000000000000234776 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3232  ribokinase  35.17 
 
 		 302 aa  149  6e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.493529  normal  0.585828 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2458  ribokinase  34.83 
 
 		 302 aa  149  8e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0691  ribokinase family sugar kinase  34.32 
 
 		 303 aa  149  8e-35  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00280887  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1233  ribokinase  37.22 
 
 		 309 aa  148  9e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.567948  normal  0.0906963 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2297  ribokinase  35.16 
 
 		 309 aa  149  9e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0434925  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>