171 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_1264 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_1264  PfkB  100 
 
 		 313 aa  605  9.999999999999999e-173  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1959  PfkB domain protein  46.2 
 
 		 314 aa  240  2.9999999999999997e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.13744 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2170  PfkB domain protein  45.05 
 
 		 314 aa  227  2e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.68008  normal  0.0885177 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2559  carbohydrate kinase  45.95 
 
 		 321 aa  217  2e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.270626  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0139  transcriptional regulator, MarR family  32.17 
 
 		 360 aa  119  4.9999999999999996e-26  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2164  PfkB domain protein  29.64 
 
 		 313 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0258  ribokinase-like domain-containing protein  27.76 
 
 		 380 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2725  ribokinase-like domain-containing protein  29.87 
 
 		 363 aa  108  1e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000788266 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2951  ribokinase-like domain-containing protein  26.85 
 
 		 363 aa  106  7e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0294  ribokinase-like domain-containing protein  25.68 
 
 		 372 aa  99.4  8e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0301  ribokinase-like domain-containing protein  25.68 
 
 		 372 aa  99.4  8e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2463  hypothetical protein  27.21 
 
 		 313 aa  99.4  8e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0259659  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3222  ribokinase-like domain-containing protein  28.77 
 
 		 314 aa  99  9e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.830633  normal  0.0230782 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2313  hypothetical protein  27.21 
 
 		 313 aa  99  9e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0218939  decreased coverage  0.000211753 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3302  hypothetical protein  27.21 
 
 		 313 aa  99  9e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0135155  normal  0.0377447 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02095  predicted kinase  27.7 
 
 		 313 aa  99  1e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.308891  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02054  hypothetical protein  27.7 
 
 		 313 aa  99  1e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.272027  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2303  hypothetical protein  27.7 
 
 		 313 aa  99  1e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0379956  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1482  hypothetical protein  27.7 
 
 		 313 aa  99  1e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0391896  hitchhiker  0.00000306075 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1351  ribokinase-like domain-containing protein  26.26 
 
 		 374 aa  98.2  2e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.759267  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1733  PfkB family kinase  26.28 
 
 		 321 aa  96.3  6e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000174723  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1492  PfkB domain protein  26.87 
 
 		 313 aa  96.3  7e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.104134  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1461  kinase yeiC, putative  25.68 
 
 		 321 aa  94.4  2e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0117652  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1498  PfkB domain protein  29.41 
 
 		 362 aa  92  1e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000282324  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1445  ribokinase-like domain-containing protein  26.26 
 
 		 363 aa  92  1e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3923  ribokinase-like domain-containing protein  27.99 
 
 		 314 aa  92.4  1e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3467  ribokinase-like domain-containing protein  31.19 
 
 		 312 aa  91.7  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02089  predicted kinase  29.41 
 
 		 362 aa  90.9  2e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.114091  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0806  hypothetical protein  29.41 
 
 		 362 aa  90.9  2e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02048  hypothetical protein  29.41 
 
 		 362 aa  90.9  2e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0826049  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3296  hypothetical protein  29.08 
 
 		 362 aa  90.9  2e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.170772  normal  0.250376 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2296  hypothetical protein  29.41 
 
 		 362 aa  90.9  2e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1488  hypothetical protein  29.41 
 
 		 362 aa  90.9  2e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000467798  hitchhiker  0.00751025 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0358  PfkB  33.77 
 
 		 377 aa  89  1e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.660775  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2307  hypothetical protein  28.76 
 
 		 362 aa  87.8  2e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.945779  hitchhiker  0.00150581 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4622  ribokinase-like domain-containing protein  32.73 
 
 		 369 aa  85.1  0.000000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0428968  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1913  PfkB domain protein  24.32 
 
 		 363 aa  84.3  0.000000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.154738  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17480  sugar kinase, ribokinase  27.7 
 
 		 304 aa  80.1  0.00000000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.402042  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0899  ribokinase-like domain-containing protein  23.83 
 
 		 307 aa  77.8  0.0000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1509  ribokinase-like domain-containing protein  35.87 
 
 		 294 aa  77.4  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0113854 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1032  ribokinase-like domain-containing protein  25.17 
 
 		 318 aa  76.3  0.0000000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000268353  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0663  PfkB domain protein  24.44 
 
 		 315 aa  75.1  0.000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0555  PfkB domain protein  21.98 
 
 		 306 aa  73.9  0.000000000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1434  ribokinase-like domain-containing protein  37.68 
 
 		 295 aa  70.5  0.00000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00349214 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3217  PfkB domain protein  27.76 
 
 		 312 aa  65.9  0.0000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6216  carbohydrate kinase PfkB family  36.2 
 
 		 304 aa  64.3  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1011  ribokinase-like domain-containing protein  25.08 
 
 		 398 aa  64.3  0.000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3869  ribokinase  27.46 
 
 		 299 aa  63.5  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.559054 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1124  ribokinase  25.41 
 
 		 403 aa  63.2  0.000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1547  putative carbohydrate kinase  30.77 
 
 		 321 aa  61.6  0.00000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.23954 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2283  ribokinase  26.05 
 
 		 310 aa  60.8  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.269259 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0317  kinase, PfkB family  24.58 
 
 		 382 aa  60.5  0.00000004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.196123 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3342  ribokinase  29.89 
 
 		 308 aa  60.1  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.133779  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0173  PfkB domain protein  28.07 
 
 		 310 aa  59.3  0.00000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00145747  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1960  ribokinase  31.32 
 
 		 302 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0122509  normal  0.0586965 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3407  ribokinase  28.08 
 
 		 424 aa  58.5  0.0000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1812  ribokinase-like domain-containing protein  31.14 
 
 		 301 aa  58.2  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0916129  decreased coverage  0.00793411 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1368  ribokinase  27.11 
 
 		 305 aa  57.8  0.0000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.176905  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39280  ribokinase  29.78 
 
 		 308 aa  57  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.145597  normal  0.325767 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1338  PfkB  30.94 
 
 		 302 aa  56.6  0.0000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4640  ribokinase  28.2 
 
 		 305 aa  56.6  0.0000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.162899  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2307  PfkB  30.03 
 
 		 296 aa  55.5  0.000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.013346  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0996  PfkB domain protein  29.39 
 
 		 298 aa  54.7  0.000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.809854  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1860  ribokinase-like domain-containing protein  27.69 
 
 		 315 aa  54.7  0.000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.335723  decreased coverage  0.00000390561 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1980  ribokinase  25.08 
 
 		 302 aa  53.9  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4160  ribokinase  27.92 
 
 		 310 aa  53.9  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.233177 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01741  predicted kinase  27.59 
 
 		 315 aa  53.9  0.000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2496  kinase, pfkB family  27.52 
 
 		 310 aa  53.9  0.000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01729  hypothetical protein  27.59 
 
 		 315 aa  53.9  0.000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0576  putative ribokinase  28.57 
 
 		 312 aa  53.1  0.000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.588326 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0200  ribokinase  27.47 
 
 		 313 aa  53.1  0.000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.933367 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1085  PfkB domain protein  25.87 
 
 		 294 aa  53.1  0.000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.000428719  normal  0.482766 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1870  PfkB domain protein  27.31 
 
 		 315 aa  52.8  0.000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0114143  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4124  ribokinase  36.67 
 
 		 403 aa  52.8  0.000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1996  PfkB family kinase  27.31 
 
 		 315 aa  52.8  0.000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0534  ribokinase-like domain-containing protein  22.3 
 
 		 293 aa  52.8  0.000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.690237  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1419  PfkB family kinase  26.92 
 
 		 315 aa  52  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.997387  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1923  ribokinase  28.03 
 
 		 305 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.254632  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2121  PfkB  37.5 
 
 		 307 aa  51.2  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.987568  normal  0.281407 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0344  ribokinase  23.67 
 
 		 308 aa  51.6  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1856  PfkB family kinase  26.92 
 
 		 315 aa  51.2  0.00002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0158072  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7361  ribokinase  26.84 
 
 		 308 aa  51.6  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2838  ribokinase  31.62 
 
 		 314 aa  50.8  0.00003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.760591  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0560  ribokinase  26.45 
 
 		 298 aa  50.8  0.00003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000679387  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0733  ribokinase  27.27 
 
 		 298 aa  50.4  0.00004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1755  PfkB domain protein  25.09 
 
 		 304 aa  50.4  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0575  ribokinase  27.27 
 
 		 298 aa  50.1  0.00005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0722  ribokinase  26.86 
 
 		 298 aa  49.7  0.00006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.83177e-24 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0300  ribokinase family sugar kinase  24.73 
 
 		 320 aa  49.7  0.00006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.750208  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0865  ribokinase  24 
 
 		 305 aa  49.3  0.00008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.657252 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7623  ribokinase  27.96 
 
 		 308 aa  48.9  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.921063  normal  0.354799 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2455  PfkB domain-containing protein  28.39 
 
 		 282 aa  48.9  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.287722  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0794  ribokinase  27.27 
 
 		 298 aa  48.9  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00121525  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1201  ribokinase-like domain-containing protein  22.26 
 
 		 298 aa  48.9  0.0001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0349  putative ribokinase  25.37 
 
 		 309 aa  48.5  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4641  ribokinase  26.86 
 
 		 298 aa  48.9  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.184783  unclonable  5.38833e-26 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0632  ribokinase  26.86 
 
 		 298 aa  47.8  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0576  ribokinase  26.86 
 
 		 298 aa  48.1  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0665  ribokinase  26.86 
 
 		 298 aa  47.8  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5471  PfkB domain protein  28.23 
 
 		 324 aa  48.1  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.784292 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>