More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_0173 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011901  Tgr7_0173  PfkB domain protein  100 
 
 
310 aa  645    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00145747  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2067  Adenosine kinase  75.16 
 
 
310 aa  508  1e-143  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2548  carbohydrate kinase, PfkB  70.23 
 
 
310 aa  469  1.0000000000000001e-131  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.636589  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0047  carbohydrate kinase  70.65 
 
 
310 aa  463  1e-129  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1195  ribokinase-like domain-containing protein  62.21 
 
 
316 aa  435  1e-121  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0209  PfkB  61.61 
 
 
311 aa  418  1e-116  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3935  PfkB  62.87 
 
 
310 aa  413  1e-114  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0713343  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0171  carbohydrate kinase  61.61 
 
 
310 aa  412  1e-114  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.150341 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2791  putative sugar kinase transferase protein  60.65 
 
 
311 aa  410  1e-113  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00725009  normal  0.760664 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0207  ribokinase-like domain-containing protein  59.25 
 
 
319 aa  407  1.0000000000000001e-112  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000760585  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04263  sugar kinase  60.71 
 
 
362 aa  402  1e-111  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.383154  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3455  PfkB domain protein  59.42 
 
 
312 aa  403  1e-111  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.327587  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0225  PfkB domain protein  58.31 
 
 
319 aa  397  9.999999999999999e-111  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000145112  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0471  PfkB  60.78 
 
 
320 aa  399  9.999999999999999e-111  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000138593  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2626  PfkB domain protein  59.68 
 
 
311 aa  399  9.999999999999999e-111  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3036  PfkB domain protein  59.35 
 
 
311 aa  396  1e-109  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0530  carbohydrate kinase, PfkB family  58.58 
 
 
313 aa  390  1e-107  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.00148509  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0688  PfkB domain protein  58.58 
 
 
313 aa  390  1e-107  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  unclonable  0.00000000405539  hitchhiker  0.000110738 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2634  ribokinase-like domain-containing protein  59.87 
 
 
314 aa  388  1e-107  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.831919  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2870  PfkB  57.01 
 
 
315 aa  385  1e-106  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0148576  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3069  hypothetical protein  57.96 
 
 
315 aa  387  1e-106  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.795207  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0527  putative sugar kinase transferase, PfkB  57.28 
 
 
312 aa  378  1e-104  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.827149 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1158  ribokinase, putative  56.45 
 
 
312 aa  376  1e-103  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0569  ribokinase-like domain-containing protein  56.27 
 
 
312 aa  375  1e-103  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.561391  decreased coverage  0.0000690864 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3431  PfkB domain protein  57.61 
 
 
312 aa  376  1e-103  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0295739  normal  0.0158701 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0117  adenosine kinase  56.27 
 
 
312 aa  375  1e-103  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0600  adenosine kinase  56.27 
 
 
312 aa  375  1e-103  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.333204  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3506  sugar kinase  56.31 
 
 
312 aa  374  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3683  adenosine kinase  57.23 
 
 
312 aa  373  1e-102  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.235022  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0526  ribokinase-like domain-containing protein  56.27 
 
 
312 aa  372  1e-102  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.846303  normal  0.476119 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3278  putative ribokinase  56.31 
 
 
312 aa  373  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2784  ribokinase-like domain-containing protein  56.59 
 
 
312 aa  372  1e-102  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.417689  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1286  putative ribokinase  56.31 
 
 
312 aa  373  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0502  ribokinase-like domain-containing protein  55.95 
 
 
320 aa  371  1e-102  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3508  PfkB family kinase  56.31 
 
 
312 aa  374  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0427  putative ribokinase  56.31 
 
 
312 aa  373  1e-102  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3470  PfkB family kinase  56.31 
 
 
312 aa  374  1e-102  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.375649  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3450  PfkB domain protein  56.35 
 
 
311 aa  361  7.0000000000000005e-99  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3210  putative sugar kinase transferase protein  55.41 
 
 
301 aa  349  4e-95  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.258809  decreased coverage  0.003878 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3635  ribokinase-like domain-containing protein  52.04 
 
 
298 aa  346  3e-94  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.151802  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3388  ribokinase-like domain-containing protein  55.07 
 
 
307 aa  343  1e-93  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.684995 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2945  PfkB domain protein  51.7 
 
 
298 aa  343  2.9999999999999997e-93  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0861  ribokinase-like domain-containing protein  52.72 
 
 
298 aa  341  9e-93  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.035179  normal  0.0608327 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1103  PfkB  54.95 
 
 
300 aa  341  1e-92  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00948504  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1493  ribokinase-like domain-containing protein  52.04 
 
 
298 aa  340  2e-92  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0386  ribokinase-like domain-containing protein  55.74 
 
 
302 aa  338  8e-92  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00477103 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0953  PfkB domain protein  52.38 
 
 
300 aa  335  7.999999999999999e-91  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.940655  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1498  ribokinase-like domain-containing protein  52.03 
 
 
300 aa  330  2e-89  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2506  ribokinase, putative  54.29 
 
 
283 aa  326  3e-88  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.617052  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2351  ribokinase-like domain-containing protein  44.81 
 
 
318 aa  280  2e-74  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000153207  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0158  ribokinase-like domain-containing protein  42.95 
 
 
327 aa  251  8.000000000000001e-66  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0849672  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3562  PfkB domain protein  42.95 
 
 
324 aa  251  1e-65  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0487  ribokinase-like domain-containing protein  41.16 
 
 
327 aa  246  3e-64  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.518253  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1489  carbohydrate kinase  42.26 
 
 
308 aa  243  3e-63  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00000020351  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2935  PfkB domain protein  42.72 
 
 
308 aa  243  3e-63  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.158693 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0800  ribokinase-like domain-containing protein  39.61 
 
 
312 aa  238  8e-62  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.151496 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2001  ribokinase-like domain-containing protein  41.21 
 
 
308 aa  233  2.0000000000000002e-60  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0769014  normal  0.324635 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0200  PfkB domain protein  40.19 
 
 
318 aa  228  8e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1665  Adenosine kinase  34.49 
 
 
329 aa  205  6e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.237492 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1286  PfkB domain-containing protein  35.5 
 
 
328 aa  204  1e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.324688  normal  0.237222 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2666  PfkB domain protein  34.2 
 
 
328 aa  199  5e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.56784  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27030  sugar kinase, ribokinase  34.42 
 
 
321 aa  197  2.0000000000000003e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.805869  normal  0.364358 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3081  PfkB domain protein  31.87 
 
 
324 aa  196  3e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00739756  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1798  adenosine kinase  32.69 
 
 
326 aa  193  4e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.527553  normal  0.339618 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3120  adenosine kinase  32.37 
 
 
326 aa  192  6e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3063  PfkB domain protein  32.37 
 
 
324 aa  191  1e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.142988  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3300  adenosine kinase  33.97 
 
 
324 aa  190  2e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3311  adenosine kinase  33.97 
 
 
324 aa  190  2e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.353965  normal  0.464112 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3362  adenosine kinase  33.97 
 
 
324 aa  190  2e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0175719 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1012  putative carbohydrate kinase  32.69 
 
 
324 aa  190  2.9999999999999997e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0637666  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3144  ribokinase-like domain-containing protein  33.44 
 
 
327 aa  190  2.9999999999999997e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2947  adenosine kinase  32.69 
 
 
323 aa  189  4e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12230  carbohydrate kinase cbhK  32.69 
 
 
324 aa  189  4e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000000530804  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3294  PfkB domain protein  33.02 
 
 
325 aa  188  1e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.284548  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3257  Adenosine kinase  34.2 
 
 
325 aa  186  5e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00285447  hitchhiker  0.000112709 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0955  ribokinase-like domain-containing protein  32.03 
 
 
339 aa  186  5e-46  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.989352  normal  0.38603 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3566  adenosine kinase  31.73 
 
 
323 aa  182  7e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0415989  normal  0.0392481 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3303  ribokinase-like domain-containing protein  32.17 
 
 
325 aa  181  1e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.121546 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1531  PfkB domain protein  31.76 
 
 
329 aa  174  1.9999999999999998e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0901719  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3535  ribokinase-like domain-containing protein  31.09 
 
 
325 aa  174  1.9999999999999998e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.32323  decreased coverage  0.000219352 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3153  Adenosine kinase  30.13 
 
 
323 aa  172  5e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4145  PfkB domain-containing protein  30.99 
 
 
327 aa  167  2.9999999999999998e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.786211  decreased coverage  0.0063394 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1416  ribokinase-like domain-containing protein  30.96 
 
 
302 aa  149  8e-35  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0492  ribokinase-like domain-containing protein  31.32 
 
 
302 aa  148  9e-35  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1220  cytidine kinase / inosine-guanosine kinase  31.32 
 
 
302 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.515057  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1406  ribokinase-like domain-containing protein  30 
 
 
302 aa  143  3e-33  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1201  ribokinase-like domain-containing protein  31.5 
 
 
298 aa  143  4e-33  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2903  cytidine kinase / inosine-guanosine kinase  29.28 
 
 
299 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.859362  hitchhiker  0.00094244 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0077  PfkB  29.35 
 
 
299 aa  107  2e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.273667  normal  0.451983 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0967  cytidine kinase / inosine-guanosine kinase  27.54 
 
 
300 aa  108  2e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0230959  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1658  ribokinase-like domain-containing protein  29.2 
 
 
298 aa  105  7e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.468132  normal  0.0440332 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1085  PfkB domain protein  30.4 
 
 
294 aa  105  8e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.000428719  normal  0.482766 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0859  ribokinase-like domain-containing protein  28 
 
 
296 aa  95.5  1e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.826184  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1080  PfkB domain protein  24.45 
 
 
317 aa  94  3e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0932  inosine-guanosine kinase / cytidine kinase  27.2 
 
 
298 aa  92.8  7e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.934328  normal  0.0821037 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1796  PfkB  29.32 
 
 
293 aa  81.6  0.00000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000052274  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0716  fructokinase  26.15 
 
 
313 aa  80.5  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0666  fructokinase  26.15 
 
 
313 aa  80.5  0.00000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0752  fructokinase  26.15 
 
 
313 aa  80.5  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0902  PfkB domain protein  27.74 
 
 
309 aa  78.6  0.0000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>