More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_2455 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_2455  PfkB domain-containing protein  100 
 
 		 282 aa  553  1e-157  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.287722  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1019  PfkB domain protein  58.99 
 
 		 284 aa  297  1e-79  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.485278 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3386  ribokinase-like domain-containing protein  37.88 
 
 		 298 aa  142  7e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.139536 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0616  PfkB domain protein  36.12 
 
 		 312 aa  137  2e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.246916  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4851  PfkB  37.16 
 
 		 309 aa  136  4e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.733485  normal  0.689596 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0460  PfkB  37.29 
 
 		 308 aa  132  6e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.413409  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4268  PfkB family kinase  37.5 
 
 		 298 aa  129  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4029  carbohydrate kinase, PfkB  42.42 
 
 		 299 aa  128  9.000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03768  predicted sugar kinase  37.16 
 
 		 298 aa  127  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4103  PfkB domain protein  37.16 
 
 		 298 aa  127  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03717  hypothetical protein  37.16 
 
 		 298 aa  127  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.953641  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4406  PfkB family kinase  37.16 
 
 		 298 aa  127  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5330  kinase, PfkB family  36.82 
 
 		 298 aa  125  5e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.574224 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0671  PfkB  36.82 
 
 		 309 aa  125  7e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.506953 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4413  PfkB family kinase  35.81 
 
 		 298 aa  124  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0358  ribokinase-like domain-containing protein  35.67 
 
 		 306 aa  123  3e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4348  kinase, PfkB family  35.81 
 
 		 298 aa  122  7e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.603923  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4302  kinase PfkB family  35.81 
 
 		 298 aa  122  7e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4235  kinase, PfkB family  35.81 
 
 		 298 aa  122  7e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.907464  normal  0.927219 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4257  kinase, PfkB family  35.81 
 
 		 298 aa  122  7e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0090  PfkB  35.12 
 
 		 309 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.125237 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4103  PfkB family kinase  37.16 
 
 		 298 aa  116  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4140  ribokinase-like domain-containing protein  37.16 
 
 		 298 aa  116  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.682006  normal  0.581205 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4349  kinase, PfkB family  36.49 
 
 		 298 aa  113  4.0000000000000004e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5201  PfkB domain protein  33.56 
 
 		 326 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.515111  normal  0.135366 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0799  ribokinase-like domain-containing protein  39.21 
 
 		 310 aa  105  7e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5471  PfkB domain protein  34.64 
 
 		 324 aa  105  8e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.784292 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0692  carbohydrate kinase  35.4 
 
 		 304 aa  103  3e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.19709  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0970  carbohydrate kinase  34.17 
 
 		 314 aa  95.9  7e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2812  PfkB  34.36 
 
 		 321 aa  95.9  7e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3342  ribokinase  32.13 
 
 		 308 aa  86.3  5e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.133779  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39280  ribokinase  32.46 
 
 		 308 aa  86.3  5e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.145597  normal  0.325767 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0518  ribokinase  29.41 
 
 		 307 aa  85.1  0.000000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0558  PfkB domain protein  30.07 
 
 		 295 aa  83.6  0.000000000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1117  ribokinase-like domain-containing protein  31.25 
 
 		 305 aa  79.7  0.00000000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.145837 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1940  PfkB  25.63 
 
 		 294 aa  79.7  0.00000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.123547  normal  0.0238447 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5483  PfkB domain protein  34.29 
 
 		 313 aa  79.3  0.00000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.235286 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1539  ribokinase  31.27 
 
 		 320 aa  79  0.00000000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.385923  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3332  ribokinase  31.37 
 
 		 297 aa  78.2  0.0000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1976  putative ribokinase  32.89 
 
 		 305 aa  78.6  0.0000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.191043  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6290  ribokinase  31.27 
 
 		 320 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.631078 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2155  carbohydrate kinase, PfkB  30.92 
 
 		 306 aa  77  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00604172  normal  0.881399 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3869  ribokinase  27.97 
 
 		 299 aa  76.3  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.559054 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0794  ribokinase family sugar kinase  25.57 
 
 		 313 aa  75.9  0.0000000000007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0266657  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0722  ribokinase  29.73 
 
 		 298 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.83177e-24 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0980  ribokinase-like domain-containing protein  31.29 
 
 		 300 aa  75.1  0.000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.167032 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1546  PfkB domain protein  27.11 
 
 		 285 aa  75.1  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.418317 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0162  ribokinase  27.56 
 
 		 309 aa  74.7  0.000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1986  PfkB  27.31 
 
 		 286 aa  74.3  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.842187 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0733  ribokinase  29.39 
 
 		 298 aa  73.6  0.000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0576  ribokinase  29.73 
 
 		 298 aa  73.6  0.000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0794  ribokinase  29.73 
 
 		 298 aa  73.6  0.000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00121525  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0632  ribokinase  29.73 
 
 		 298 aa  73.2  0.000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6906  ribokinase  30.82 
 
 		 328 aa  72.8  0.000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.135806  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0665  ribokinase  29.73 
 
 		 298 aa  73.2  0.000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2526  ribokinase  28.91 
 
 		 301 aa  72.8  0.000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0041  ribokinase-like domain-containing protein  31.91 
 
 		 304 aa  73.2  0.000000000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0344  ribokinase  27.56 
 
 		 308 aa  72.8  0.000000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6950  ribokinase  31.27 
 
 		 308 aa  72.8  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1013  putative ribokinase protein  33.01 
 
 		 315 aa  72.8  0.000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.340196  normal  0.195927 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2014  PfkB domain protein  28.06 
 
 		 324 aa  72.4  0.000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1368  ribokinase  29.14 
 
 		 305 aa  72.4  0.000000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.176905  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0575  ribokinase  29.05 
 
 		 298 aa  72.4  0.000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0924  ribokinase-like domain-containing protein  23.55 
 
 		 305 aa  72  0.00000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.108155  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0259  ribokinase  31.4 
 
 		 295 aa  71.6  0.00000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00211116  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0078  ribokinase-like domain-containing protein  33.22 
 
 		 302 aa  72  0.00000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1789  ribokinase  27.81 
 
 		 297 aa  72  0.00000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000225274  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2334  PfkB domain protein  27.17 
 
 		 314 aa  71.2  0.00000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0161012  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1268  PfkB domain protein  30.48 
 
 		 333 aa  71.2  0.00000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.63046  normal  0.760626 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1507  ribokinase  32.76 
 
 		 308 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0921  ketohexokinase  30.11 
 
 		 292 aa  71.6  0.00000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0220  ribokinase  32.27 
 
 		 305 aa  70.1  0.00000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.328501  normal  0.180212 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2817  PfkB domain protein  31.03 
 
 		 295 aa  70.5  0.00000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.575722  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4641  ribokinase  29.05 
 
 		 298 aa  70.1  0.00000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.184783  unclonable  5.38833e-26 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0697  ribokinase  29.05 
 
 		 298 aa  69.7  0.00000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0813613  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000338  ribokinase  28.76 
 
 		 305 aa  69.3  0.00000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2297  ribokinase  27.18 
 
 		 309 aa  69.3  0.00000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0434925  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0417  ribokinase-like domain-containing protein  29.82 
 
 		 309 aa  68.9  0.00000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.994196  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1980  ribokinase  28.66 
 
 		 302 aa  68.9  0.00000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3167  ribokinase  30.41 
 
 		 295 aa  68.9  0.00000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5220  PfkB domain protein  33.19 
 
 		 313 aa  68.9  0.00000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.946183  normal  0.655823 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1526  ribokinase  32.42 
 
 		 308 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.395922  normal  0.909431 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4158  ribokinase  33.11 
 
 		 301 aa  68.2  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0695289  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0007  ribokinase  27.56 
 
 		 306 aa  68.9  0.0000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.328015  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0349  putative ribokinase  29.82 
 
 		 309 aa  68.6  0.0000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0020  PfkB domain protein  25.27 
 
 		 291 aa  68.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0022  PfkB domain protein  25.27 
 
 		 291 aa  68.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4160  ribokinase  30.1 
 
 		 310 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.233177 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1805  PfkB  26.35 
 
 		 318 aa  68.2  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.512756  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4209  ribokinase  31.37 
 
 		 308 aa  67.8  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.847437  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0008  ribokinase  31.37 
 
 		 308 aa  67  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0252287  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3179  ribokinase  29.17 
 
 		 303 aa  67  0.0000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0579  ribokinase  28.38 
 
 		 298 aa  67  0.0000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4122  PfkB  27.48 
 
 		 320 aa  67  0.0000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1383  ribokinase  32.89 
 
 		 309 aa  67  0.0000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0008  ribokinase  31.37 
 
 		 308 aa  67  0.0000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000914124  normal  0.985734 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1115  PfkB domain protein  31.1 
 
 		 322 aa  67  0.0000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3631  ribokinase  26.95 
 
 		 304 aa  67  0.0000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4302  PfkB domain protein  27.11 
 
 		 297 aa  66.6  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1888  PfkB  33.08 
 
 		 323 aa  66.6  0.0000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.389987  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>