More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_2313 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_02095  predicted kinase  98.72 
 
 		 313 aa  635    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.308891  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1492  PfkB domain protein  99.36 
 
 		 313 aa  638    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.104134  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02054  hypothetical protein  98.72 
 
 		 313 aa  635    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.272027  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2313  hypothetical protein  100 
 
 		 313 aa  644    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0218939  decreased coverage  0.000211753 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2303  hypothetical protein  98.72 
 
 		 313 aa  635    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0379956  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2463  hypothetical protein  99.68 
 
 		 313 aa  642    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0259659  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3302  hypothetical protein  99.04 
 
 		 313 aa  638    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0135155  normal  0.0377447 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1482  hypothetical protein  98.72 
 
 		 313 aa  635    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0391896  hitchhiker  0.00000306075 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1351  ribokinase-like domain-containing protein  43.41 
 
 		 374 aa  266  4e-70  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.759267  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2951  ribokinase-like domain-containing protein  42.44 
 
 		 363 aa  265  8e-70  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1445  ribokinase-like domain-containing protein  42.63 
 
 		 363 aa  263  2e-69  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2725  ribokinase-like domain-containing protein  42.63 
 
 		 363 aa  251  8.000000000000001e-66  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000788266 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02089  predicted kinase  39.68 
 
 		 362 aa  229  4e-59  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.114091  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1488  hypothetical protein  39.68 
 
 		 362 aa  229  4e-59  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000467798  hitchhiker  0.00751025 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0806  hypothetical protein  39.68 
 
 		 362 aa  229  4e-59  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2296  hypothetical protein  39.68 
 
 		 362 aa  229  4e-59  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02048  hypothetical protein  39.68 
 
 		 362 aa  229  4e-59  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0826049  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1498  PfkB domain protein  39.35 
 
 		 362 aa  228  8e-59  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000282324  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3296  hypothetical protein  39.35 
 
 		 362 aa  228  1e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.170772  normal  0.250376 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2307  hypothetical protein  39.35 
 
 		 362 aa  227  2e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.945779  hitchhiker  0.00150581 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0139  transcriptional regulator, MarR family  39.34 
 
 		 360 aa  219  6e-56  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1913  PfkB domain protein  35.76 
 
 		 363 aa  214  9.999999999999999e-55  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.154738  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0258  ribokinase-like domain-containing protein  35.69 
 
 		 380 aa  205  9e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1733  PfkB family kinase  34.3 
 
 		 321 aa  204  2e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000174723  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1461  kinase yeiC, putative  34.3 
 
 		 321 aa  202  5e-51  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0117652  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1032  ribokinase-like domain-containing protein  34.75 
 
 		 318 aa  199  3.9999999999999996e-50  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000268353  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0555  PfkB domain protein  34.3 
 
 		 306 aa  186  6e-46  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3467  ribokinase-like domain-containing protein  30.2 
 
 		 312 aa  164  1.0000000000000001e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3222  ribokinase-like domain-containing protein  29.15 
 
 		 314 aa  153  2.9999999999999998e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.830633  normal  0.0230782 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3923  ribokinase-like domain-containing protein  28.81 
 
 		 314 aa  151  1e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4622  ribokinase-like domain-containing protein  34.41 
 
 		 369 aa  144  2e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0428968  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0663  PfkB domain protein  30.1 
 
 		 315 aa  144  2e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0358  PfkB  32.58 
 
 		 377 aa  130  4.0000000000000003e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.660775  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2164  PfkB domain protein  30.56 
 
 		 313 aa  123  4e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0301  ribokinase-like domain-containing protein  29.26 
 
 		 372 aa  117  3e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0294  ribokinase-like domain-containing protein  29.26 
 
 		 372 aa  117  3e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0317  kinase, PfkB family  26.22 
 
 		 382 aa  111  2.0000000000000002e-23  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.196123 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0899  ribokinase-like domain-containing protein  27.24 
 
 		 307 aa  109  5e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1959  PfkB domain protein  27.3 
 
 		 314 aa  109  7.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.13744 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3196  ribokinase  28.08 
 
 		 316 aa  104  2e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.20247  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3488  ribokinase  25.87 
 
 		 302 aa  99.4  7e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.232463  normal  0.188896 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2170  PfkB domain protein  26.79 
 
 		 314 aa  97.4  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.68008  normal  0.0885177 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3232  ribokinase  25.17 
 
 		 302 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.493529  normal  0.585828 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2458  ribokinase  24.83 
 
 		 302 aa  94.4  3e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2559  carbohydrate kinase  26.35 
 
 		 321 aa  91.7  1e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.270626  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1960  ribokinase  23.86 
 
 		 302 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0122509  normal  0.0586965 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0518  ribokinase  25.19 
 
 		 307 aa  88.2  2e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17480  sugar kinase, ribokinase  23.49 
 
 		 304 aa  88.2  2e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.402042  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3869  ribokinase  24.74 
 
 		 299 aa  87.4  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.559054 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39280  ribokinase  25.09 
 
 		 308 aa  86.7  5e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.145597  normal  0.325767 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7448  cyclic nucleotide-binding protein  27.97 
 
 		 314 aa  86.3  7e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1264  PfkB  27.21 
 
 		 313 aa  85.5  0.000000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3342  ribokinase  24.83 
 
 		 308 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.133779  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3280  ribokinase  27.53 
 
 		 305 aa  84  0.000000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4640  ribokinase  26.06 
 
 		 305 aa  83.2  0.000000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.162899  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH02430  conserved hypothetical protein  30.96 
 
 		 759 aa  82  0.00000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4209  ribokinase  25.31 
 
 		 308 aa  80.9  0.00000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.847437  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1368  ribokinase  25.41 
 
 		 305 aa  80.5  0.00000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.176905  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3225  ribokinase  25.42 
 
 		 311 aa  80.5  0.00000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.195342  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0008  ribokinase  25.31 
 
 		 308 aa  80.1  0.00000000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000914124  normal  0.985734 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0008  ribokinase  25.31 
 
 		 308 aa  80.1  0.00000000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0252287  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0556  ribokinase family sugar kinase  26.55 
 
 		 308 aa  79.7  0.00000000000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.987541  hitchhiker  0.0000000000000234776 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1084  PfkB family DNA-binding protein/kinase  25.66 
 
 		 404 aa  78.6  0.0000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3859  ribokinase  26.3 
 
 		 404 aa  77.4  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3816  ribokinase  26.3 
 
 		 404 aa  77.4  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3738  ribokinase  26.3 
 
 		 404 aa  77  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3749  ribokinase  26.3 
 
 		 404 aa  77.4  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3918  ribokinase  26.3 
 
 		 404 aa  76.6  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0624  ribokinase-like domain-containing protein  27.24 
 
 		 313 aa  76.3  0.0000000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00311973 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0344  ribokinase  23.28 
 
 		 308 aa  76.3  0.0000000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3765  ribokinase  26.35 
 
 		 304 aa  75.5  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0637373 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0354  ribokinase  24.38 
 
 		 308 aa  75.1  0.000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0162  ribokinase  22.41 
 
 		 309 aa  75.1  0.000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4171  ribokinase  24.19 
 
 		 310 aa  74.7  0.000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000241058  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1011  ribokinase-like domain-containing protein  24.29 
 
 		 398 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2283  ribokinase  26.64 
 
 		 310 aa  74.3  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.269259 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1338  PfkB  28.78 
 
 		 302 aa  73.9  0.000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1124  ribokinase  25 
 
 		 403 aa  73.9  0.000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6387  ribokinase  27.53 
 
 		 309 aa  73.6  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.906333  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0225  ribokinase  25.4 
 
 		 317 aa  72  0.00000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4524  ribokinase  24.48 
 
 		 308 aa  72.4  0.00000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00216955  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1980  ribokinase  23.55 
 
 		 302 aa  72  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4120  ribokinase  23.63 
 
 		 314 aa  70.9  0.00000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.444588  normal  0.199768 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4167  ribokinase  23.63 
 
 		 309 aa  70.5  0.00000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.895072  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03638  ribokinase  23.63 
 
 		 309 aa  70.5  0.00000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00223583  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0404  ribokinase  23.81 
 
 		 307 aa  70.9  0.00000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000422627  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0560  ribokinase  24.55 
 
 		 298 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000679387  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5188  ribokinase  23.63 
 
 		 314 aa  70.9  0.00000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.034479  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1812  ribokinase-like domain-containing protein  29.63 
 
 		 301 aa  70.5  0.00000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0916129  decreased coverage  0.00793411 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03583  hypothetical protein  23.63 
 
 		 309 aa  70.5  0.00000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00147711  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3350  hypothetical protein  23.25 
 
 		 315 aa  70.9  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.373497 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4242  ribokinase  23.63 
 
 		 309 aa  70.5  0.00000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.459204  hitchhiker  0.00710658 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4268  ribokinase  23.63 
 
 		 309 aa  70.5  0.00000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00050994  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3718  ribokinase  28.73 
 
 		 318 aa  70.5  0.00000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3968  ribokinase  23.63 
 
 		 309 aa  70.5  0.00000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.112559  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7361  ribokinase  24.31 
 
 		 308 aa  70.1  0.00000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0200  ribokinase  27.53 
 
 		 313 aa  69.7  0.00000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.933367 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0575  ribokinase  24.4 
 
 		 298 aa  70.1  0.00000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3974  ribokinase  21.99 
 
 		 308 aa  70.1  0.00000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00187599  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0810  ribokinase  23.1 
 
 		 303 aa  69.7  0.00000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>