More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_3467 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_3467  ribokinase-like domain-containing protein  100 
 
 		 312 aa  615  1e-175  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3222  ribokinase-like domain-containing protein  52.48 
 
 		 314 aa  297  2e-79  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.830633  normal  0.0230782 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3923  ribokinase-like domain-containing protein  50.8 
 
 		 314 aa  293  2e-78  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0258  ribokinase-like domain-containing protein  34.88 
 
 		 380 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1351  ribokinase-like domain-containing protein  33.22 
 
 		 374 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.759267  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1445  ribokinase-like domain-containing protein  32.88 
 
 		 363 aa  170  3e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0358  PfkB  42.26 
 
 		 377 aa  170  3e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.660775  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1492  PfkB domain protein  30.2 
 
 		 313 aa  164  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.104134  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2463  hypothetical protein  30.2 
 
 		 313 aa  164  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0259659  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2313  hypothetical protein  30.2 
 
 		 313 aa  164  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0218939  decreased coverage  0.000211753 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02095  predicted kinase  30.2 
 
 		 313 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.308891  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1482  hypothetical protein  30.2 
 
 		 313 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0391896  hitchhiker  0.00000306075 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0139  transcriptional regulator, MarR family  32.09 
 
 		 360 aa  164  2.0000000000000002e-39  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02054  hypothetical protein  30.2 
 
 		 313 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.272027  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2303  hypothetical protein  30.2 
 
 		 313 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0379956  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2951  ribokinase-like domain-containing protein  31.16 
 
 		 363 aa  164  3e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1733  PfkB family kinase  28.24 
 
 		 321 aa  163  4.0000000000000004e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000174723  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2725  ribokinase-like domain-containing protein  32.53 
 
 		 363 aa  163  4.0000000000000004e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000788266 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3302  hypothetical protein  29.87 
 
 		 313 aa  162  6e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0135155  normal  0.0377447 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1461  kinase yeiC, putative  28.24 
 
 		 321 aa  161  1e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0117652  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1913  PfkB domain protein  29.24 
 
 		 363 aa  157  3e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.154738  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2164  PfkB domain protein  33.66 
 
 		 313 aa  153  2.9999999999999998e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0555  PfkB domain protein  29.69 
 
 		 306 aa  149  8e-35  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1032  ribokinase-like domain-containing protein  29.15 
 
 		 318 aa  148  9e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000268353  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4622  ribokinase-like domain-containing protein  37.67 
 
 		 369 aa  145  1e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0428968  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0301  ribokinase-like domain-containing protein  29.03 
 
 		 372 aa  139  6e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0294  ribokinase-like domain-containing protein  29.03 
 
 		 372 aa  139  6e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2307  hypothetical protein  30.53 
 
 		 362 aa  137  2e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.945779  hitchhiker  0.00150581 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0899  ribokinase-like domain-containing protein  30.13 
 
 		 307 aa  137  3.0000000000000003e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02089  predicted kinase  30.63 
 
 		 362 aa  136  4e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.114091  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1488  hypothetical protein  30.63 
 
 		 362 aa  136  4e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000467798  hitchhiker  0.00751025 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0806  hypothetical protein  30.63 
 
 		 362 aa  136  4e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2296  hypothetical protein  30.63 
 
 		 362 aa  136  4e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02048  hypothetical protein  30.63 
 
 		 362 aa  136  4e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0826049  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1498  PfkB domain protein  30.28 
 
 		 362 aa  135  8e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000282324  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3296  hypothetical protein  30.18 
 
 		 362 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.170772  normal  0.250376 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1959  PfkB domain protein  33.77 
 
 		 314 aa  125  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.13744 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2170  PfkB domain protein  32.14 
 
 		 314 aa  108  9.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.68008  normal  0.0885177 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0663  PfkB domain protein  25.08 
 
 		 315 aa  108  1e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0317  kinase, PfkB family  27.78 
 
 		 382 aa  105  1e-21  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.196123 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1980  ribokinase  31.49 
 
 		 302 aa  102  7e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1368  ribokinase  34.26 
 
 		 305 aa  100  4e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.176905  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1923  ribokinase  32.64 
 
 		 305 aa  99.4  7e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.254632  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3488  ribokinase  31.01 
 
 		 302 aa  97.4  3e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.232463  normal  0.188896 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0354  ribokinase  32.39 
 
 		 308 aa  97.1  3e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2559  carbohydrate kinase  30.62 
 
 		 321 aa  95.9  9e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.270626  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3232  ribokinase  31.01 
 
 		 302 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.493529  normal  0.585828 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0344  ribokinase  30.59 
 
 		 308 aa  95.5  1e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2458  ribokinase  30.66 
 
 		 302 aa  93.6  4e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0869  ribokinase-like domain-containing protein  23.49 
 
 		 290 aa  92  1e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0005  ribokinase, putative  28.43 
 
 		 313 aa  90.5  4e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0831175  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3634  ribokinase-like domain-containing protein  27.17 
 
 		 329 aa  89  1e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.428669  normal  0.334596 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19960  PfkB domain protein  25.36 
 
 		 323 aa  87.8  2e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1285  ribokinase  26.9 
 
 		 307 aa  87.4  3e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000150833  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3869  ribokinase  28.82 
 
 		 299 aa  87.4  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.559054 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0977  rfaE bifunctional protein  28.68 
 
 		 491 aa  87  3e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.673114  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7361  ribokinase  30 
 
 		 308 aa  87.4  3e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4447  ribokinase  28.04 
 
 		 334 aa  85.9  8e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0007  ribokinase  31.8 
 
 		 306 aa  85.5  0.000000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.328015  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1960  ribokinase  30.69 
 
 		 302 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0122509  normal  0.0586965 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4641  ribokinase  29.25 
 
 		 298 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.184783  unclonable  5.38833e-26 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0579  ribokinase  28.85 
 
 		 298 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2283  ribokinase  27.7 
 
 		 310 aa  84.7  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.269259 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0865  ribokinase  26.9 
 
 		 305 aa  84.7  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.657252 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0697  ribokinase  29.64 
 
 		 298 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0813613  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3350  hypothetical protein  30.23 
 
 		 315 aa  84.7  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.373497 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0349  putative ribokinase  28.85 
 
 		 309 aa  84  0.000000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0518  ribokinase  29.02 
 
 		 307 aa  83.2  0.000000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0162  ribokinase  25.43 
 
 		 309 aa  83.2  0.000000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0733  ribokinase  28.85 
 
 		 298 aa  83.2  0.000000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0417  ribokinase-like domain-containing protein  28.85 
 
 		 309 aa  83.2  0.000000000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.994196  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4209  ribokinase  28.47 
 
 		 308 aa  82.8  0.000000000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.847437  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0008  ribokinase  28.47 
 
 		 308 aa  82.8  0.000000000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000914124  normal  0.985734 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0008  ribokinase  28.47 
 
 		 308 aa  82.8  0.000000000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0252287  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1282  putative ribokinase  26.55 
 
 		 345 aa  82.8  0.000000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.331017 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0794  ribokinase  29.08 
 
 		 298 aa  82  0.00000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00121525  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0575  ribokinase  29.88 
 
 		 298 aa  82  0.00000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06142  ribokinase  30.47 
 
 		 305 aa  82  0.00000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17480  sugar kinase, ribokinase  26.23 
 
 		 304 aa  81.6  0.00000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.402042  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000338  ribokinase  30.47 
 
 		 305 aa  82  0.00000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0722  ribokinase  29.48 
 
 		 298 aa  82  0.00000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.83177e-24 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1612  ribokinase family sugar kinase  23.18 
 
 		 340 aa  82.4  0.00000000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0874983  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4524  ribokinase  27.86 
 
 		 308 aa  82  0.00000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00216955  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0576  ribokinase  29.48 
 
 		 298 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0864  rfaE bifunctional protein  26.82 
 
 		 487 aa  81.6  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.848286  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4897  ribokinase  30.29 
 
 		 318 aa  81.3  0.00000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00647815  hitchhiker  0.000000886041 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1802  ribokinase family sugar kinase  27.38 
 
 		 306 aa  81.6  0.00000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00331295  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0632  ribokinase  29.48 
 
 		 298 aa  80.9  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0665  ribokinase  29.48 
 
 		 298 aa  80.9  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0709  bifunctional heptose 7-phosphate kinase/heptose 1-phosphate adenyltransferase  30.23 
 
 		 480 aa  80.9  0.00000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00429922  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18220  Fructokinase  26.39 
 
 		 320 aa  80.1  0.00000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.749798  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2155  carbohydrate kinase, PfkB  34.54 
 
 		 306 aa  80.1  0.00000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00604172  normal  0.881399 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2121  PfkB  28.83 
 
 		 307 aa  80.1  0.00000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.987568  normal  0.281407 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0902  PfkB domain protein  29.7 
 
 		 309 aa  80.1  0.00000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0769  bifunctional heptose 7-phosphate kinase/heptose 1-phosphate adenyltransferase  29.2 
 
 		 479 aa  79.7  0.00000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2578  ribokinase-like domain-containing protein  29.79 
 
 		 336 aa  79.7  0.00000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.630193  normal  0.0973435 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3580  ribokinase  27.78 
 
 		 303 aa  80.1  0.00000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3407  ribokinase  28.42 
 
 		 424 aa  79.7  0.00000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2100  ribokinase  26.28 
 
 		 307 aa  79.3  0.00000000000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3648  ribokinase  27.78 
 
 		 303 aa  79.3  0.00000000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.16351  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>