More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_4447 on replicon NC_009668
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009668  Oant_4447  ribokinase  100 
 
 		 334 aa  665    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0005  ribokinase, putative  89.47 
 
 		 313 aa  519  1e-146  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0831175  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3196  ribokinase  44.08 
 
 		 316 aa  239  5.999999999999999e-62  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.20247  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1368  ribokinase  41.72 
 
 		 305 aa  226  6e-58  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.176905  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0344  ribokinase  39.93 
 
 		 308 aa  221  9.999999999999999e-57  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0865  ribokinase  42.52 
 
 		 305 aa  218  1e-55  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.657252 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0518  ribokinase  39.22 
 
 		 307 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3280  ribokinase  44.74 
 
 		 305 aa  212  7.999999999999999e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3225  ribokinase  39.46 
 
 		 311 aa  211  2e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.195342  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0007  ribokinase  41.25 
 
 		 306 aa  209  4e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.328015  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0225  ribokinase  39.87 
 
 		 317 aa  207  1e-52  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3765  ribokinase  44.3 
 
 		 304 aa  207  3e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0637373 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2155  carbohydrate kinase, PfkB  41.61 
 
 		 306 aa  207  3e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00604172  normal  0.881399 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4209  ribokinase  40.79 
 
 		 308 aa  204  1e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.847437  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0008  ribokinase  40.79 
 
 		 308 aa  204  2e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000914124  normal  0.985734 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0008  ribokinase  40.79 
 
 		 308 aa  204  2e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0252287  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0354  ribokinase  39.74 
 
 		 308 aa  201  9.999999999999999e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4112  ribokinase  42.24 
 
 		 314 aa  201  9.999999999999999e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.137764  normal  0.0163752 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0696  ribokinase  42.38 
 
 		 304 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39280  ribokinase  40.33 
 
 		 308 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.145597  normal  0.325767 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4171  ribokinase  41.58 
 
 		 310 aa  199  3.9999999999999996e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000241058  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4215  ribokinase  41.72 
 
 		 309 aa  199  6e-50  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1960  ribokinase  39.46 
 
 		 302 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0122509  normal  0.0586965 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1124  ribokinase  39.6 
 
 		 403 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4168  ribokinase  41.45 
 
 		 309 aa  196  4.0000000000000005e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4218  ribokinase  41.45 
 
 		 309 aa  196  4.0000000000000005e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.980767 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4277  ribokinase  41.45 
 
 		 309 aa  196  4.0000000000000005e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.136431  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4097  ribokinase  41.45 
 
 		 309 aa  196  4.0000000000000005e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4112  ribokinase  41.45 
 
 		 309 aa  196  4.0000000000000005e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3342  ribokinase  39.33 
 
 		 308 aa  196  5.000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.133779  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03638  ribokinase  41.39 
 
 		 309 aa  196  7e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00223583  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4120  ribokinase  41.39 
 
 		 314 aa  196  7e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.444588  normal  0.199768 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03583  hypothetical protein  41.39 
 
 		 309 aa  196  7e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00147711  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1789  ribokinase  39.67 
 
 		 297 aa  195  8.000000000000001e-49  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000225274  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4242  ribokinase  41.39 
 
 		 309 aa  195  1e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.459204  hitchhiker  0.00710658 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3407  ribokinase  39.14 
 
 		 424 aa  195  1e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3968  ribokinase  41.39 
 
 		 309 aa  195  1e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.112559  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5188  ribokinase  41.39 
 
 		 314 aa  195  1e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.034479  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4268  ribokinase  41.39 
 
 		 309 aa  195  1e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00050994  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06142  ribokinase  37.29 
 
 		 305 aa  194  2e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000338  ribokinase  37.75 
 
 		 305 aa  194  2e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3974  ribokinase  38.94 
 
 		 308 aa  193  3e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00187599  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4167  ribokinase  41.06 
 
 		 309 aa  193  3e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.895072  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3869  ribokinase  37 
 
 		 299 aa  193  4e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.559054 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1011  ribokinase-like domain-containing protein  38.61 
 
 		 398 aa  192  6e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2909  ribokinase  43.42 
 
 		 302 aa  192  8e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0179509 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0556  ribokinase family sugar kinase  38.51 
 
 		 308 aa  191  1e-47  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.987541  hitchhiker  0.0000000000000234776 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3232  ribokinase  38.26 
 
 		 302 aa  190  2e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.493529  normal  0.585828 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1507  ribokinase  38.21 
 
 		 308 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1048  ribokinase  39.07 
 
 		 301 aa  189  5e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4124  ribokinase  37.95 
 
 		 403 aa  189  5.999999999999999e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4160  ribokinase  39.13 
 
 		 310 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.233177 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4897  ribokinase  40.13 
 
 		 318 aa  189  7e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00647815  hitchhiker  0.000000886041 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3488  ribokinase  37.92 
 
 		 302 aa  188  1e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.232463  normal  0.188896 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1526  ribokinase  38.21 
 
 		 308 aa  188  1e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.395922  normal  0.909431 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0576  putative ribokinase  39.46 
 
 		 312 aa  187  2e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.588326 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1285  ribokinase  37.95 
 
 		 307 aa  187  2e-46  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000150833  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6387  ribokinase  43.61 
 
 		 309 aa  187  3e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.906333  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4524  ribokinase  40.13 
 
 		 308 aa  186  3e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00216955  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0252  ribokinase  42.11 
 
 		 307 aa  185  7e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.377165  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0939  ribokinase  39.19 
 
 		 302 aa  185  7e-46  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000942042  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4749  ribokinase  38.33 
 
 		 309 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.396985 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0162  ribokinase  34.53 
 
 		 309 aa  185  1.0000000000000001e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2458  ribokinase  37.25 
 
 		 302 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4234  ribokinase  39.54 
 
 		 308 aa  182  6e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000102528  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2689  ribokinase  34.31 
 
 		 345 aa  182  7e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2297  ribokinase  37.54 
 
 		 309 aa  181  1e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0434925  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0749  ribokinase  33.66 
 
 		 306 aa  182  1e-44  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00000000720941  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3631  ribokinase  33.88 
 
 		 304 aa  181  2e-44  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2371  ribokinase  41.86 
 
 		 306 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0559074  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3350  hypothetical protein  42.75 
 
 		 315 aa  180  4e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.373497 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1976  putative ribokinase  41.64 
 
 		 305 aa  179  4.999999999999999e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.191043  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1383  ribokinase  42.38 
 
 		 309 aa  179  8e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2838  ribokinase  38.14 
 
 		 314 aa  179  8e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.760591  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3738  carbohydrate kinase  41.98 
 
 		 315 aa  178  1e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0822309  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1343  ribokinase  42.9 
 
 		 309 aa  178  1e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3470  ribokinase  41.98 
 
 		 315 aa  178  1e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.973567  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2120  PfkB domain protein  35.02 
 
 		 290 aa  177  2e-43  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3477  ribokinase  37.54 
 
 		 303 aa  177  2e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1119  ribokinase  38.08 
 
 		 302 aa  177  3e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.970785  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2100  ribokinase  35.97 
 
 		 307 aa  176  4e-43  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1612  ribokinase family sugar kinase  33 
 
 		 340 aa  176  4e-43  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0874983  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2283  ribokinase  39.93 
 
 		 310 aa  176  7e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.269259 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3307  ribokinase  36.88 
 
 		 303 aa  176  7e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0646  ribokinase  36.88 
 
 		 303 aa  176  7e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.497411 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2121  PfkB  38.16 
 
 		 307 aa  175  9e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.987568  normal  0.281407 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1980  ribokinase  37.25 
 
 		 302 aa  172  5.999999999999999e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3718  ribokinase  36.33 
 
 		 318 aa  172  6.999999999999999e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0259  ribokinase  36.51 
 
 		 304 aa  172  6.999999999999999e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1603  ribokinase  33.66 
 
 		 310 aa  172  6.999999999999999e-42  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0000677641  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0253  ribokinase  36.51 
 
 		 304 aa  172  6.999999999999999e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3580  ribokinase  37.09 
 
 		 303 aa  172  7.999999999999999e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3648  ribokinase  37.09 
 
 		 303 aa  172  9e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.16351  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04580  Ribokinase  34.45 
 
 		 306 aa  172  1e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3179  ribokinase  36.21 
 
 		 303 aa  172  1e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1013  putative ribokinase protein  37.62 
 
 		 315 aa  171  2e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.340196  normal  0.195927 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl642  ribokinase  32.46 
 
 		 308 aa  171  2e-41  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3771  ribokinase  37.09 
 
 		 303 aa  170  3e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0659  ribokinase  37.09 
 
 		 303 aa  170  3e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2837  ribokinase  39.22 
 
 		 302 aa  170  4e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>