More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BRA0005 on replicon NC_004311
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004311  BRA0005  ribokinase, putative  100 
 
 		 313 aa  619  1e-176  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0831175  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4447  ribokinase  89.47 
 
 		 334 aa  486  1e-136  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3196  ribokinase  44.74 
 
 		 316 aa  232  7.000000000000001e-60  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.20247  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1368  ribokinase  41.25 
 
 		 305 aa  222  7e-57  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.176905  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0344  ribokinase  39.14 
 
 		 308 aa  216  2.9999999999999998e-55  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3280  ribokinase  46.08 
 
 		 305 aa  213  2.9999999999999995e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0518  ribokinase  39.27 
 
 		 307 aa  212  7e-54  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0865  ribokinase  39.6 
 
 		 305 aa  212  7e-54  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.657252 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2155  carbohydrate kinase, PfkB  40.86 
 
 		 306 aa  209  5e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00604172  normal  0.881399 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0354  ribokinase  40.79 
 
 		 308 aa  205  7e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0007  ribokinase  39.93 
 
 		 306 aa  204  2e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.328015  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0225  ribokinase  38.34 
 
 		 317 aa  203  3e-51  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3765  ribokinase  45.57 
 
 		 304 aa  203  4e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0637373 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3225  ribokinase  38.36 
 
 		 311 aa  201  9.999999999999999e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.195342  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1789  ribokinase  40.07 
 
 		 297 aa  196  3e-49  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000225274  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06142  ribokinase  38.08 
 
 		 305 aa  197  3e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4112  ribokinase  41.58 
 
 		 314 aa  196  6e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.137764  normal  0.0163752 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4215  ribokinase  40.79 
 
 		 309 aa  194  1e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000338  ribokinase  38.08 
 
 		 305 aa  194  2e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1960  ribokinase  39.26 
 
 		 302 aa  192  5e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0122509  normal  0.0586965 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4112  ribokinase  41.58 
 
 		 309 aa  192  9e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39280  ribokinase  38.8 
 
 		 308 aa  191  9e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.145597  normal  0.325767 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4097  ribokinase  41.58 
 
 		 309 aa  192  9e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03638  ribokinase  40.46 
 
 		 309 aa  191  1e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00223583  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4120  ribokinase  40.46 
 
 		 314 aa  191  1e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.444588  normal  0.199768 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4218  ribokinase  41.58 
 
 		 309 aa  191  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.980767 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4168  ribokinase  41.58 
 
 		 309 aa  191  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03583  hypothetical protein  40.46 
 
 		 309 aa  191  1e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00147711  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4277  ribokinase  41.58 
 
 		 309 aa  191  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.136431  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4167  ribokinase  40.46 
 
 		 309 aa  191  2e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.895072  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4242  ribokinase  40.46 
 
 		 309 aa  191  2e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.459204  hitchhiker  0.00710658 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3968  ribokinase  40.46 
 
 		 309 aa  191  2e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.112559  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5188  ribokinase  40.46 
 
 		 314 aa  191  2e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.034479  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4268  ribokinase  40.46 
 
 		 309 aa  191  2e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00050994  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0696  ribokinase  40.13 
 
 		 304 aa  190  2.9999999999999997e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3869  ribokinase  36.88 
 
 		 299 aa  189  5.999999999999999e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.559054 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1124  ribokinase  38.41 
 
 		 403 aa  188  9e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4171  ribokinase  39.6 
 
 		 310 aa  187  2e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000241058  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0162  ribokinase  35.62 
 
 		 309 aa  187  2e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3342  ribokinase  37.79 
 
 		 308 aa  186  4e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.133779  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0556  ribokinase family sugar kinase  37.38 
 
 		 308 aa  186  4e-46  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.987541  hitchhiker  0.0000000000000234776 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1285  ribokinase  37.21 
 
 		 307 aa  185  7e-46  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000150833  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2371  ribokinase  41.2 
 
 		 306 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0559074  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2909  ribokinase  42.52 
 
 		 302 aa  185  1.0000000000000001e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0179509 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0252  ribokinase  42.02 
 
 		 307 aa  184  1.0000000000000001e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.377165  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3974  ribokinase  37.95 
 
 		 308 aa  184  1.0000000000000001e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00187599  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1011  ribokinase-like domain-containing protein  38.06 
 
 		 398 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3631  ribokinase  35.57 
 
 		 304 aa  184  2.0000000000000003e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3232  ribokinase  37.58 
 
 		 302 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.493529  normal  0.585828 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3407  ribokinase  38.06 
 
 		 424 aa  183  3e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4209  ribokinase  38.61 
 
 		 308 aa  183  4.0000000000000006e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.847437  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0008  ribokinase  38.61 
 
 		 308 aa  182  4.0000000000000006e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0252287  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0008  ribokinase  38.61 
 
 		 308 aa  182  4.0000000000000006e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000914124  normal  0.985734 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4897  ribokinase  39.67 
 
 		 318 aa  182  5.0000000000000004e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00647815  hitchhiker  0.000000886041 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3488  ribokinase  37.58 
 
 		 302 aa  182  6e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.232463  normal  0.188896 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0939  ribokinase  38.18 
 
 		 302 aa  181  1e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000942042  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1048  ribokinase  37.75 
 
 		 301 aa  181  2e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2458  ribokinase  37.25 
 
 		 302 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0576  putative ribokinase  37.67 
 
 		 312 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.588326 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4124  ribokinase  36.33 
 
 		 403 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4160  ribokinase  37 
 
 		 310 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.233177 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1507  ribokinase  37.33 
 
 		 308 aa  179  8e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2689  ribokinase  32.75 
 
 		 345 aa  178  1e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4749  ribokinase  37.42 
 
 		 309 aa  178  1e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.396985 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1526  ribokinase  37.33 
 
 		 308 aa  177  2e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.395922  normal  0.909431 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2283  ribokinase  38.73 
 
 		 310 aa  176  5e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.269259 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3307  ribokinase  36.57 
 
 		 303 aa  176  6e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0646  ribokinase  36.57 
 
 		 303 aa  176  6e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.497411 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3477  ribokinase  37.1 
 
 		 303 aa  176  6e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1119  ribokinase  38.76 
 
 		 302 aa  175  7e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.970785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3179  ribokinase  38.31 
 
 		 303 aa  175  8e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3580  ribokinase  38.82 
 
 		 303 aa  175  8e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3648  ribokinase  38.82 
 
 		 303 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.16351  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1603  ribokinase  34.85 
 
 		 310 aa  174  9.999999999999999e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0000677641  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2649  ribokinase  39.44 
 
 		 319 aa  174  1.9999999999999998e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000212257  normal  0.357458 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6387  ribokinase  41.12 
 
 		 309 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.906333  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1612  ribokinase family sugar kinase  33 
 
 		 340 aa  173  2.9999999999999996e-42  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0874983  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3771  ribokinase  38.49 
 
 		 303 aa  172  5.999999999999999e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0659  ribokinase  38.49 
 
 		 303 aa  172  5.999999999999999e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1980  ribokinase  38.24 
 
 		 302 aa  172  7.999999999999999e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4524  ribokinase  38.28 
 
 		 308 aa  171  1e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00216955  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4234  ribokinase  38.61 
 
 		 308 aa  171  1e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000102528  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1383  ribokinase  42.16 
 
 		 309 aa  171  1e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0749  ribokinase  32.46 
 
 		 306 aa  171  1e-41  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00000000720941  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1976  putative ribokinase  40.07 
 
 		 305 aa  171  2e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.191043  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1343  ribokinase  41.85 
 
 		 309 aa  171  2e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2838  ribokinase  36.21 
 
 		 314 aa  169  4e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.760591  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2297  ribokinase  36.96 
 
 		 309 aa  169  4e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0434925  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2120  PfkB domain protein  34.68 
 
 		 290 aa  169  5e-41  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3350  hypothetical protein  41.38 
 
 		 315 aa  169  6e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.373497 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2100  ribokinase  36.16 
 
 		 307 aa  169  7e-41  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl642  ribokinase  32.03 
 
 		 308 aa  168  8e-41  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1923  ribokinase  37.12 
 
 		 305 aa  168  9e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.254632  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2121  PfkB  36.42 
 
 		 307 aa  168  1e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.987568  normal  0.281407 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3738  carbohydrate kinase  40.61 
 
 		 315 aa  167  2e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0822309  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3470  ribokinase  40.61 
 
 		 315 aa  167  2e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.973567  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1884  ribokinase  34.53 
 
 		 310 aa  167  2.9999999999999998e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0118065  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7361  ribokinase  39.37 
 
 		 308 aa  167  2.9999999999999998e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1233  ribokinase  36.81 
 
 		 309 aa  166  5e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.567948  normal  0.0906963 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3718  ribokinase  35.22 
 
 		 318 aa  166  5e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>