More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_0252 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007413  Ava_0252  ribokinase  100 
 
 		 307 aa  606  9.999999999999999e-173  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.377165  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0865  ribokinase  59.34 
 
 		 305 aa  366  1e-100  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.657252 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3280  ribokinase  53.9 
 
 		 305 aa  277  2e-73  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3765  ribokinase  54.58 
 
 		 304 aa  275  1.0000000000000001e-72  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0637373 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1960  ribokinase  46.05 
 
 		 302 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0122509  normal  0.0586965 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3196  ribokinase  44.04 
 
 		 316 aa  228  1e-58  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.20247  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3869  ribokinase  43.33 
 
 		 299 aa  227  2e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.559054 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3488  ribokinase  45.58 
 
 		 302 aa  227  2e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.232463  normal  0.188896 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3167  ribokinase  44.04 
 
 		 295 aa  226  5.0000000000000005e-58  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2909  ribokinase  47.02 
 
 		 302 aa  224  2e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0179509 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39280  ribokinase  41.86 
 
 		 308 aa  223  3e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.145597  normal  0.325767 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2155  carbohydrate kinase, PfkB  44.44 
 
 		 306 aa  223  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00604172  normal  0.881399 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3232  ribokinase  44.52 
 
 		 302 aa  222  7e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.493529  normal  0.585828 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2458  ribokinase  44.56 
 
 		 302 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3342  ribokinase  41.86 
 
 		 308 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.133779  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0354  ribokinase  42.76 
 
 		 308 aa  215  5.9999999999999996e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04580  Ribokinase  39.74 
 
 		 306 aa  213  1.9999999999999998e-54  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0576  putative ribokinase  42.86 
 
 		 312 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.588326 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0518  ribokinase  39.67 
 
 		 307 aa  212  4.9999999999999996e-54  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0344  ribokinase  39.07 
 
 		 308 aa  212  4.9999999999999996e-54  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4591  ribokinase  44.22 
 
 		 295 aa  212  7e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4160  ribokinase  42.52 
 
 		 310 aa  212  7e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.233177 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0007  ribokinase  39.47 
 
 		 306 aa  212  7.999999999999999e-54  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.328015  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0162  ribokinase  40.85 
 
 		 309 aa  211  9e-54  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06142  ribokinase  39.29 
 
 		 305 aa  211  2e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2526  ribokinase  43.85 
 
 		 301 aa  209  6e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1368  ribokinase  39.14 
 
 		 305 aa  208  1e-52  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.176905  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4749  ribokinase  43.49 
 
 		 309 aa  208  1e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.396985 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0556  ribokinase family sugar kinase  38.61 
 
 		 308 aa  207  1e-52  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.987541  hitchhiker  0.0000000000000234776 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000338  ribokinase  39.53 
 
 		 305 aa  206  3e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1507  ribokinase  42.12 
 
 		 308 aa  205  6e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3225  ribokinase  39.02 
 
 		 311 aa  205  7e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.195342  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1526  ribokinase  42.12 
 
 		 308 aa  204  1e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.395922  normal  0.909431 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1923  ribokinase  43 
 
 		 305 aa  203  3e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.254632  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4209  ribokinase  41.12 
 
 		 308 aa  203  3e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.847437  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0008  ribokinase  41.12 
 
 		 308 aa  202  4e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000914124  normal  0.985734 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0008  ribokinase  41.12 
 
 		 308 aa  202  4e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0252287  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3332  ribokinase  41.45 
 
 		 297 aa  199  3.9999999999999996e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0225  ribokinase  39.68 
 
 		 317 aa  199  6e-50  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0220  ribokinase  45.72 
 
 		 305 aa  197  1.0000000000000001e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.328501  normal  0.180212 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4215  ribokinase  41.12 
 
 		 309 aa  197  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4120  ribokinase  41.12 
 
 		 314 aa  197  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.444588  normal  0.199768 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1130  ribokinase  42.18 
 
 		 311 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1610  ribokinase  42.18 
 
 		 311 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.231434  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03638  ribokinase  41.12 
 
 		 309 aa  196  3e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00223583  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4268  ribokinase  41.12 
 
 		 309 aa  197  3e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00050994  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4242  ribokinase  41.12 
 
 		 309 aa  197  3e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.459204  hitchhiker  0.00710658 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3968  ribokinase  41.12 
 
 		 309 aa  197  3e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.112559  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03583  hypothetical protein  41.12 
 
 		 309 aa  196  3e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00147711  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1980  ribokinase  42.52 
 
 		 302 aa  196  3e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5188  ribokinase  41.12 
 
 		 314 aa  196  4.0000000000000005e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.034479  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1383  ribokinase  42.09 
 
 		 309 aa  195  7e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2371  ribokinase  43.43 
 
 		 306 aa  195  8.000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0559074  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0749  ribokinase  39.67 
 
 		 306 aa  195  9e-49  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00000000720941  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1343  ribokinase  42.09 
 
 		 309 aa  195  9e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0005  ribokinase, putative  42.02 
 
 		 313 aa  194  1e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0831175  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4218  ribokinase  40.66 
 
 		 309 aa  194  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.980767 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4277  ribokinase  40.66 
 
 		 309 aa  194  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.136431  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4167  ribokinase  40.79 
 
 		 309 aa  194  1e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.895072  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4168  ribokinase  40.66 
 
 		 309 aa  194  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4097  ribokinase  40.66 
 
 		 309 aa  194  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1587  ribokinase  41.84 
 
 		 311 aa  193  3e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.338475  normal  0.646425 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4112  ribokinase  40.33 
 
 		 309 aa  192  5e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2689  ribokinase  36.07 
 
 		 345 aa  190  2.9999999999999997e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7623  ribokinase  42.32 
 
 		 308 aa  189  4e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.921063  normal  0.354799 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1048  ribokinase  39.53 
 
 		 301 aa  189  4e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0200  ribokinase  41.64 
 
 		 313 aa  189  4e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.933367 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3974  ribokinase  38.74 
 
 		 308 aa  189  4e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00187599  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0404  ribokinase  37.97 
 
 		 307 aa  189  4e-47  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000422627  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4524  ribokinase  39.74 
 
 		 308 aa  189  5.999999999999999e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00216955  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4234  ribokinase  39.34 
 
 		 308 aa  188  1e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000102528  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1013  putative ribokinase protein  40.89 
 
 		 315 aa  188  1e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.340196  normal  0.195927 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1233  ribokinase  44.22 
 
 		 309 aa  187  2e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.567948  normal  0.0906963 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4897  ribokinase  40.13 
 
 		 318 aa  187  2e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00647815  hitchhiker  0.000000886041 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2471  ribokinase  42.03 
 
 		 297 aa  186  4e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3179  ribokinase  38.51 
 
 		 303 aa  186  4e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7361  ribokinase  39.02 
 
 		 308 aa  186  4e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4112  ribokinase  40.53 
 
 		 314 aa  186  5e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.137764  normal  0.0163752 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1312  ribokinase  42.47 
 
 		 299 aa  186  6e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1612  ribokinase family sugar kinase  34.93 
 
 		 340 aa  186  6e-46  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0874983  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2100  ribokinase  36.67 
 
 		 307 aa  184  1.0000000000000001e-45  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4641  ribokinase  39.73 
 
 		 298 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.184783  unclonable  5.38833e-26 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3307  ribokinase  39.19 
 
 		 303 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0646  ribokinase  39.19 
 
 		 303 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.497411 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2649  ribokinase  39.16 
 
 		 319 aa  184  2.0000000000000003e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000212257  normal  0.357458 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0794  ribokinase  40.68 
 
 		 298 aa  183  3e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00121525  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6290  ribokinase  36.93 
 
 		 320 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.631078 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0697  ribokinase  39.39 
 
 		 298 aa  182  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0813613  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0733  ribokinase  40.34 
 
 		 298 aa  182  6e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0722  ribokinase  39.73 
 
 		 298 aa  182  6e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.83177e-24 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1884  ribokinase  35.18 
 
 		 310 aa  182  7e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0118065  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4447  ribokinase  43.01 
 
 		 334 aa  182  7e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4171  ribokinase  39.07 
 
 		 310 aa  182  7e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000241058  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0632  ribokinase  39.73 
 
 		 298 aa  182  8.000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0665  ribokinase  39.73 
 
 		 298 aa  182  8.000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0576  ribokinase  39.73 
 
 		 298 aa  182  9.000000000000001e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2283  ribokinase  37.01 
 
 		 310 aa  181  1e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.269259 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1539  ribokinase  36.6 
 
 		 320 aa  181  1e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.385923  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2120  PfkB domain protein  37.88 
 
 		 290 aa  181  1e-44  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1285  ribokinase  36.64 
 
 		 307 aa  181  2e-44  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000150833  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>