More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_0354 on replicon NC_013525
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013525  Tter_0354  ribokinase  100 
 
 
308 aa  605  9.999999999999999e-173  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3869  ribokinase  47.83 
 
 
299 aa  255  8e-67  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.559054 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0344  ribokinase  46.05 
 
 
308 aa  249  3e-65  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3225  ribokinase  43.32 
 
 
311 aa  248  1e-64  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.195342  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1960  ribokinase  48.36 
 
 
302 aa  246  4e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0122509  normal  0.0586965 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1368  ribokinase  46.56 
 
 
305 aa  243  1.9999999999999999e-63  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.176905  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4209  ribokinase  46.25 
 
 
308 aa  242  6e-63  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.847437  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0008  ribokinase  46.25 
 
 
308 aa  242  7e-63  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0252287  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0008  ribokinase  46.25 
 
 
308 aa  242  7e-63  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000914124  normal  0.985734 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3488  ribokinase  47.02 
 
 
302 aa  242  7e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.232463  normal  0.188896 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2458  ribokinase  47.35 
 
 
302 aa  241  1e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3232  ribokinase  47.35 
 
 
302 aa  241  1e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.493529  normal  0.585828 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0162  ribokinase  44.44 
 
 
309 aa  241  1e-62  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0007  ribokinase  45.9 
 
 
306 aa  239  5e-62  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.328015  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0518  ribokinase  43.09 
 
 
307 aa  238  8e-62  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1980  ribokinase  46.89 
 
 
302 aa  235  7e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0225  ribokinase  44.55 
 
 
317 aa  233  4.0000000000000004e-60  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2526  ribokinase  46.23 
 
 
301 aa  231  9e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39280  ribokinase  44.69 
 
 
308 aa  230  2e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.145597  normal  0.325767 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06142  ribokinase  44.59 
 
 
305 aa  228  8e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0220  ribokinase  49.67 
 
 
305 aa  228  1e-58  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.328501  normal  0.180212 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2155  carbohydrate kinase, PfkB  43.14 
 
 
306 aa  228  1e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00604172  normal  0.881399 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1048  ribokinase  44.37 
 
 
301 aa  228  1e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3342  ribokinase  44.37 
 
 
308 aa  228  1e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.133779  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2909  ribokinase  46.36 
 
 
302 aa  225  6e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0179509 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0865  ribokinase  40.79 
 
 
305 aa  225  9e-58  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.657252 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3631  ribokinase  40.92 
 
 
304 aa  224  1e-57  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3974  ribokinase  43.93 
 
 
308 aa  224  2e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00187599  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000338  ribokinase  44.22 
 
 
305 aa  224  2e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4897  ribokinase  44.16 
 
 
318 aa  223  4e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00647815  hitchhiker  0.000000886041 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2689  ribokinase  37.79 
 
 
345 aa  222  6e-57  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2649  ribokinase  44.79 
 
 
319 aa  221  9e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000212257  normal  0.357458 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3332  ribokinase  45.87 
 
 
297 aa  221  9.999999999999999e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04580  Ribokinase  40 
 
 
306 aa  220  1.9999999999999999e-56  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39540  sugar kinase, ribokinase  48.18 
 
 
296 aa  220  1.9999999999999999e-56  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.893162 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2297  ribokinase  41.83 
 
 
309 aa  219  3.9999999999999997e-56  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0434925  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4160  ribokinase  43.05 
 
 
310 aa  219  5e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.233177 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3179  ribokinase  41.06 
 
 
303 aa  218  7.999999999999999e-56  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl642  ribokinase  38.44 
 
 
308 aa  218  1e-55  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3280  ribokinase  46.08 
 
 
305 aa  218  1e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1013  putative ribokinase protein  43.19 
 
 
315 aa  215  7e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.340196  normal  0.195927 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0558  PfkB domain protein  44.52 
 
 
295 aa  215  9e-55  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0576  putative ribokinase  43.71 
 
 
312 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.588326 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1507  ribokinase  46.15 
 
 
308 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0939  ribokinase  43.14 
 
 
302 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000942042  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1312  ribokinase  45.64 
 
 
299 aa  213  4.9999999999999996e-54  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1526  ribokinase  46.15 
 
 
308 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.395922  normal  0.909431 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1119  ribokinase  42.05 
 
 
302 aa  212  4.9999999999999996e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.970785  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4524  ribokinase  43.61 
 
 
308 aa  212  4.9999999999999996e-54  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00216955  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1612  ribokinase family sugar kinase  38.61 
 
 
340 aa  212  5.999999999999999e-54  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0874983  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3167  ribokinase  45.51 
 
 
295 aa  212  5.999999999999999e-54  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3771  ribokinase  43.05 
 
 
303 aa  212  7e-54  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1923  ribokinase  45.07 
 
 
305 aa  212  7e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.254632  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3648  ribokinase  42.38 
 
 
303 aa  212  7e-54  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.16351  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0659  ribokinase  43.05 
 
 
303 aa  212  7e-54  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4234  ribokinase  43.28 
 
 
308 aa  212  7.999999999999999e-54  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000102528  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3580  ribokinase  42.72 
 
 
303 aa  211  9e-54  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03638  ribokinase  44.59 
 
 
309 aa  211  1e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00223583  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4215  ribokinase  44.26 
 
 
309 aa  211  1e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4120  ribokinase  44.59 
 
 
314 aa  211  1e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.444588  normal  0.199768 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1888  PfkB  42.3 
 
 
323 aa  211  1e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.389987  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3765  ribokinase  47.49 
 
 
304 aa  211  1e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0637373 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1603  ribokinase  40.85 
 
 
310 aa  211  1e-53  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0000677641  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1343  ribokinase  45.36 
 
 
309 aa  211  1e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03583  hypothetical protein  44.59 
 
 
309 aa  211  1e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00147711  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1789  ribokinase  41.91 
 
 
297 aa  211  2e-53  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000225274  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2838  ribokinase  41.23 
 
 
314 aa  211  2e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.760591  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1539  ribokinase  42.19 
 
 
320 aa  210  2e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.385923  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4171  ribokinase  43.18 
 
 
310 aa  211  2e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000241058  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6290  ribokinase  42.19 
 
 
320 aa  210  2e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.631078 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5188  ribokinase  44.26 
 
 
314 aa  210  3e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.034479  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3968  ribokinase  44.26 
 
 
309 aa  209  3e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.112559  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4268  ribokinase  44.26 
 
 
309 aa  209  3e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00050994  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4242  ribokinase  44.26 
 
 
309 aa  209  3e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.459204  hitchhiker  0.00710658 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1383  ribokinase  45.03 
 
 
309 aa  210  3e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0252  ribokinase  42.76 
 
 
307 aa  209  4e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.377165  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4167  ribokinase  44.26 
 
 
309 aa  209  4e-53  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.895072  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4640  ribokinase  44.03 
 
 
305 aa  209  5e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.162899  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0749  ribokinase  38.82 
 
 
306 aa  208  7e-53  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00000000720941  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4749  ribokinase  45.51 
 
 
309 aa  207  1e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.396985 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0696  ribokinase  43.85 
 
 
304 aa  208  1e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1130  ribokinase  46.15 
 
 
311 aa  207  1e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1884  ribokinase  40.52 
 
 
310 aa  207  1e-52  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0118065  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1610  ribokinase  46.15 
 
 
311 aa  207  1e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.231434  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0691  ribokinase family sugar kinase  42.16 
 
 
303 aa  207  2e-52  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00280887  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4591  ribokinase  43.3 
 
 
295 aa  206  3e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1587  ribokinase  46.15 
 
 
311 aa  206  5e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.338475  normal  0.646425 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4112  ribokinase  43.61 
 
 
309 aa  206  6e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4277  ribokinase  43.61 
 
 
309 aa  205  7e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.136431  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4218  ribokinase  43.61 
 
 
309 aa  205  7e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.980767 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4168  ribokinase  43.61 
 
 
309 aa  205  7e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0200  ribokinase  44.19 
 
 
313 aa  205  9e-52  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.933367 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4097  ribokinase  44.59 
 
 
309 aa  204  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2371  ribokinase  44.44 
 
 
306 aa  203  2e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0559074  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4112  ribokinase  43.61 
 
 
314 aa  203  2e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.137764  normal  0.0163752 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3477  ribokinase  40.92 
 
 
303 aa  204  2e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4124  ribokinase  39.67 
 
 
306 aa  203  3e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4074  ribokinase  39.67 
 
 
306 aa  203  3e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.532803  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4019  ribokinase  39.67 
 
 
306 aa  203  3e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4182  ribokinase  39.67 
 
 
306 aa  203  3e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>