More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_04580 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011899  Hore_04580  Ribokinase  100 
 
 		 306 aa  620  1e-176  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3167  ribokinase  44.04 
 
 		 295 aa  236  4e-61  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2526  ribokinase  41.41 
 
 		 301 aa  230  2e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3342  ribokinase  39.4 
 
 		 308 aa  229  6e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.133779  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39280  ribokinase  38.74 
 
 		 308 aa  226  3e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.145597  normal  0.325767 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0733  ribokinase  42.23 
 
 		 298 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0560  ribokinase  40.88 
 
 		 298 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000679387  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4641  ribokinase  41.55 
 
 		 298 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.184783  unclonable  5.38833e-26 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0794  ribokinase  42.23 
 
 		 298 aa  220  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00121525  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3332  ribokinase  42.05 
 
 		 297 aa  219  3.9999999999999997e-56  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0722  ribokinase  41.89 
 
 		 298 aa  219  5e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.83177e-24 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0632  ribokinase  41.89 
 
 		 298 aa  219  6e-56  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0665  ribokinase  41.89 
 
 		 298 aa  219  6e-56  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0697  ribokinase  41.55 
 
 		 298 aa  219  6e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0813613  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3631  ribokinase  41 
 
 		 304 aa  218  7e-56  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0576  ribokinase  41.89 
 
 		 298 aa  218  7.999999999999999e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2155  carbohydrate kinase, PfkB  39.02 
 
 		 306 aa  218  7.999999999999999e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00604172  normal  0.881399 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0575  ribokinase  41.89 
 
 		 298 aa  218  8.999999999999998e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0579  ribokinase  41.3 
 
 		 298 aa  217  2e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2909  ribokinase  40.13 
 
 		 302 aa  217  2e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0179509 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0162  ribokinase  41.58 
 
 		 309 aa  216  2.9999999999999998e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4749  ribokinase  38.82 
 
 		 309 aa  215  5.9999999999999996e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.396985 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0344  ribokinase  38.89 
 
 		 308 aa  214  9.999999999999999e-55  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1960  ribokinase  38 
 
 		 302 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0122509  normal  0.0586965 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0354  ribokinase  40 
 
 		 308 aa  212  4.9999999999999996e-54  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1507  ribokinase  38.08 
 
 		 308 aa  212  7.999999999999999e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3869  ribokinase  40.2 
 
 		 299 aa  212  7.999999999999999e-54  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.559054 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3225  ribokinase  42.02 
 
 		 311 aa  211  1e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.195342  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3232  ribokinase  37.75 
 
 		 302 aa  210  2e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.493529  normal  0.585828 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2458  ribokinase  38.49 
 
 		 302 aa  210  2e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0518  ribokinase  37 
 
 		 307 aa  211  2e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3488  ribokinase  38.74 
 
 		 302 aa  210  3e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.232463  normal  0.188896 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1526  ribokinase  37.42 
 
 		 308 aa  208  8e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.395922  normal  0.909431 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2120  PfkB domain protein  38.72 
 
 		 290 aa  207  1e-52  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1923  ribokinase  38.96 
 
 		 305 aa  207  2e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.254632  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2689  ribokinase  36.66 
 
 		 345 aa  207  2e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4160  ribokinase  38.31 
 
 		 310 aa  207  2e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.233177 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1130  ribokinase  38 
 
 		 311 aa  205  9e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1610  ribokinase  38 
 
 		 311 aa  205  9e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.231434  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1368  ribokinase  37.87 
 
 		 305 aa  203  2e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.176905  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0576  putative ribokinase  38.33 
 
 		 312 aa  203  3e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.588326 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0225  ribokinase  37.38 
 
 		 317 aa  203  3e-51  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1013  putative ribokinase protein  37.67 
 
 		 315 aa  202  4e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.340196  normal  0.195927 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1587  ribokinase  38 
 
 		 311 aa  203  4e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.338475  normal  0.646425 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1343  ribokinase  36.75 
 
 		 309 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4897  ribokinase  38.82 
 
 		 318 aa  201  9.999999999999999e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00647815  hitchhiker  0.000000886041 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0252  ribokinase  39.74 
 
 		 307 aa  200  1.9999999999999998e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.377165  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1802  ribokinase family sugar kinase  37.79 
 
 		 306 aa  200  1.9999999999999998e-50  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00331295  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1789  ribokinase  40 
 
 		 297 aa  200  1.9999999999999998e-50  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000225274  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0943  ribokinase  38.38 
 
 		 321 aa  200  3e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.826251  normal  0.172047 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4209  ribokinase  38.28 
 
 		 308 aa  199  6e-50  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.847437  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1383  ribokinase  36.75 
 
 		 309 aa  199  7e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0008  ribokinase  38.28 
 
 		 308 aa  198  7.999999999999999e-50  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000914124  normal  0.985734 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4524  ribokinase  38.87 
 
 		 308 aa  198  7.999999999999999e-50  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00216955  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0008  ribokinase  38.28 
 
 		 308 aa  198  7.999999999999999e-50  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0252287  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0865  ribokinase  38.33 
 
 		 305 aa  198  1.0000000000000001e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.657252 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4591  ribokinase  37.72 
 
 		 295 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4640  ribokinase  37.04 
 
 		 305 aa  196  3e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.162899  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06142  ribokinase  37.54 
 
 		 305 aa  195  1e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1612  ribokinase family sugar kinase  35.76 
 
 		 340 aa  194  1e-48  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0874983  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4234  ribokinase  38.21 
 
 		 308 aa  194  1e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000102528  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2877  ribokinase-like domain-containing protein  37.79 
 
 		 300 aa  194  2e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.98714  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3765  ribokinase  37 
 
 		 304 aa  194  2e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0637373 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0878  ribokinase  37.67 
 
 		 321 aa  194  2e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0605401  normal  0.165576 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0200  ribokinase  37.66 
 
 		 313 aa  194  2e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.933367 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3280  ribokinase  36.79 
 
 		 305 aa  193  4e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3974  ribokinase  37.46 
 
 		 308 aa  193  4e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00187599  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2371  ribokinase  38.36 
 
 		 306 aa  192  6e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0559074  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000338  ribokinase  37.09 
 
 		 305 aa  192  6e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0558  PfkB domain protein  35.15 
 
 		 295 aa  192  8e-48  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0007  ribokinase  38.03 
 
 		 306 aa  192  8e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.328015  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0749  ribokinase  36.93 
 
 		 306 aa  192  9e-48  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00000000720941  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1980  ribokinase  37.5 
 
 		 302 aa  191  1e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1233  ribokinase  39.4 
 
 		 309 aa  187  3e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.567948  normal  0.0906963 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2471  ribokinase  37.5 
 
 		 297 aa  186  4e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1627  ribokinase  37.33 
 
 		 310 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4200  ribokinase  36.88 
 
 		 326 aa  184  1.0000000000000001e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7623  ribokinase  36.54 
 
 		 308 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.921063  normal  0.354799 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0253  ribokinase  34.98 
 
 		 304 aa  183  4.0000000000000006e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0259  ribokinase  34.98 
 
 		 304 aa  183  4.0000000000000006e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1285  ribokinase  34.62 
 
 		 307 aa  183  4.0000000000000006e-45  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000150833  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0220  ribokinase  36.79 
 
 		 305 aa  182  7e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.328501  normal  0.180212 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0118  ribokinase  34.54 
 
 		 303 aa  181  1e-44  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39540  sugar kinase, ribokinase  37.58 
 
 		 296 aa  181  1e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.893162 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4171  ribokinase  37.12 
 
 		 310 aa  181  2e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000241058  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4215  ribokinase  36 
 
 		 309 aa  180  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2100  ribokinase  35.35 
 
 		 307 aa  180  2.9999999999999997e-44  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl642  ribokinase  36.77 
 
 		 308 aa  180  2.9999999999999997e-44  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1312  ribokinase  38.54 
 
 		 299 aa  179  4e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03638  ribokinase  35.91 
 
 		 309 aa  178  9e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00223583  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03583  hypothetical protein  35.91 
 
 		 309 aa  178  9e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00147711  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4168  ribokinase  35 
 
 		 309 aa  177  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3968  ribokinase  35.91 
 
 		 309 aa  178  1e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.112559  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4097  ribokinase  35 
 
 		 309 aa  178  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4218  ribokinase  35 
 
 		 309 aa  177  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.980767 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4277  ribokinase  35 
 
 		 309 aa  177  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.136431  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4120  ribokinase  35.91 
 
 		 314 aa  178  1e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.444588  normal  0.199768 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4242  ribokinase  35.91 
 
 		 309 aa  178  1e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.459204  hitchhiker  0.00710658 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4268  ribokinase  35.91 
 
 		 309 aa  178  1e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00050994  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1871  ribokinase  37.83 
 
 		 324 aa  177  2e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.215166  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>