More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SaurJH1_0259 on replicon NC_009632
Organism: Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009632  SaurJH1_0259  ribokinase  100 
 
 		 304 aa  612  9.999999999999999e-175  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0253  ribokinase  100 
 
 		 304 aa  612  9.999999999999999e-175  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2100  ribokinase  65.22 
 
 		 307 aa  389  1e-107  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1612  ribokinase family sugar kinase  48.17 
 
 		 340 aa  289  4e-77  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0874983  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0556  ribokinase family sugar kinase  48.03 
 
 		 308 aa  285  9e-76  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.987541  hitchhiker  0.0000000000000234776 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0404  ribokinase  48.48 
 
 		 307 aa  271  7e-72  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000422627  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1285  ribokinase  47.18 
 
 		 307 aa  268  8.999999999999999e-71  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000150833  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1603  ribokinase  44.59 
 
 		 310 aa  252  6e-66  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0000677641  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1884  ribokinase  44.92 
 
 		 310 aa  252  7e-66  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0118065  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0225  ribokinase  44.41 
 
 		 317 aa  240  2e-62  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1368  ribokinase  44.52 
 
 		 305 aa  238  1e-61  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.176905  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4897  ribokinase  42.52 
 
 		 318 aa  237  2e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00647815  hitchhiker  0.000000886041 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0008  ribokinase  41.86 
 
 		 308 aa  234  1.0000000000000001e-60  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000914124  normal  0.985734 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4209  ribokinase  41.86 
 
 		 308 aa  234  1.0000000000000001e-60  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.847437  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3974  ribokinase  40.53 
 
 		 308 aa  234  1.0000000000000001e-60  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00187599  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0008  ribokinase  41.86 
 
 		 308 aa  234  1.0000000000000001e-60  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0252287  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000338  ribokinase  43.67 
 
 		 305 aa  232  5e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4524  ribokinase  42.52 
 
 		 308 aa  230  2e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00216955  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06142  ribokinase  43.52 
 
 		 305 aa  229  6e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0518  ribokinase  42.86 
 
 		 307 aa  227  2e-58  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4234  ribokinase  42.38 
 
 		 308 aa  226  3e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000102528  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0344  ribokinase  42.19 
 
 		 308 aa  225  9e-58  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0007  ribokinase  43.14 
 
 		 306 aa  224  2e-57  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.328015  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0794  ribokinase family sugar kinase  43.42 
 
 		 313 aa  224  2e-57  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0266657  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4168  ribokinase  41.41 
 
 		 309 aa  222  6e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4277  ribokinase  41.41 
 
 		 309 aa  222  6e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.136431  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4218  ribokinase  41.41 
 
 		 309 aa  222  6e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.980767 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4097  ribokinase  41.41 
 
 		 309 aa  222  7e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4112  ribokinase  41.41 
 
 		 309 aa  222  7e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03638  ribokinase  40.94 
 
 		 309 aa  220  3e-56  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00223583  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4120  ribokinase  40.94 
 
 		 314 aa  219  3e-56  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.444588  normal  0.199768 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03583  hypothetical protein  40.94 
 
 		 309 aa  220  3e-56  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00147711  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4215  ribokinase  40.6 
 
 		 309 aa  219  5e-56  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4171  ribokinase  40.2 
 
 		 310 aa  218  7.999999999999999e-56  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000241058  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5188  ribokinase  40.6 
 
 		 314 aa  218  8.999999999999998e-56  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.034479  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4242  ribokinase  40.6 
 
 		 309 aa  218  8.999999999999998e-56  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.459204  hitchhiker  0.00710658 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4167  ribokinase  40.6 
 
 		 309 aa  218  8.999999999999998e-56  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.895072  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3968  ribokinase  40.6 
 
 		 309 aa  218  8.999999999999998e-56  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.112559  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4268  ribokinase  40.6 
 
 		 309 aa  218  8.999999999999998e-56  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00050994  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1124  ribokinase  43.43 
 
 		 403 aa  216  2.9999999999999998e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2155  carbohydrate kinase, PfkB  40 
 
 		 306 aa  216  4e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00604172  normal  0.881399 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0691  ribokinase family sugar kinase  40.79 
 
 		 303 aa  214  9.999999999999999e-55  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00280887  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1048  ribokinase  40.79 
 
 		 301 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1980  ribokinase  40.07 
 
 		 302 aa  213  4.9999999999999996e-54  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4112  ribokinase  40.8 
 
 		 314 aa  212  7.999999999999999e-54  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.137764  normal  0.0163752 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4160  ribokinase  40.07 
 
 		 310 aa  211  1e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.233177 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1119  ribokinase  38.74 
 
 		 302 aa  209  5e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.970785  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1343  ribokinase  40.86 
 
 		 309 aa  209  6e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0576  putative ribokinase  39.4 
 
 		 312 aa  209  7e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.588326 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1383  ribokinase  40.67 
 
 		 309 aa  208  8e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1507  ribokinase  39.87 
 
 		 308 aa  207  1e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0696  ribokinase  40.13 
 
 		 304 aa  207  2e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3407  ribokinase  42.42 
 
 		 424 aa  207  2e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1526  ribokinase  39.87 
 
 		 308 aa  206  3e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.395922  normal  0.909431 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0939  ribokinase  40.07 
 
 		 302 aa  205  6e-52  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000942042  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1011  ribokinase-like domain-containing protein  41.41 
 
 		 398 aa  205  6e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3232  ribokinase  39.07 
 
 		 302 aa  205  7e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.493529  normal  0.585828 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1312  ribokinase  41.33 
 
 		 299 aa  204  2e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1960  ribokinase  38.41 
 
 		 302 aa  204  2e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0122509  normal  0.0586965 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3179  ribokinase  39.74 
 
 		 303 aa  202  4e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2909  ribokinase  40.13 
 
 		 302 aa  202  5e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0179509 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2837  ribokinase  38.94 
 
 		 302 aa  202  5e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0162  ribokinase  37.67 
 
 		 309 aa  202  8e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3869  ribokinase  39.13 
 
 		 299 aa  201  9.999999999999999e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.559054 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3225  ribokinase  38.69 
 
 		 311 aa  200  3e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.195342  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2458  ribokinase  38.82 
 
 		 302 aa  199  5e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4749  ribokinase  38.76 
 
 		 309 aa  199  5e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.396985 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39280  ribokinase  37.46 
 
 		 308 aa  199  5e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.145597  normal  0.325767 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3342  ribokinase  37.13 
 
 		 308 aa  198  9e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.133779  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3488  ribokinase  38.82 
 
 		 302 aa  196  3e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.232463  normal  0.188896 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0659  ribokinase  38.94 
 
 		 303 aa  196  4.0000000000000005e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3580  ribokinase  39.27 
 
 		 303 aa  196  4.0000000000000005e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3771  ribokinase  38.94 
 
 		 303 aa  196  4.0000000000000005e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0354  ribokinase  39.27 
 
 		 308 aa  196  6e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2649  ribokinase  38.17 
 
 		 319 aa  194  1e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000212257  normal  0.357458 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3631  ribokinase  37.37 
 
 		 304 aa  194  1e-48  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3648  ribokinase  38.94 
 
 		 303 aa  194  2e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.16351  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3477  ribokinase  39.47 
 
 		 303 aa  193  2e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2371  ribokinase  40.85 
 
 		 306 aa  193  4e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0559074  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3307  ribokinase  40.07 
 
 		 303 aa  192  5e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0646  ribokinase  40.07 
 
 		 303 aa  192  5e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.497411 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7623  ribokinase  38.54 
 
 		 308 aa  191  1e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.921063  normal  0.354799 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2526  ribokinase  38.54 
 
 		 301 aa  191  1e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2689  ribokinase  32.15 
 
 		 345 aa  189  5.999999999999999e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4182  ribokinase  34.65 
 
 		 306 aa  187  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4003  ribokinase  34.65 
 
 		 306 aa  187  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4124  ribokinase  34.65 
 
 		 306 aa  187  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4074  ribokinase  34.65 
 
 		 306 aa  187  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.532803  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4019  ribokinase  34.65 
 
 		 306 aa  187  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2297  ribokinase  36.42 
 
 		 309 aa  187  2e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0434925  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1587  ribokinase  37.83 
 
 		 311 aa  186  4e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.338475  normal  0.646425 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1923  ribokinase  38.36 
 
 		 305 aa  186  6e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.254632  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1130  ribokinase  37.83 
 
 		 311 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0749  ribokinase  35.15 
 
 		 306 aa  184  1.0000000000000001e-45  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00000000720941  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1610  ribokinase  37.83 
 
 		 311 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.231434  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4591  ribokinase  36.77 
 
 		 295 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2283  ribokinase  38.76 
 
 		 310 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.269259 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04580  Ribokinase  34.98 
 
 		 306 aa  183  4.0000000000000006e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0200  ribokinase  38.26 
 
 		 313 aa  182  5.0000000000000004e-45  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.933367 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0147  ribokinase family sugar kinase  48.02 
 
 		 208 aa  182  6e-45  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>