More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_0869 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009718  Fnod_0869  ribokinase-like domain-containing protein  100 
 
 		 290 aa  577  1.0000000000000001e-163  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3225  ribokinase  29.8 
 
 		 311 aa  131  1.0000000000000001e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.195342  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1140  ribokinase-like domain-containing protein  36.26 
 
 		 274 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2689  ribokinase  28.78 
 
 		 345 aa  127  3e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0253  ribokinase  29.33 
 
 		 304 aa  125  8.000000000000001e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0259  ribokinase  29.33 
 
 		 304 aa  125  8.000000000000001e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1117  ribokinase-like domain-containing protein  30 
 
 		 305 aa  125  8.000000000000001e-28  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.145837 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3196  ribokinase  25.93 
 
 		 316 aa  124  1e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.20247  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0041  ribokinase-like domain-containing protein  29.14 
 
 		 304 aa  124  2e-27  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4182  ribokinase  27.39 
 
 		 306 aa  121  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4074  ribokinase  27.39 
 
 		 306 aa  121  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.532803  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0749  ribokinase  28.62 
 
 		 306 aa  121  9.999999999999999e-27  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00000000720941  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4003  ribokinase  27.39 
 
 		 306 aa  121  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4124  ribokinase  27.39 
 
 		 306 aa  121  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4019  ribokinase  27.39 
 
 		 306 aa  121  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0147  ribokinase-like domain-containing protein  29.93 
 
 		 318 aa  119  7e-26  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.719935  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3631  ribokinase  30.92 
 
 		 304 aa  118  9.999999999999999e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1603  ribokinase  31.05 
 
 		 310 aa  117  1.9999999999999998e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0000677641  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1884  ribokinase  31.37 
 
 		 310 aa  116  3.9999999999999997e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0118065  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0354  ribokinase  26.94 
 
 		 308 aa  115  6e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2100  ribokinase  29.61 
 
 		 307 aa  114  2.0000000000000002e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3232  ribokinase  24.83 
 
 		 302 aa  112  6e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.493529  normal  0.585828 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1976  putative ribokinase  25.42 
 
 		 305 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.191043  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2526  ribokinase  28.28 
 
 		 301 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0005  ribokinase, putative  28.95 
 
 		 313 aa  110  3e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0831175  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04580  Ribokinase  30.43 
 
 		 306 aa  110  3e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3332  ribokinase  29.63 
 
 		 297 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0078  ribokinase-like domain-containing protein  29.37 
 
 		 302 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7448  cyclic nucleotide-binding protein  27.18 
 
 		 314 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0344  ribokinase  30.19 
 
 		 308 aa  108  1e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1119  ribokinase-like domain-containing protein  28.84 
 
 		 322 aa  108  1e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0560  ribokinase  27.8 
 
 		 298 aa  107  2e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000679387  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3869  ribokinase  27.05 
 
 		 299 aa  107  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.559054 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0162  ribokinase  26.42 
 
 		 309 aa  107  2e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1789  ribokinase  27.55 
 
 		 297 aa  107  3e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000225274  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3350  hypothetical protein  28.43 
 
 		 315 aa  107  3e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.373497 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3488  ribokinase  24.5 
 
 		 302 aa  106  4e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.232463  normal  0.188896 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1368  ribokinase  29.06 
 
 		 305 aa  106  5e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.176905  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1507  ribokinase  26.17 
 
 		 308 aa  105  6e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3342  ribokinase  23.67 
 
 		 308 aa  105  8e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.133779  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3167  ribokinase  28.33 
 
 		 295 aa  105  9e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2458  ribokinase  23.83 
 
 		 302 aa  105  1e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39280  ribokinase  23.67 
 
 		 308 aa  105  1e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.145597  normal  0.325767 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1923  ribokinase  26.58 
 
 		 305 aa  104  2e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.254632  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0865  ribokinase  26.95 
 
 		 305 aa  104  2e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.657252 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1960  ribokinase  24.32 
 
 		 302 aa  103  2e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0122509  normal  0.0586965 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1285  ribokinase  27.42 
 
 		 307 aa  103  3e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000150833  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1612  ribokinase family sugar kinase  28.38 
 
 		 340 aa  103  3e-21  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0874983  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2909  ribokinase  26.8 
 
 		 302 aa  103  4e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0179509 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4013  ribokinase-like domain-containing protein  28.3 
 
 		 315 aa  102  5e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1526  ribokinase  25.5 
 
 		 308 aa  102  6e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.395922  normal  0.909431 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2155  carbohydrate kinase, PfkB  25.49 
 
 		 306 aa  102  6e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00604172  normal  0.881399 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0579  ribokinase  26.71 
 
 		 298 aa  102  9e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2283  ribokinase  26.67 
 
 		 310 aa  101  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.269259 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7361  ribokinase  28.52 
 
 		 308 aa  101  1e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0671  PfkB domain protein  29.49 
 
 		 307 aa  101  1e-20  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4641  ribokinase  27.21 
 
 		 298 aa  102  1e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.184783  unclonable  5.38833e-26 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0558  PfkB domain protein  23.21 
 
 		 295 aa  100  2e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0070  ribokinase-like domain-containing protein  29.7 
 
 		 305 aa  101  2e-20  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.60231  normal  0.104072 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0697  ribokinase  27.4 
 
 		 298 aa  100  3e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0813613  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1214  ribokinase-like domain-containing protein  27.11 
 
 		 329 aa  100  3e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3738  carbohydrate kinase  28.25 
 
 		 315 aa  100  4e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0822309  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3470  ribokinase  28.25 
 
 		 315 aa  100  4e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.973567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3280  ribokinase  26.58 
 
 		 305 aa  100  4e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0616  ribokinase-like domain-containing protein  27.99 
 
 		 315 aa  99.4  6e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00109848  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0404  ribokinase  28.42 
 
 		 307 aa  99.4  6e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000422627  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1142  PfkB  25.81 
 
 		 310 aa  99.4  7e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0676537  normal  0.093061 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0575  ribokinase  27.4 
 
 		 298 aa  98.2  1e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06142  ribokinase  29.32 
 
 		 305 aa  98.6  1e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0722  ribokinase  27.05 
 
 		 298 aa  98.2  1e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.83177e-24 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2014  PfkB domain protein  24.92 
 
 		 324 aa  98.2  1e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0987  ribokinase  27.4 
 
 		 293 aa  97.4  2e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.135221  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0733  ribokinase  26.71 
 
 		 298 aa  97.4  2e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0576  ribokinase  27.05 
 
 		 298 aa  98.2  2e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4749  ribokinase  24.41 
 
 		 309 aa  97.8  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.396985 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4447  ribokinase  28.63 
 
 		 334 aa  98.2  2e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0632  ribokinase  26.71 
 
 		 298 aa  97.4  3e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0665  ribokinase  26.71 
 
 		 298 aa  97.4  3e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2121  PfkB  24.75 
 
 		 307 aa  97.1  3e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.987568  normal  0.281407 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0937  PfkB domain protein  24.84 
 
 		 338 aa  97.1  3e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2120  PfkB domain protein  27.4 
 
 		 290 aa  97.1  3e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0252  ribokinase  26.45 
 
 		 307 aa  96.7  4e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.377165  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4349  kinase, PfkB family  27.46 
 
 		 298 aa  96.7  4e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000338  ribokinase  27.27 
 
 		 305 aa  96.7  4e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0635  ribokinase-like domain-containing protein  27.36 
 
 		 315 aa  96.7  4e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.377528  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0276  PfkB domain protein  30.36 
 
 		 304 aa  96.7  4e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0140  PfkB domain protein  24.53 
 
 		 326 aa  96.7  4e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4140  ribokinase-like domain-containing protein  28.33 
 
 		 298 aa  96.3  5e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.682006  normal  0.581205 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4103  PfkB family kinase  28.33 
 
 		 298 aa  96.3  5e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0794  ribokinase  26.71 
 
 		 298 aa  96.3  5e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00121525  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0389  PfkB  25.68 
 
 		 323 aa  95.9  6e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.211683  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3455  ribokinase-like domain-containing protein  25.61 
 
 		 326 aa  95.9  7e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.84523  normal  0.0336691 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0820  ribokinase-like domain-containing protein  25.08 
 
 		 364 aa  95.9  7e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.501006  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0954  PfkB domain protein  26.5 
 
 		 321 aa  95.9  8e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.102628  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1622  PfkB domain protein  29.1 
 
 		 297 aa  95.9  8e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1649  ribokinase-like domain-containing protein  28.79 
 
 		 308 aa  95.9  8e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0416676  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0716  fructokinase  25.08 
 
 		 313 aa  95.5  9e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0666  fructokinase  25.08 
 
 		 313 aa  95.5  9e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0752  fructokinase  25.08 
 
 		 313 aa  95.5  9e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2764  PfkB domain protein  27.47 
 
 		 289 aa  95.1  1e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.11778  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>