More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECD_02089 on replicon CP001509
Organism: Escherichia coli BL21(DE3)



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_02089  predicted kinase  100 
 
 		 362 aa  749    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.114091  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1498  PfkB domain protein  99.45 
 
 		 362 aa  746    Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000282324  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1488  hypothetical protein  100 
 
 		 362 aa  749    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000467798  hitchhiker  0.00751025 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3296  hypothetical protein  98.07 
 
 		 362 aa  735    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.170772  normal  0.250376 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2307  hypothetical protein  98.07 
 
 		 362 aa  734    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.945779  hitchhiker  0.00150581 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0806  hypothetical protein  100 
 
 		 362 aa  749    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02048  hypothetical protein  100 
 
 		 362 aa  749    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0826049  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2296  hypothetical protein  100 
 
 		 362 aa  749    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2951  ribokinase-like domain-containing protein  44.16 
 
 		 363 aa  296  3e-79  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1351  ribokinase-like domain-containing protein  43.3 
 
 		 374 aa  292  6e-78  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.759267  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1445  ribokinase-like domain-containing protein  44.03 
 
 		 363 aa  285  5.999999999999999e-76  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2725  ribokinase-like domain-containing protein  43.02 
 
 		 363 aa  283  2.0000000000000002e-75  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000788266 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0258  ribokinase-like domain-containing protein  39.34 
 
 		 380 aa  248  1e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3302  hypothetical protein  39.74 
 
 		 313 aa  230  2e-59  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0135155  normal  0.0377447 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2313  hypothetical protein  39.68 
 
 		 313 aa  229  4e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0218939  decreased coverage  0.000211753 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2463  hypothetical protein  39.74 
 
 		 313 aa  229  6e-59  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0259659  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02095  predicted kinase  39.74 
 
 		 313 aa  228  1e-58  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.308891  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1482  hypothetical protein  39.74 
 
 		 313 aa  228  1e-58  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0391896  hitchhiker  0.00000306075 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02054  hypothetical protein  39.74 
 
 		 313 aa  228  1e-58  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.272027  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2303  hypothetical protein  39.74 
 
 		 313 aa  228  1e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0379956  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1913  PfkB domain protein  33.33 
 
 		 363 aa  227  3e-58  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.154738  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0139  transcriptional regulator, MarR family  36.87 
 
 		 360 aa  227  3e-58  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1492  PfkB domain protein  39.41 
 
 		 313 aa  226  5.0000000000000005e-58  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.104134  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4622  ribokinase-like domain-containing protein  36.36 
 
 		 369 aa  188  1e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0428968  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0358  PfkB  37.05 
 
 		 377 aa  174  1.9999999999999998e-42  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.660775  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0317  kinase, PfkB family  30.83 
 
 		 382 aa  165  1.0000000000000001e-39  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.196123 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0555  PfkB domain protein  32.37 
 
 		 306 aa  155  1e-36  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1032  ribokinase-like domain-containing protein  31.44 
 
 		 318 aa  154  2e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000268353  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1461  kinase yeiC, putative  28.43 
 
 		 321 aa  140  3e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0117652  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0294  ribokinase-like domain-containing protein  31.02 
 
 		 372 aa  140  3e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0301  ribokinase-like domain-containing protein  31.02 
 
 		 372 aa  140  3e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1733  PfkB family kinase  28.43 
 
 		 321 aa  140  3.9999999999999997e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000174723  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3467  ribokinase-like domain-containing protein  30.63 
 
 		 312 aa  136  5e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0663  PfkB domain protein  28.52 
 
 		 315 aa  129  6e-29  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3923  ribokinase-like domain-containing protein  28.97 
 
 		 314 aa  123  5e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3222  ribokinase-like domain-containing protein  27.93 
 
 		 314 aa  118  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.830633  normal  0.0230782 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2164  PfkB domain protein  29.35 
 
 		 313 aa  114  3e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0899  ribokinase-like domain-containing protein  25.74 
 
 		 307 aa  105  8e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1264  hypothetical protein  25.64 
 
 		 321 aa  99  1e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1013  putative ribokinase protein  28.17 
 
 		 315 aa  83.6  0.000000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.340196  normal  0.195927 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2170  PfkB domain protein  27.78 
 
 		 314 aa  83.6  0.000000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.68008  normal  0.0885177 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1960  ribokinase  27.36 
 
 		 302 aa  83.2  0.000000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0122509  normal  0.0586965 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1959  PfkB domain protein  28.39 
 
 		 314 aa  82.8  0.000000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.13744 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0943  ribokinase  28.31 
 
 		 321 aa  82.4  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.826251  normal  0.172047 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3631  ribokinase  24.16 
 
 		 304 aa  81.3  0.00000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3488  ribokinase  29 
 
 		 302 aa  80.5  0.00000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.232463  normal  0.188896 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0162  ribokinase  25.52 
 
 		 309 aa  80.1  0.00000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1264  PfkB  29.41 
 
 		 313 aa  79.7  0.00000000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2458  ribokinase  28.43 
 
 		 302 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3196  ribokinase  26.49 
 
 		 316 aa  76.3  0.0000000000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.20247  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1282  putative ribokinase  26.04 
 
 		 345 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.331017 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3232  ribokinase  28.28 
 
 		 302 aa  75.1  0.000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.493529  normal  0.585828 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3225  ribokinase  21.52 
 
 		 311 aa  72.8  0.000000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.195342  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7448  cyclic nucleotide-binding protein  26.88 
 
 		 314 aa  72  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0878  ribokinase  26.92 
 
 		 321 aa  70.5  0.00000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0605401  normal  0.165576 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1649  ribokinase-like domain-containing protein  29.9 
 
 		 308 aa  70.9  0.00000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0416676  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2559  carbohydrate kinase  27.27 
 
 		 321 aa  69.7  0.00000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.270626  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0344  ribokinase  25.52 
 
 		 308 aa  69.7  0.00000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3167  ribokinase  25.98 
 
 		 295 aa  69.3  0.0000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39280  ribokinase  26.69 
 
 		 308 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.145597  normal  0.325767 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3280  ribokinase  28.47 
 
 		 305 aa  68.2  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2057  PfkB family kinase  24.52 
 
 		 315 aa  67.8  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.124987  normal  0.010035 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0518  ribokinase  23.76 
 
 		 307 aa  67.8  0.0000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4160  ribokinase  24.58 
 
 		 310 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.233177 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4215  ribokinase  23.68 
 
 		 309 aa  67  0.0000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4209  ribokinase  25.18 
 
 		 308 aa  67  0.0000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.847437  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03638  ribokinase  23.66 
 
 		 309 aa  66.6  0.0000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00223583  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0008  ribokinase  25.18 
 
 		 308 aa  66.6  0.0000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000914124  normal  0.985734 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03583  hypothetical protein  23.66 
 
 		 309 aa  66.6  0.0000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00147711  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1233  ribokinase  28.47 
 
 		 309 aa  66.6  0.0000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.567948  normal  0.0906963 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0008  ribokinase  25.18 
 
 		 308 aa  66.6  0.0000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0252287  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4120  ribokinase  23.66 
 
 		 314 aa  66.6  0.0000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.444588  normal  0.199768 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3342  ribokinase  26.69 
 
 		 308 aa  66.6  0.0000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.133779  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1980  ribokinase  23.13 
 
 		 302 aa  65.5  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1368  ribokinase  24.47 
 
 		 305 aa  65.5  0.000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.176905  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0576  putative ribokinase  25.89 
 
 		 312 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.588326 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4268  ribokinase  23.28 
 
 		 309 aa  65.9  0.000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00050994  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5188  ribokinase  23.28 
 
 		 314 aa  65.9  0.000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.034479  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3968  ribokinase  23.28 
 
 		 309 aa  65.9  0.000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.112559  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4242  ribokinase  23.28 
 
 		 309 aa  65.9  0.000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.459204  hitchhiker  0.00710658 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4167  ribokinase  23.28 
 
 		 309 aa  65.5  0.000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.895072  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1419  PfkB family kinase  24.81 
 
 		 315 aa  65.5  0.000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.997387  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1856  PfkB family kinase  24.81 
 
 		 315 aa  65.5  0.000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0158072  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0560  ribokinase  23.45 
 
 		 298 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000679387  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4171  ribokinase  24.43 
 
 		 310 aa  64.7  0.000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000241058  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1870  PfkB domain protein  24.44 
 
 		 315 aa  64.3  0.000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0114143  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06142  ribokinase  23.32 
 
 		 305 aa  64.3  0.000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1996  PfkB family kinase  24.44 
 
 		 315 aa  64.3  0.000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01741  predicted kinase  24.44 
 
 		 315 aa  63.5  0.000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01729  hypothetical protein  24.44 
 
 		 315 aa  63.5  0.000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1507  ribokinase  25.86 
 
 		 308 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1860  ribokinase-like domain-containing protein  24.06 
 
 		 315 aa  63.2  0.000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.335723  decreased coverage  0.00000390561 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1812  ribokinase-like domain-containing protein  34.62 
 
 		 301 aa  63.2  0.000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0916129  decreased coverage  0.00793411 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1030  ribokinase-like domain-containing protein  26.12 
 
 		 316 aa  63.2  0.000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.791095 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0733  ribokinase  22.18 
 
 		 298 aa  63.2  0.000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3974  ribokinase  23.16 
 
 		 308 aa  63.2  0.000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00187599  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000338  ribokinase  24.2 
 
 		 305 aa  62.8  0.000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3332  ribokinase  23.94 
 
 		 297 aa  62.8  0.000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2689  ribokinase  23.75 
 
 		 345 aa  62  0.00000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3738  ribokinase  22.86 
 
 		 404 aa  62.8  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>