More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_3167 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012793  GWCH70_3167  ribokinase  100 
 
 		 295 aa  593  1e-168  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3332  ribokinase  74.24 
 
 		 297 aa  433  1e-120  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0560  ribokinase  51.9 
 
 		 298 aa  302  5.000000000000001e-81  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000679387  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4641  ribokinase  51.9 
 
 		 298 aa  298  8e-80  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.184783  unclonable  5.38833e-26 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0632  ribokinase  52.25 
 
 		 298 aa  297  2e-79  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0665  ribokinase  52.25 
 
 		 298 aa  297  2e-79  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0733  ribokinase  51.9 
 
 		 298 aa  296  3e-79  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0722  ribokinase  51.9 
 
 		 298 aa  296  3e-79  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.83177e-24 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0697  ribokinase  51.9 
 
 		 298 aa  296  4e-79  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0813613  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0575  ribokinase  51.56 
 
 		 298 aa  295  5e-79  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0794  ribokinase  51.9 
 
 		 298 aa  295  5e-79  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00121525  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0576  ribokinase  51.56 
 
 		 298 aa  294  1e-78  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0579  ribokinase  51.9 
 
 		 298 aa  294  1e-78  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2526  ribokinase  48.82 
 
 		 301 aa  273  2.0000000000000002e-72  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1802  ribokinase family sugar kinase  46.98 
 
 		 306 aa  246  3e-64  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00331295  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04580  Ribokinase  44.04 
 
 		 306 aa  244  1.9999999999999999e-63  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0518  ribokinase  43.42 
 
 		 307 aa  241  7e-63  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2689  ribokinase  41.72 
 
 		 345 aa  235  8e-61  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4591  ribokinase  46.21 
 
 		 295 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3869  ribokinase  46.28 
 
 		 299 aa  231  1e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.559054 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1368  ribokinase  45.03 
 
 		 305 aa  230  2e-59  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.176905  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2909  ribokinase  46.31 
 
 		 302 aa  229  5e-59  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0179509 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0118  ribokinase  42.76 
 
 		 303 aa  228  7e-59  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39280  ribokinase  44.74 
 
 		 308 aa  226  3e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.145597  normal  0.325767 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0162  ribokinase  43.38 
 
 		 309 aa  226  3e-58  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0344  ribokinase  43.19 
 
 		 308 aa  226  4e-58  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1383  ribokinase  45.48 
 
 		 309 aa  225  8e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1343  ribokinase  45.82 
 
 		 309 aa  225  8e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3342  ribokinase  43.93 
 
 		 308 aa  224  1e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.133779  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3974  ribokinase  43.93 
 
 		 308 aa  224  1e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00187599  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0225  ribokinase  41.82 
 
 		 317 aa  222  4.9999999999999996e-57  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06142  ribokinase  43.19 
 
 		 305 aa  219  3e-56  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7623  ribokinase  46.33 
 
 		 308 aa  218  7e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.921063  normal  0.354799 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000338  ribokinase  43.48 
 
 		 305 aa  217  2e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2155  carbohydrate kinase, PfkB  45.48 
 
 		 306 aa  217  2e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00604172  normal  0.881399 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0252  ribokinase  44.04 
 
 		 307 aa  217  2e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.377165  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0008  ribokinase  43.52 
 
 		 308 aa  216  2.9999999999999998e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0252287  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0008  ribokinase  43.52 
 
 		 308 aa  216  2.9999999999999998e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000914124  normal  0.985734 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3225  ribokinase  43.71 
 
 		 311 aa  216  4e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.195342  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4209  ribokinase  43.52 
 
 		 308 aa  216  4e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.847437  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1960  ribokinase  43.43 
 
 		 302 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0122509  normal  0.0586965 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4897  ribokinase  41.83 
 
 		 318 aa  213  2.9999999999999995e-54  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00647815  hitchhiker  0.000000886041 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0007  ribokinase  43.23 
 
 		 306 aa  213  3.9999999999999995e-54  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.328015  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1013  putative ribokinase protein  44.93 
 
 		 315 aa  212  5.999999999999999e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.340196  normal  0.195927 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0354  ribokinase  45.51 
 
 		 308 aa  212  5.999999999999999e-54  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3232  ribokinase  42.23 
 
 		 302 aa  211  7.999999999999999e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.493529  normal  0.585828 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0558  PfkB domain protein  43.45 
 
 		 295 aa  211  9e-54  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2458  ribokinase  43.29 
 
 		 302 aa  211  1e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3280  ribokinase  45.03 
 
 		 305 aa  211  1e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3488  ribokinase  43.48 
 
 		 302 aa  209  3e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.232463  normal  0.188896 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2120  PfkB domain protein  42.56 
 
 		 290 aa  209  4e-53  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3631  ribokinase  40.67 
 
 		 304 aa  209  4e-53  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0200  ribokinase  45.63 
 
 		 313 aa  209  4e-53  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.933367 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6608  ribokinase  44.19 
 
 		 308 aa  206  5e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.487327  normal  0.393887 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3765  ribokinase  45.76 
 
 		 304 aa  205  6e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0637373 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4171  ribokinase  41.31 
 
 		 310 aa  205  6e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000241058  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5761  ribokinase  44.19 
 
 		 308 aa  205  7e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6126  ribokinase  44.19 
 
 		 308 aa  205  7e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.425434 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0987  ribokinase  42.86 
 
 		 293 aa  205  1e-51  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.135221  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4160  ribokinase  43.62 
 
 		 310 aa  203  2e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.233177 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4234  ribokinase  41 
 
 		 308 aa  202  4e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000102528  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4524  ribokinase  40.67 
 
 		 308 aa  201  9e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00216955  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2837  ribokinase  42.52 
 
 		 302 aa  201  9.999999999999999e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3179  ribokinase  39.93 
 
 		 303 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1980  ribokinase  40.53 
 
 		 302 aa  200  1.9999999999999998e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0576  putative ribokinase  44.3 
 
 		 312 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.588326 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0865  ribokinase  40.33 
 
 		 305 aa  200  1.9999999999999998e-50  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.657252 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0220  ribokinase  44.52 
 
 		 305 aa  200  1.9999999999999998e-50  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.328501  normal  0.180212 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2371  ribokinase  44 
 
 		 306 aa  200  3e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0559074  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4749  ribokinase  43.32 
 
 		 309 aa  199  5e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.396985 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0943  ribokinase  44.26 
 
 		 321 aa  199  5e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.826251  normal  0.172047 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1507  ribokinase  43.1 
 
 		 308 aa  199  6e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl642  ribokinase  37.5 
 
 		 308 aa  198  1.0000000000000001e-49  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1526  ribokinase  42.76 
 
 		 308 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.395922  normal  0.909431 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0276  PfkB domain protein  36.6 
 
 		 304 aa  196  5.000000000000001e-49  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1923  ribokinase  42.81 
 
 		 305 aa  195  6e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.254632  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39540  sugar kinase, ribokinase  44.59 
 
 		 296 aa  193  3e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.893162 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1130  ribokinase  43.77 
 
 		 311 aa  192  4e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1610  ribokinase  43.77 
 
 		 311 aa  192  4e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.231434  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4074  ribokinase  38.94 
 
 		 306 aa  192  5e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.532803  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4003  ribokinase  38.94 
 
 		 306 aa  192  5e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4124  ribokinase  38.94 
 
 		 306 aa  192  5e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4019  ribokinase  38.94 
 
 		 306 aa  192  5e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4182  ribokinase  38.94 
 
 		 306 aa  192  5e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0878  ribokinase  43.92 
 
 		 321 aa  192  7e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0605401  normal  0.165576 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4277  ribokinase  42.19 
 
 		 309 aa  191  9e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.136431  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4168  ribokinase  42.19 
 
 		 309 aa  191  9e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4218  ribokinase  42.19 
 
 		 309 aa  191  9e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.980767 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4097  ribokinase  41.53 
 
 		 309 aa  191  9e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0465  ribokinase  42 
 
 		 299 aa  191  2e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4112  ribokinase  41.2 
 
 		 309 aa  190  2.9999999999999997e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2649  ribokinase  38.29 
 
 		 319 aa  189  4e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000212257  normal  0.357458 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03638  ribokinase  41.81 
 
 		 309 aa  189  5e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00223583  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03583  hypothetical protein  41.81 
 
 		 309 aa  189  5e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00147711  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1587  ribokinase  43.43 
 
 		 311 aa  189  5e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.338475  normal  0.646425 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1976  putative ribokinase  40.33 
 
 		 305 aa  189  5.999999999999999e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.191043  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6290  ribokinase  40.92 
 
 		 320 aa  188  8e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.631078 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1539  ribokinase  40.92 
 
 		 320 aa  188  9e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.385923  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4242  ribokinase  41.47 
 
 		 309 aa  187  1e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.459204  hitchhiker  0.00710658 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4268  ribokinase  41.47 
 
 		 309 aa  187  1e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00050994  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>