More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_1649 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008698  Tpen_1649  ribokinase-like domain-containing protein  100 
 
 
308 aa  612  9.999999999999999e-175  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0416676  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1117  ribokinase-like domain-containing protein  33.77 
 
 
305 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.145837 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0752  ribokinase-like domain-containing protein  34.59 
 
 
310 aa  129  5.0000000000000004e-29  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1736  PfkB domain protein  34.6 
 
 
304 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0185  ribokinase  30.33 
 
 
291 aa  125  1e-27  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.00000069064  normal  0.0609987 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0041  ribokinase-like domain-containing protein  32.57 
 
 
304 aa  125  1e-27  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2483  PfkB domain protein  33.44 
 
 
302 aa  124  2e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0569  PfkB domain protein  32.78 
 
 
295 aa  123  5e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0147  ribokinase-like domain-containing protein  32.25 
 
 
318 aa  122  5e-27  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.719935  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0735  PfkB domain-containing protein  35.25 
 
 
317 aa  122  9.999999999999999e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.263465  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2764  PfkB domain protein  34.12 
 
 
289 aa  118  9.999999999999999e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.11778  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0078  ribokinase-like domain-containing protein  30.26 
 
 
302 aa  118  9.999999999999999e-26  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2902  PfkB  34.52 
 
 
345 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.358173  normal  0.264738 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2704  PfkB domain protein  32.96 
 
 
317 aa  112  6e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0070  ribokinase-like domain-containing protein  31.67 
 
 
305 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.60231  normal  0.104072 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3455  ribokinase-like domain-containing protein  29.39 
 
 
326 aa  111  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.84523  normal  0.0336691 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2461  ribokinase-like domain-containing protein  35.31 
 
 
316 aa  110  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.281644  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1612  ribokinase family sugar kinase  28.66 
 
 
340 aa  110  2.0000000000000002e-23  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0874983  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1201  ribokinase-like domain-containing protein  29.37 
 
 
298 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1119  ribokinase-like domain-containing protein  30.7 
 
 
322 aa  110  3e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0354  ribokinase  33.7 
 
 
308 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0967  cytidine kinase / inosine-guanosine kinase  28.25 
 
 
300 aa  109  6e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0230959  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0253  ribokinase  28.66 
 
 
304 aa  107  2e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0259  ribokinase  28.66 
 
 
304 aa  107  2e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2594  PfkB  34.87 
 
 
319 aa  107  2e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.2534  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0902  PfkB domain protein  30.26 
 
 
309 aa  107  3e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1366  ribokinase-like domain-containing protein  32.47 
 
 
320 aa  106  5e-22  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2652  PfkB domain protein  34.07 
 
 
316 aa  106  6e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3225  ribokinase  30.34 
 
 
311 aa  105  8e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.195342  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1884  ribokinase  27.88 
 
 
310 aa  105  8e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0118065  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0404  ribokinase  30.1 
 
 
307 aa  105  8e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000422627  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2556  PfkB domain protein  34.17 
 
 
316 aa  105  1e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0308577  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3232  ribokinase  32.96 
 
 
302 aa  105  1e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.493529  normal  0.585828 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0865  ribokinase  30.03 
 
 
305 aa  105  1e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.657252 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0162  ribokinase  31.27 
 
 
309 aa  105  1e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2905  aminoimidazole riboside kinase  36.13 
 
 
306 aa  104  2e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00998461  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1304  carbohydrate kinase, PfkB  33.86 
 
 
316 aa  103  3e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06142  ribokinase  29.11 
 
 
305 aa  103  4e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2270  PfkB domain protein  34.68 
 
 
387 aa  102  6e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0793911 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3707  ribokinase-like domain-containing protein  30.93 
 
 
319 aa  102  6e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.973516 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04580  Ribokinase  31.16 
 
 
306 aa  102  8e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3180  ribokinase-like domain-containing protein  32.94 
 
 
322 aa  102  1e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.714221  normal  0.0291745 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1746  ribokinase-like domain-containing protein  32.06 
 
 
330 aa  102  1e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.931195 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4524  ribokinase  27.97 
 
 
308 aa  101  1e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00216955  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1526  ribokinase-like domain-containing protein  32.6 
 
 
328 aa  102  1e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.198304  normal  0.764115 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1214  ribokinase-like domain-containing protein  33.57 
 
 
329 aa  102  1e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0987  ribokinase  31.37 
 
 
293 aa  101  2e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.135221  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1416  ribokinase-like domain-containing protein  28.76 
 
 
302 aa  101  2e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0954  PfkB domain protein  26.91 
 
 
321 aa  101  2e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.102628  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3974  ribokinase  27.78 
 
 
308 aa  100  2e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00187599  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6346  PfkB  32.06 
 
 
330 aa  101  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2407  ribokinase-like domain-containing protein  29.11 
 
 
319 aa  100  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1368  ribokinase  29.32 
 
 
305 aa  101  2e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.176905  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1733  ribokinase-like domain-containing protein  32.06 
 
 
330 aa  101  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2283  ribokinase  30.53 
 
 
310 aa  101  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.269259 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2306  PfkB family kinase  29.11 
 
 
319 aa  100  3e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1282  putative ribokinase  33.11 
 
 
345 aa  100  3e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.331017 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0616  ribokinase-like domain-containing protein  31.05 
 
 
315 aa  100  3e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00109848  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1603  ribokinase  27.24 
 
 
310 aa  100  3e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0000677641  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3998  ribokinase-like domain-containing protein  32.94 
 
 
308 aa  100  3e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0662614  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2458  ribokinase  31.85 
 
 
302 aa  100  4e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3290  PfkB domain protein  31.82 
 
 
320 aa  100  4e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3755  PfkB domain protein  32.23 
 
 
307 aa  100  4e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0212856  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26890  2-ketogluconate kinase  34.02 
 
 
314 aa  99.8  5e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00940196  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0389  PfkB  30 
 
 
323 aa  100  5e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.211683  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2296  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  35.9 
 
 
329 aa  99.4  6e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2100  ribokinase  28.52 
 
 
307 aa  99.4  7e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5029  ribokinase family sugar kinase  32.4 
 
 
330 aa  99.4  7e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.351369 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4404  ribokinase-like domain-containing protein  28.57 
 
 
322 aa  99  8e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.168915  normal  0.135313 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0351  aminoimidazole riboside kinase  32.71 
 
 
307 aa  99  8e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.735787  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1980  ribokinase  30.88 
 
 
302 aa  99  8e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0162  carbohydrate kinase  28.84 
 
 
330 aa  98.6  1e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.98466  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0169  carbohydrate kinase  28.84 
 
 
330 aa  98.6  1e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2964  PfkB domain protein  32.78 
 
 
323 aa  98.2  1e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.330402  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1580  ribokinase-like domain-containing protein  31.31 
 
 
309 aa  98.6  1e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0863941  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0635  ribokinase-like domain-containing protein  31.37 
 
 
315 aa  99  1e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.377528  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3538  PfkB domain protein  29.39 
 
 
310 aa  98.6  1e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000797657  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7361  ribokinase  32.26 
 
 
308 aa  97.8  2e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0059  ribokinase-like domain-containing protein  32.97 
 
 
319 aa  97.8  2e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2288  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  34.89 
 
 
329 aa  97.8  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3350  hypothetical protein  31.75 
 
 
315 aa  97.4  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.373497 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3407  ribokinase  28.81 
 
 
424 aa  97.8  2e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2154  putative 2-keto-gluconokinase  34.89 
 
 
329 aa  97.8  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.376694  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2647  aminoimidazole riboside kinase  33.33 
 
 
304 aa  97.4  3e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0615  PfkB  28.01 
 
 
317 aa  97.4  3e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5091  PfkB  32.92 
 
 
309 aa  97.1  3e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.170499  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000338  ribokinase  29.13 
 
 
305 aa  97.1  3e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1285  ribokinase  27.96 
 
 
307 aa  97.4  3e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000150833  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1498  PfkB domain protein  32.82 
 
 
300 aa  97.4  3e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2057  PfkB family kinase  28.29 
 
 
315 aa  96.7  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.124987  normal  0.010035 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3592  aminoimidazole riboside kinase  32.49 
 
 
304 aa  96.7  4e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000158875 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0600  aminoimidazole riboside kinase  29.74 
 
 
323 aa  96.7  4e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1406  ribokinase-like domain-containing protein  28.96 
 
 
302 aa  97.1  4e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4234  ribokinase  28.06 
 
 
308 aa  97.1  4e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000102528  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0178  ribokinase-like domain-containing protein  27.86 
 
 
331 aa  97.1  4e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.613115  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2001  PfkB domain protein  31.46 
 
 
321 aa  96.7  5e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2413  PfkB domain protein  30.03 
 
 
642 aa  96.3  5e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0502  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  29.47 
 
 
320 aa  96.7  5e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4023  PfkB  31.54 
 
 
311 aa  96.3  6e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.102186  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1220  cytidine kinase / inosine-guanosine kinase  27.42 
 
 
302 aa  96.3  6e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.515057  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>