35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_0348 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013202  Hmuk_0348  transcriptional regulator, ArsR family  100 
 
 		 176 aa  352  2e-96  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.122504 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1726  transcriptional regulator, ArsR family  55.15 
 
 		 167 aa  174  5e-43  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0364777  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0944  transcriptional regulator, ArsR family  51.19 
 
 		 219 aa  172  1.9999999999999998e-42  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0139266  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2687  transcriptional regulator, ArsR family  49.4 
 
 		 175 aa  169  2e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2012  ArsR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 174 aa  85.1  5e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00760296  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0583  transcriptional regulator, ArsR family  27.88 
 
 		 170 aa  83.6  0.000000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1326  transcriptional regulator TrmB  25.44 
 
 		 171 aa  77  0.0000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000018018 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2910  transcriptional regulator, ArsR family  35.38 
 
 		 200 aa  75.9  0.0000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0605  hypothetical protein  33.87 
 
 		 208 aa  70.1  0.00000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1756  regulatory protein, ArsR  33.61 
 
 		 267 aa  68.9  0.00000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3361  hypothetical protein  21.43 
 
 		 254 aa  63.9  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000089037  normal  0.0139562 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1674  transcriptional regulator TrmB  26.28 
 
 		 247 aa  63.9  0.000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2080  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  31.3 
 
 		 271 aa  62  0.000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0231  ArsR family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 277 aa  60.5  0.00000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2989  transcription regulator  31.45 
 
 		 204 aa  60.5  0.00000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2162  regulatory protein, ArsR  29.75 
 
 		 253 aa  60.1  0.00000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1276  hypothetical protein  28.1 
 
 		 185 aa  59.3  0.00000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.121315 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1281  ArsR family transcriptional regulator  25.68 
 
 		 154 aa  57.4  0.00000009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0435937 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0840  conserved hypothetical protein-like protein  29.32 
 
 		 205 aa  56.6  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1830  hypothetical protein  22.37 
 
 		 244 aa  56.2  0.0000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000650312  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2801  transcriptional regulator, MarR family  29.46 
 
 		 214 aa  56.6  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.90963  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1645  ArsR family transcriptional regulator  24.53 
 
 		 166 aa  55.8  0.0000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2068  transcriptional regulator, TrmB  29.23 
 
 		 285 aa  53.9  0.000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0760  transcriptional regulator, ArsR family  28.07 
 
 		 248 aa  53.9  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.357604  normal  0.170766 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1272  hypothetical protein  24.62 
 
 		 257 aa  49.3  0.00003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.708188  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3371  hypothetical protein  20.59 
 
 		 255 aa  48.1  0.00006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00157866  hitchhiker  0.00816683 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1817  hypothetical protein  18.95 
 
 		 243 aa  47.4  0.0001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.081876  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0375  hypothetical protein  25.55 
 
 		 273 aa  47.4  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.191948  normal  0.40698 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0091  hypothetical protein  27.52 
 
 		 244 aa  44.7  0.0008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0660  transcriptional regulator, MarR family  22.48 
 
 		 282 aa  44.3  0.0009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3377  hypothetical protein  19.71 
 
 		 254 aa  44.3  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000923215  hitchhiker  0.00992163 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0234  ArsR family transcriptional regulator  23.89 
 
 		 248 aa  43.1  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.490507  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2382  regulatory protein ArsR  36.84 
 
 		 274 aa  41.2  0.007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.307498  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0650  hypothetical protein  20.51 
 
 		 249 aa  41.2  0.008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1189  regulatory protein, ArsR  21.09 
 
 		 237 aa  40.8  0.01  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.581479  decreased coverage  0.00502087 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>