28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_2687 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013743  Htur_2687  transcriptional regulator, ArsR family  100 
 
 		 175 aa  351  2.9999999999999997e-96  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0944  transcriptional regulator, ArsR family  71.84 
 
 		 219 aa  255  3e-67  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0139266  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0348  transcriptional regulator, ArsR family  49.4 
 
 		 176 aa  169  2e-41  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.122504 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1726  transcriptional regulator, ArsR family  49.7 
 
 		 167 aa  166  1e-40  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0364777  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0231  ArsR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 277 aa  67.8  0.00000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0583  transcriptional regulator, ArsR family  26.54 
 
 		 170 aa  67  0.0000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2012  ArsR family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 174 aa  65.5  0.0000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00760296  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2910  transcriptional regulator, ArsR family  29.46 
 
 		 200 aa  62.8  0.000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2801  transcriptional regulator, MarR family  27.13 
 
 		 214 aa  57.8  0.00000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.90963  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1756  regulatory protein, ArsR  30.15 
 
 		 267 aa  57.4  0.0000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0605  hypothetical protein  26.43 
 
 		 208 aa  57  0.0000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1326  transcriptional regulator TrmB  24.6 
 
 		 171 aa  57  0.0000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000018018 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1645  ArsR family transcriptional regulator  28.35 
 
 		 166 aa  56.6  0.0000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1276  hypothetical protein  27.5 
 
 		 185 aa  55.5  0.0000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.121315 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1674  transcriptional regulator TrmB  24.2 
 
 		 247 aa  54.3  0.0000008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0760  transcriptional regulator, ArsR family  28.1 
 
 		 248 aa  52.8  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.357604  normal  0.170766 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3361  hypothetical protein  20.45 
 
 		 254 aa  52  0.000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000089037  normal  0.0139562 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0840  conserved hypothetical protein-like protein  25.4 
 
 		 205 aa  51.6  0.000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1281  ArsR family transcriptional regulator  21.49 
 
 		 154 aa  47.8  0.00009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0435937 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2068  transcriptional regulator, TrmB  28.57 
 
 		 285 aa  47.8  0.00009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2989  transcription regulator  25 
 
 		 204 aa  46.6  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3371  hypothetical protein  19.23 
 
 		 255 aa  44.7  0.0007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00157866  hitchhiker  0.00816683 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1109  ArsR family transcriptional regulator  42 
 
 		 106 aa  44.3  0.0009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00776839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2162  regulatory protein, ArsR  26.98 
 
 		 253 aa  43.9  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3377  hypothetical protein  20.16 
 
 		 254 aa  43.9  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000923215  hitchhiker  0.00992163 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1061  regulatory protein ArsR  26.36 
 
 		 385 aa  42.7  0.003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.701357  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4829  transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 		 107 aa  41.6  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000141568 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1189  regulatory protein, ArsR  20.13 
 
 		 237 aa  41.2  0.008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.581479  decreased coverage  0.00502087 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>