23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_1276 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010085  Nmar_1276  hypothetical protein  100 
 
 		 185 aa  375  1e-103  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.121315 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1645  ArsR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 166 aa  106  2e-22  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1674  transcriptional regulator TrmB  30.57 
 
 		 247 aa  78.6  0.00000000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1281  ArsR family transcriptional regulator  29.86 
 
 		 154 aa  76.3  0.0000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0435937 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1326  transcriptional regulator TrmB  26.54 
 
 		 171 aa  72  0.000000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000018018 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1726  transcriptional regulator, ArsR family  26.97 
 
 		 167 aa  67.4  0.0000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0364777  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0583  transcriptional regulator, ArsR family  24.55 
 
 		 170 aa  61.2  0.000000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2012  ArsR family transcriptional regulator  25 
 
 		 174 aa  60.1  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00760296  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0348  transcriptional regulator, ArsR family  28.1 
 
 		 176 aa  58.9  0.00000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.122504 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0944  transcriptional regulator, ArsR family  33.04 
 
 		 219 aa  58.9  0.00000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0139266  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2989  transcription regulator  26.67 
 
 		 204 aa  57  0.0000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2379  transcriptional regulator, MarR family  27.54 
 
 		 485 aa  57  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2687  transcriptional regulator, ArsR family  27.5 
 
 		 175 aa  55.5  0.0000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2910  transcriptional regulator, ArsR family  23.73 
 
 		 200 aa  54.3  0.000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1756  regulatory protein, ArsR  24.58 
 
 		 267 aa  51.6  0.000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0840  conserved hypothetical protein-like protein  25.76 
 
 		 205 aa  51.6  0.000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0231  ArsR family transcriptional regulator  25.71 
 
 		 277 aa  51.2  0.000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2162  regulatory protein, ArsR  23.64 
 
 		 253 aa  47.4  0.0001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2068  transcriptional regulator, TrmB  22.46 
 
 		 285 aa  46.6  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1830  hypothetical protein  27.89 
 
 		 244 aa  46.6  0.0002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000650312  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3361  hypothetical protein  25.19 
 
 		 254 aa  45.1  0.0007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000089037  normal  0.0139562 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2193  hypothetical protein  31.03 
 
 		 252 aa  43.5  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.135571  normal  0.236804 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0605  hypothetical protein  20.66 
 
 		 208 aa  42.4  0.004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>