33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_1830 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007955  Mbur_1830  hypothetical protein  100 
 
 		 244 aa  502  1e-141  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000650312  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1817  hypothetical protein  77.49 
 
 		 243 aa  361  6e-99  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.081876  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0654  hypothetical protein  36.71 
 
 		 242 aa  159  3e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.997113  normal  0.803696 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0650  hypothetical protein  35.74 
 
 		 249 aa  149  4e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1189  regulatory protein, ArsR  35.85 
 
 		 237 aa  132  5e-30  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.581479  decreased coverage  0.00502087 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0234  ArsR family transcriptional regulator  29.71 
 
 		 248 aa  124  1e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.490507  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3361  hypothetical protein  28.51 
 
 		 254 aa  97.4  2e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000089037  normal  0.0139562 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0231  ArsR family transcriptional regulator  28.31 
 
 		 277 aa  90.5  2e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3371  hypothetical protein  28.57 
 
 		 255 aa  90.1  3e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00157866  hitchhiker  0.00816683 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0375  hypothetical protein  27.67 
 
 		 273 aa  87.8  1e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.191948  normal  0.40698 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3377  hypothetical protein  28.04 
 
 		 254 aa  84.7  0.000000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000923215  hitchhiker  0.00992163 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0660  transcriptional regulator, MarR family  30.77 
 
 		 282 aa  83.6  0.000000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0760  transcriptional regulator, ArsR family  28.05 
 
 		 248 aa  82  0.000000000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.357604  normal  0.170766 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2080  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  28.38 
 
 		 271 aa  80.5  0.00000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1756  regulatory protein, ArsR  30.3 
 
 		 267 aa  76.3  0.0000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2068  transcriptional regulator, TrmB  29.85 
 
 		 285 aa  75.9  0.0000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2012  ArsR family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 174 aa  72  0.000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00760296  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0340  regulatory protein, Crp  31.65 
 
 		 242 aa  71.6  0.00000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.659624  normal  0.909155 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0840  conserved hypothetical protein-like protein  28.35 
 
 		 205 aa  69.3  0.00000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1326  transcriptional regulator TrmB  28.35 
 
 		 171 aa  67.4  0.0000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000018018 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2162  regulatory protein, ArsR  25.94 
 
 		 253 aa  65.5  0.0000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2801  transcriptional regulator, MarR family  26.12 
 
 		 214 aa  62.4  0.000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.90963  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2989  transcription regulator  22.58 
 
 		 204 aa  60.8  0.00000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1272  hypothetical protein  22.57 
 
 		 257 aa  57.4  0.0000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.708188  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2193  hypothetical protein  24.81 
 
 		 252 aa  56.2  0.0000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.135571  normal  0.236804 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0348  transcriptional regulator, ArsR family  22.37 
 
 		 176 aa  56.2  0.0000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.122504 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1726  transcriptional regulator, ArsR family  26.28 
 
 		 167 aa  55.5  0.0000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0364777  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0605  hypothetical protein  22.05 
 
 		 208 aa  54.7  0.000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2910  transcriptional regulator, ArsR family  20.83 
 
 		 200 aa  53.5  0.000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0091  hypothetical protein  26.17 
 
 		 244 aa  52.4  0.000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0583  transcriptional regulator, ArsR family  25.98 
 
 		 170 aa  51.2  0.00002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1276  hypothetical protein  27.67 
 
 		 185 aa  47  0.0003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.121315 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0345  ArsR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 127 aa  43.1  0.004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>