45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_2379 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013743  Htur_2379  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 485 aa  930    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1756  regulatory protein, ArsR  34.25 
 
 		 267 aa  78.2  0.0000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0231  ArsR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 277 aa  68.9  0.0000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2068  transcriptional regulator, TrmB  31.69 
 
 		 285 aa  65.9  0.000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3377  hypothetical protein  25.81 
 
 		 254 aa  65.5  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000923215  hitchhiker  0.00992163 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2162  regulatory protein, ArsR  26.71 
 
 		 253 aa  63.2  0.00000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1189  regulatory protein, ArsR  26 
 
 		 237 aa  61.2  0.00000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.581479  decreased coverage  0.00502087 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0375  hypothetical protein  26.09 
 
 		 273 aa  60.5  0.00000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.191948  normal  0.40698 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1061  regulatory protein ArsR  27.03 
 
 		 385 aa  59.7  0.0000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.701357  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2012  ArsR family transcriptional regulator  27.21 
 
 		 174 aa  58.9  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00760296  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0660  transcriptional regulator, MarR family  28.19 
 
 		 282 aa  57.8  0.0000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1272  hypothetical protein  27.44 
 
 		 257 aa  57.8  0.0000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.708188  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2080  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  30.25 
 
 		 271 aa  57  0.0000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1276  hypothetical protein  28.15 
 
 		 185 aa  53.9  0.000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.121315 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0650  hypothetical protein  23.84 
 
 		 249 aa  52.8  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3371  hypothetical protein  25 
 
 		 255 aa  52.4  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00157866  hitchhiker  0.00816683 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3361  hypothetical protein  26.06 
 
 		 254 aa  52  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000089037  normal  0.0139562 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1326  transcriptional regulator TrmB  23.91 
 
 		 171 aa  51.6  0.00004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000018018 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0234  ArsR family transcriptional regulator  25.33 
 
 		 248 aa  50.8  0.00005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.490507  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0583  transcriptional regulator, ArsR family  22.14 
 
 		 170 aa  49.3  0.0001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1645  ArsR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 166 aa  49.3  0.0002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0654  hypothetical protein  21.48 
 
 		 242 aa  48.5  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.997113  normal  0.803696 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2855  transcriptional regulator, ArsR family  42.42 
 
 		 100 aa  48.9  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.293533  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0091  hypothetical protein  25.15 
 
 		 244 aa  48.1  0.0003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1726  transcriptional regulator, ArsR family  31.75 
 
 		 167 aa  47.4  0.0006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0364777  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1365  ArsR family transcriptional regulator  45.59 
 
 		 169 aa  46.6  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0419  transcriptional regulator, ArsR family  37.84 
 
 		 117 aa  46.6  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0179  ArsR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 87 aa  45.8  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2910  transcriptional regulator, ArsR family  31.03 
 
 		 200 aa  45.4  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0340  regulatory protein, Crp  34.04 
 
 		 242 aa  45.1  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.659624  normal  0.909155 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1852  transcriptional regulator, ArsR family  34.83 
 
 		 223 aa  45.1  0.003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.211312 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4493  transcriptional regulator, ArsR family  41.33 
 
 		 302 aa  44.7  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.234316  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5239  transcriptional regulator, ArsR family  39.06 
 
 		 97 aa  44.7  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0441839  normal  0.647362 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1817  hypothetical protein  24.5 
 
 		 243 aa  44.7  0.004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.081876  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2919  ArsR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 93 aa  44.7  0.004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.808168  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1214  regulatory protein, ArsR  40 
 
 		 117 aa  44.7  0.004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1295  transcriptional regulator, ArsR family  39.44 
 
 		 89 aa  44.3  0.005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.780199  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3421  regulatory protein, ArsR  40.35 
 
 		 105 aa  44.3  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.993799  normal  0.836004 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3429  transcriptional regulator, ArsR family  40.58 
 
 		 108 aa  44.3  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.336331  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1768  regulatory protein ArsR  45.9 
 
 		 112 aa  44.3  0.005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0909  ArsR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 228 aa  43.9  0.006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00000018626  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3375  transcriptional regulator, ArsR family  43.28 
 
 		 129 aa  43.9  0.006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0206443  hitchhiker  0.00373778 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22920  transcriptional regulator, ArsR family  35.87 
 
 		 119 aa  43.5  0.007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1062  transcriptional regulator, ArsR family  42.19 
 
 		 103 aa  43.5  0.008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.736924 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4975  transcriptional regulator, ArsR family  38.71 
 
 		 90 aa  43.5  0.009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>