27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_2028 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009376  Pars_2028  putative regulatory protein  100 
 
 		 220 aa  439  9.999999999999999e-123  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0805  ArsR family transcriptional regulator  64.09 
 
 		 223 aa  271  8.000000000000001e-72  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.126396  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0905  ArsR family transcriptional regulator  64.55 
 
 		 219 aa  239  2.9999999999999997e-62  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0307  regulatory protein, ArsR  52.94 
 
 		 80 aa  74.7  0.000000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0142  ArsR family transcriptional regulator  48.53 
 
 		 98 aa  72  0.000000000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1814  ArsR family transcriptional regulator  50 
 
 		 79 aa  71.6  0.000000000008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.346706  normal  0.834101 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1509  transcriptional regulator, TrmB  32.09 
 
 		 292 aa  66.2  0.0000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.363784  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0687  ArsR family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 97 aa  65.1  0.0000000009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0139545 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1248  regulatory protein, ArsR  43.33 
 
 		 88 aa  60.1  0.00000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0990  regulatory protein, ArsR  47.06 
 
 		 83 aa  58.9  0.00000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.683159  hitchhiker  0.00169297 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0264  regulatory protein, ArsR  41.67 
 
 		 88 aa  58.9  0.00000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.297288  decreased coverage  0.00633224 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1862  Fis family transcriptional regulator  43.21 
 
 		 87 aa  57.8  0.0000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.514714 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0412  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  39.13 
 
 		 118 aa  57.8  0.0000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.778851 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0495  putative transcriptional regulator  49.02 
 
 		 132 aa  57.4  0.0000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0201  ArsR family transcriptional regulator  36 
 
 		 86 aa  57  0.0000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.364749  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0703  putative transcriptional regulator  51.92 
 
 		 135 aa  56.6  0.0000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.286988  normal  0.459468 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0775  putative transcriptional regulator  41.67 
 
 		 134 aa  55.5  0.0000006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.394099 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1759  putative transcriptional regulator  49.02 
 
 		 134 aa  55.5  0.0000007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0694565  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1395  Fis family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 87 aa  54.7  0.000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1280  putative transcriptional regulator  43.1 
 
 		 120 aa  52.4  0.000006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.37603  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1838  putative transcriptional regulator  46 
 
 		 120 aa  51.6  0.00001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.416866  hitchhiker  0.000363735 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2088  putative regulatory protein  42.86 
 
 		 120 aa  50.1  0.00003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.373377 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1817  hypothetical protein  31.19 
 
 		 243 aa  44.7  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.081876  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0502  transcriptional regulator, ArsR family  29.21 
 
 		 115 aa  44.3  0.002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0860  regulatory protein, ArsR  30.23 
 
 		 114 aa  43.1  0.003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0866  putative regulatory protein  34.57 
 
 		 93 aa  42.7  0.004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0270  transcriptional regulator, TrmB  34.29 
 
 		 102 aa  42.4  0.005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>