23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pisl_1838 on replicon NC_008701
Organism: Pyrobaculum islandicum DSM 4184



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008701  Pisl_1838  putative transcriptional regulator  100 
 
 		 120 aa  236  5.999999999999999e-62  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.416866  hitchhiker  0.000363735 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1280  putative transcriptional regulator  87.39 
 
 		 120 aa  214  2e-55  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.37603  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0412  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  64.1 
 
 		 118 aa  163  6.9999999999999995e-40  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.778851 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2088  putative regulatory protein  68.07 
 
 		 120 aa  162  2.0000000000000002e-39  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.373377 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0495  putative transcriptional regulator  41.75 
 
 		 132 aa  80.1  0.000000000000009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0703  putative transcriptional regulator  38.68 
 
 		 135 aa  77  0.00000000000008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.286988  normal  0.459468 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0775  putative transcriptional regulator  39.18 
 
 		 134 aa  75.1  0.0000000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.394099 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1759  putative transcriptional regulator  36.7 
 
 		 134 aa  74.7  0.0000000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0694565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0142  ArsR family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 98 aa  52.4  0.000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2028  putative regulatory protein  46 
 
 		 220 aa  51.6  0.000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0805  ArsR family transcriptional regulator  44 
 
 		 223 aa  49.7  0.00001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.126396  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0307  regulatory protein, ArsR  39.39 
 
 		 80 aa  48.9  0.00003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0687  ArsR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 97 aa  47.4  0.00007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0139545 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0905  ArsR family transcriptional regulator  38 
 
 		 219 aa  47.4  0.00007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1814  ArsR family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 79 aa  44.7  0.0004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.346706  normal  0.834101 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1248  regulatory protein, ArsR  30.65 
 
 		 88 aa  44.7  0.0005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0264  regulatory protein, ArsR  32.26 
 
 		 88 aa  43.9  0.0008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.297288  decreased coverage  0.00633224 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1509  transcriptional regulator, TrmB  44.68 
 
 		 292 aa  43.9  0.0008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.363784  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0201  ArsR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 86 aa  43.1  0.001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.364749  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4632  transcriptional regulator, AsnC family  32.14 
 
 		 166 aa  41.2  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0402571 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1057  transcriptional regulator, ArsR family  28.74 
 
 		 111 aa  41.2  0.005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.543137 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0112  transcriptional regulator, AsnC family  47.62 
 
 		 153 aa  40.4  0.008  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2927  ArsR family transcriptional regulator  28.75 
 
 		 111 aa  40.4  0.008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>