140 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_0142 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_0142  ArsR family transcriptional regulator  100 
 
 		 98 aa  202  1e-51  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1814  ArsR family transcriptional regulator  57.14 
 
 		 79 aa  94.4  5e-19  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.346706  normal  0.834101 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0307  regulatory protein, ArsR  50.67 
 
 		 80 aa  92.4  2e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0990  regulatory protein, ArsR  64.38 
 
 		 83 aa  91.7  3e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.683159  hitchhiker  0.00169297 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0905  ArsR family transcriptional regulator  43.42 
 
 		 219 aa  72  0.000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2028  putative regulatory protein  46.67 
 
 		 220 aa  72.8  0.000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0805  ArsR family transcriptional regulator  49.25 
 
 		 223 aa  72  0.000000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.126396  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0412  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  45 
 
 		 118 aa  59.7  0.00000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.778851 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1759  putative transcriptional regulator  48.98 
 
 		 134 aa  54.7  0.0000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0694565  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0775  putative transcriptional regulator  44.9 
 
 		 134 aa  53.5  0.000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.394099 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1280  putative transcriptional regulator  41.51 
 
 		 120 aa  53.1  0.000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.37603  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1838  putative transcriptional regulator  38.18 
 
 		 120 aa  52.4  0.000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.416866  hitchhiker  0.000363735 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0179  ArsR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 87 aa  52  0.000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2088  putative regulatory protein  42.86 
 
 		 120 aa  51.2  0.000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.373377 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1509  transcriptional regulator, TrmB  35.29 
 
 		 292 aa  50.4  0.000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.363784  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1248  regulatory protein, ArsR  35.38 
 
 		 88 aa  49.3  0.00002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0495  putative transcriptional regulator  40.82 
 
 		 132 aa  49.7  0.00002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0201  ArsR family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 86 aa  48.9  0.00002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.364749  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1421  regulatory protein, ArsR  38.71 
 
 		 113 aa  48.5  0.00003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.116907  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1247  ArsR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 98 aa  48.1  0.00004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0687  ArsR family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 97 aa  48.1  0.00004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0139545 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0703  putative transcriptional regulator  37.74 
 
 		 135 aa  48.1  0.00004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.286988  normal  0.459468 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1989  transcriptional regulator, ArsR family  36.23 
 
 		 125 aa  48.1  0.00004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.746308  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7118  transcriptional regulator, ArsR family  42.59 
 
 		 180 aa  47.8  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1365  ArsR family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 169 aa  47.4  0.00008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2068  transcriptional regulator, TrmB  35.48 
 
 		 285 aa  47  0.00009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1345  FaeA family protein  32.43 
 
 		 84 aa  47  0.00009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00790848  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1032  transcription regulator, ArsR family  30.65 
 
 		 102 aa  46.2  0.0001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08060  ArsR family regulatory protein  47.92 
 
 		 232 aa  46.6  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.365451  normal  0.146174 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0792  hypothetical protein  32.35 
 
 		 96 aa  46.2  0.0001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.894596  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1060  ArsR family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 96 aa  46.2  0.0001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1450  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 317 aa  45.8  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0303  ArsR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 94 aa  45.8  0.0002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14690  transcriptional regulator, ArsR family  34.94 
 
 		 116 aa  46.2  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0380  transcriptional regulator, DeoR family  38.71 
 
 		 254 aa  46.2  0.0002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0659  DeoR family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 288 aa  45.1  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0255217  normal  0.62024 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0309  transcriptional regulator, ArsR family  38.71 
 
 		 126 aa  45.1  0.0003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20100  regulatory protein ArsR  35.82 
 
 		 113 aa  45.4  0.0003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2300  transcriptional regulator, ArsR family  32.26 
 
 		 99 aa  45.1  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.290076  hitchhiker  0.000322902 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3521  ArsR family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 368 aa  44.3  0.0005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1439  transcriptional regulator, ArsR family  36.92 
 
 		 125 aa  44.7  0.0005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2927  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 111 aa  44.7  0.0005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1369  ArsR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 100 aa  44.7  0.0005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5266  transcriptional regulator, ArsR family  34.92 
 
 		 368 aa  44.3  0.0005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03230  transcriptional regulator, DeoR family  41.51 
 
 		 257 aa  44.3  0.0005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  7.65196e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0270  transcriptional regulator, TrmB  31.51 
 
 		 102 aa  44.3  0.0006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0453  putative transcriptional regulator  33.87 
 
 		 106 aa  44.3  0.0006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.701032 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0575  DeoR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 274 aa  44.3  0.0006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000140104  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0065  ArsR family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 99 aa  43.9  0.0007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.487326 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2973  transcriptional regulator, ArsR family  31.88 
 
 		 94 aa  43.9  0.0007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5611  ArsR family transcriptional regulator  28.38 
 
 		 103 aa  43.9  0.0007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02750  regulatory protein ArsR  33.85 
 
 		 97 aa  43.5  0.0008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1340  regulatory protein MarR  41.86 
 
 		 299 aa  43.5  0.0009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  decreased coverage  0.00576351  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1077  ArsR family transcriptional regulator  30 
 
 		 293 aa  43.5  0.0009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0527045 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4975  transcriptional regulator, ArsR family  35.48 
 
 		 90 aa  43.5  0.0009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4988  ArsR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 96 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4586  ArsR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 90 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0976523  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1582  ArsR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 120 aa  43.5  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00023069  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4825  regulatory protein, ArsR  34.92 
 
 		 128 aa  43.1  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.114611  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4088  putative transcriptional regulator protein, ArsR family  36.51 
 
 		 213 aa  43.5  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8029  transcriptional regulator ArsR family  33.82 
 
 		 106 aa  43.1  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3471  regulatory protein, ArsR  36.51 
 
 		 135 aa  43.5  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.508363 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0264  regulatory protein, ArsR  32.76 
 
 		 88 aa  43.5  0.001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.297288  decreased coverage  0.00633224 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0590  transcriptional regulator, ArsR family  36.99 
 
 		 117 aa  43.5  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.506747 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3375  transcriptional regulator, ArsR family  35.82 
 
 		 129 aa  43.1  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0206443  hitchhiker  0.00373778 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0501  regulatory protein ArsR  36.49 
 
 		 127 aa  43.1  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0567681  normal  0.0228507 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3258  rhodanese domain-containing protein  32.31 
 
 		 226 aa  43.1  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2567  DeoR family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 256 aa  43.1  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0643687  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4676  ArsR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 90 aa  43.1  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1324  regulatory protein, ArsR  25.76 
 
 		 107 aa  42.7  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2071  regulatory protein, ArsR  25.76 
 
 		 107 aa  42.7  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.3776  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8645  transcriptional regulator, DeoR family  41.18 
 
 		 253 aa  43.1  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.846335 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2507  transcriptional regulator, ArsR family  35.38 
 
 		 245 aa  42.7  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.539832  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2267  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 		 118 aa  43.5  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000484642 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0070  transcriptional regulator, ArsR family  41.27 
 
 		 121 aa  43.5  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.521136  normal  0.0282999 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4960  transcriptional regulator, ArsR family  35.48 
 
 		 90 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.850958  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2641  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 		 113 aa  43.1  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.257894  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0274  transcriptional regulator, ArsR family  35.48 
 
 		 90 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36740  ArsR family regulatory protein  33.96 
 
 		 230 aa  42.4  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.929416  normal  0.251119 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0482  divergent AAA ATP  33.93 
 
 		 475 aa  42.7  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2101  ArsR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 317 aa  42  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1931  ArsR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 107 aa  42.4  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0246294  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1971  ATP-NAD/AcoX kinase  39.58 
 
 		 293 aa  42.4  0.002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0382489  hitchhiker  0.00000000370023 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2826  regulatory protein, ArsR  27.94 
 
 		 112 aa  42.7  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0214569  hitchhiker  0.000742235 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12351  ArsR family regulatory protein  28.36 
 
 		 90 aa  42.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1295  transcriptional regulator, ArsR family  32.35 
 
 		 89 aa  42.7  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.780199  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2331  ArsR family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 133 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1355  FaeA family protein  31.34 
 
 		 74 aa  42.4  0.002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.476442  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2235  transcriptional regulator, ArsR family  32.86 
 
 		 117 aa  42.4  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.167964  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2463  transcriptional regulator, TrmB  33.78 
 
 		 110 aa  42.7  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.473489  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4510  transcriptional regulator, ArsR family  33.85 
 
 		 114 aa  42  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.104017  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0726  ArsR family transcriptional regulator  27.69 
 
 		 90 aa  41.6  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.676551  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1441  transcriptional regulator, ArsR family  35.48 
 
 		 192 aa  42  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2949  regulatory protein, ArsR  36.11 
 
 		 126 aa  42  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.394398  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0140  transcriptional regulator, ArsR family  39.68 
 
 		 135 aa  42  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1784  transcriptional regulator, ArsR family  34.33 
 
 		 114 aa  42  0.003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4613  ArsR family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 120 aa  42  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.296682 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2787  ArsR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 99 aa  41.6  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.255483 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4497  regulatory protein, ArsR  31.67 
 
 		 224 aa  42  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.175286  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0191  transcriptional regulator, ArsR family  30.43 
 
 		 124 aa  42  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.549867  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>