23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tneu_1280 on replicon NC_010525
Organism: Thermoproteus neutrophilus V24Sta



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010525  Tneu_1280  putative transcriptional regulator  100 
 
 		 120 aa  237  4e-62  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.37603  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1838  putative transcriptional regulator  87.39 
 
 		 120 aa  214  2e-55  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.416866  hitchhiker  0.000363735 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0412  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  68.1 
 
 		 118 aa  169  2e-41  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.778851 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2088  putative regulatory protein  68.07 
 
 		 120 aa  159  2e-38  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.373377 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0495  putative transcriptional regulator  41.13 
 
 		 132 aa  85.1  3e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0703  putative transcriptional regulator  42.31 
 
 		 135 aa  79.7  0.00000000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.286988  normal  0.459468 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0775  putative transcriptional regulator  41.24 
 
 		 134 aa  75.5  0.0000000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.394099 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1759  putative transcriptional regulator  40.21 
 
 		 134 aa  74.7  0.0000000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0694565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0142  ArsR family transcriptional regulator  41.51 
 
 		 98 aa  53.1  0.000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2028  putative regulatory protein  43.1 
 
 		 220 aa  52.8  0.000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0905  ArsR family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 219 aa  51.2  0.000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0805  ArsR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 223 aa  50.8  0.000006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.126396  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0307  regulatory protein, ArsR  41.27 
 
 		 80 aa  50.8  0.000007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1814  ArsR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 79 aa  46.6  0.0001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.346706  normal  0.834101 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0687  ArsR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 97 aa  46.2  0.0002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0139545 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0264  regulatory protein, ArsR  30.65 
 
 		 88 aa  43.5  0.001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.297288  decreased coverage  0.00633224 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1248  regulatory protein, ArsR  33.9 
 
 		 88 aa  43.1  0.001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1509  transcriptional regulator, TrmB  40.43 
 
 		 292 aa  42  0.002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.363784  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1057  transcriptional regulator, ArsR family  32.47 
 
 		 111 aa  42.7  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.543137 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0201  ArsR family transcriptional regulator  27.42 
 
 		 86 aa  41.6  0.004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.364749  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2213  transcriptional regulator, ArsR family  40.98 
 
 		 118 aa  41.6  0.004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0112  transcriptional regulator, AsnC family  47.62 
 
 		 153 aa  40  0.009  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4632  transcriptional regulator, AsnC family  32.53 
 
 		 166 aa  40  0.01  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0402571 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>