22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pisl_0307 on replicon NC_008701
Organism: Pyrobaculum islandicum DSM 4184



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008701  Pisl_0307  regulatory protein, ArsR  100 
 
 		 80 aa  164  2.9999999999999998e-40  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1814  ArsR family transcriptional regulator  93.59 
 
 		 79 aa  154  5.0000000000000005e-37  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.346706  normal  0.834101 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0990  regulatory protein, ArsR  66.25 
 
 		 83 aa  95.9  2e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.683159  hitchhiker  0.00169297 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0142  ArsR family transcriptional regulator  50.67 
 
 		 98 aa  92.4  2e-18  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2028  putative regulatory protein  52.94 
 
 		 220 aa  74.3  0.0000000000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0805  ArsR family transcriptional regulator  50.63 
 
 		 223 aa  73.6  0.0000000000009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.126396  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0905  ArsR family transcriptional regulator  46.25 
 
 		 219 aa  72.8  0.000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1759  putative transcriptional regulator  46.43 
 
 		 134 aa  52.4  0.000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0694565  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0775  putative transcriptional regulator  52.08 
 
 		 134 aa  52.8  0.000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.394099 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0412  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  44.44 
 
 		 118 aa  52.4  0.000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.778851 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0264  regulatory protein, ArsR  39.06 
 
 		 88 aa  51.6  0.000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.297288  decreased coverage  0.00633224 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1248  regulatory protein, ArsR  32.81 
 
 		 88 aa  51.2  0.000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0687  ArsR family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 97 aa  50.8  0.000007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0139545 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1280  putative transcriptional regulator  41.27 
 
 		 120 aa  50.8  0.000007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.37603  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0201  ArsR family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 86 aa  50.1  0.00001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.364749  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1838  putative transcriptional regulator  39.39 
 
 		 120 aa  48.9  0.00003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.416866  hitchhiker  0.000363735 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0703  putative transcriptional regulator  35.44 
 
 		 135 aa  47.4  0.00007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.286988  normal  0.459468 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2088  putative regulatory protein  38.1 
 
 		 120 aa  46.2  0.0002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.373377 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0495  putative transcriptional regulator  41.67 
 
 		 132 aa  44.7  0.0005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1509  transcriptional regulator, TrmB  36.84 
 
 		 292 aa  43.5  0.001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.363784  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0453  putative transcriptional regulator  39.66 
 
 		 106 aa  42.7  0.002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.701032 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1272  hypothetical protein  43.18 
 
 		 198 aa  41.2  0.004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.658952 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>