21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_2088 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009376  Pars_2088  putative regulatory protein  100 
 
 		 120 aa  239  7e-63  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.373377 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1838  putative transcriptional regulator  68.07 
 
 		 120 aa  178  2e-44  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.416866  hitchhiker  0.000363735 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1280  putative transcriptional regulator  68.07 
 
 		 120 aa  177  2.9999999999999997e-44  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.37603  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0412  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  71.3 
 
 		 118 aa  172  9.999999999999999e-43  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.778851 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0495  putative transcriptional regulator  33.88 
 
 		 132 aa  75.1  0.0000000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0703  putative transcriptional regulator  35 
 
 		 135 aa  75.1  0.0000000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.286988  normal  0.459468 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0775  putative transcriptional regulator  34.58 
 
 		 134 aa  68.2  0.00000000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.394099 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1759  putative transcriptional regulator  33.33 
 
 		 134 aa  65.1  0.0000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0694565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0142  ArsR family transcriptional regulator  44.23 
 
 		 98 aa  51.2  0.000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2028  putative regulatory protein  42.86 
 
 		 220 aa  50.8  0.000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0805  ArsR family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 223 aa  48.9  0.00002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.126396  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0307  regulatory protein, ArsR  38.1 
 
 		 80 aa  46.6  0.0001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0687  ArsR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 97 aa  46.6  0.0001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0139545 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0905  ArsR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 219 aa  46.6  0.0001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1057  transcriptional regulator, ArsR family  37.33 
 
 		 111 aa  43.9  0.0007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.543137 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0264  regulatory protein, ArsR  34 
 
 		 88 aa  43.5  0.0009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.297288  decreased coverage  0.00633224 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1814  ArsR family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 79 aa  43.1  0.001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.346706  normal  0.834101 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1509  transcriptional regulator, TrmB  38 
 
 		 292 aa  42.4  0.002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.363784  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1248  regulatory protein, ArsR  27.42 
 
 		 88 aa  42.7  0.002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0201  ArsR family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 86 aa  41.6  0.003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.364749  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4201  transcriptional regulator, IclR family  45 
 
 		 254 aa  40  0.01  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.191751  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>