19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_0264 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009376  Pars_0264  regulatory protein, ArsR  100 
 
 		 88 aa  181  2.0000000000000003e-45  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.297288  decreased coverage  0.00633224 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1248  regulatory protein, ArsR  77.03 
 
 		 88 aa  126  9.000000000000001e-29  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0687  ArsR family transcriptional regulator  67.82 
 
 		 97 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0139545 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0201  ArsR family transcriptional regulator  65.88 
 
 		 86 aa  123  1e-27  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.364749  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2028  putative regulatory protein  41.67 
 
 		 220 aa  58.5  0.00000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0905  ArsR family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 219 aa  55.8  0.0000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0805  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 		 223 aa  54.3  0.0000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.126396  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0307  regulatory protein, ArsR  39.06 
 
 		 80 aa  51.6  0.000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0412  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  31.34 
 
 		 118 aa  50.4  0.000008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.778851 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1814  ArsR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 79 aa  48.9  0.00002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.346706  normal  0.834101 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0495  putative transcriptional regulator  41.67 
 
 		 132 aa  48.5  0.00003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0703  putative transcriptional regulator  38.78 
 
 		 135 aa  46.2  0.0002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.286988  normal  0.459468 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1759  putative transcriptional regulator  34.48 
 
 		 134 aa  44.7  0.0004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0694565  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0775  putative transcriptional regulator  33.9 
 
 		 134 aa  44.7  0.0004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.394099 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1509  transcriptional regulator, TrmB  33.33 
 
 		 292 aa  43.9  0.0007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.363784  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1838  putative transcriptional regulator  32.26 
 
 		 120 aa  43.9  0.0008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.416866  hitchhiker  0.000363735 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0142  ArsR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 98 aa  43.5  0.001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2088  putative regulatory protein  34 
 
 		 120 aa  43.5  0.001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.373377 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1280  putative transcriptional regulator  30.65 
 
 		 120 aa  43.5  0.001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.37603  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>