More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_4201 on replicon NC_013744
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013744  Htur_4201  transcriptional regulator, IclR family  100 
 
 		 254 aa  514  1.0000000000000001e-145  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.191751  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4784  transcriptional regulator, IclR family  46.37 
 
 		 257 aa  228  8e-59  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.820047  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0327  transcriptional regulator, IclR family  40.32 
 
 		 254 aa  194  8.000000000000001e-49  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.720721 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4694  transcriptional regulator, IclR family  41.67 
 
 		 255 aa  192  3e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.116545  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4391  transcriptional regulator, IclR family  40.73 
 
 		 255 aa  192  4e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.143749  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3881  transcriptional regulator, IclR family  39.92 
 
 		 254 aa  185  7e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0445714  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3407  transcriptional regulator, IclR family  37.65 
 
 		 255 aa  184  8e-46  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.351965  normal  0.802524 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0808  transcriptional regulator, IclR family  38.25 
 
 		 272 aa  174  9.999999999999999e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2238  transcriptional regulator, IclR family  38.37 
 
 		 251 aa  173  1.9999999999999998e-42  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.399676  normal  0.216558 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4019  transcriptional regulator, IclR family  38.06 
 
 		 258 aa  173  1.9999999999999998e-42  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3665  transcriptional regulator, IclR family  39.27 
 
 		 262 aa  170  2e-41  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2575  transcriptional regulator, IclR family  38.62 
 
 		 262 aa  169  4e-41  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1087  transcriptional regulator, IclR family  38.46 
 
 		 258 aa  167  1e-40  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4475  transcriptional regulator, IclR family  35.89 
 
 		 258 aa  166  4e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0192379  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1911  transcriptional regulator, IclR family  40.08 
 
 		 256 aa  165  5.9999999999999996e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1018  transcriptional regulator, IclR family  39.02 
 
 		 257 aa  165  6.9999999999999995e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.142974  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4413  transcriptional regulator, IclR family  37.35 
 
 		 251 aa  163  3e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2872  transcriptional regulator, IclR family  35.08 
 
 		 255 aa  160  2e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4416  transcriptional regulator, IclR family  35.83 
 
 		 251 aa  159  4e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2373  transcriptional regulator, IclR family  38.86 
 
 		 261 aa  159  4e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4759  transcriptional regulator, IclR family  35.74 
 
 		 256 aa  159  6e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.635938  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0099  transcriptional regulator, IclR family  32.24 
 
 		 262 aa  158  9e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4647  transcriptional regulator, IclR family  37.61 
 
 		 262 aa  157  2e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0822  transcriptional regulator, IclR family  35.8 
 
 		 258 aa  153  2e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4730  transcriptional regulator, IclR family  35.39 
 
 		 268 aa  153  2e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0824  transcriptional regulator, IclR family  33.86 
 
 		 264 aa  153  2.9999999999999998e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4669  transcriptional regulator, IclR family  35.89 
 
 		 275 aa  153  2.9999999999999998e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3532  transcriptional regulator, IclR family  33.73 
 
 		 256 aa  151  8.999999999999999e-36  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2252  transcriptional regulator, IclR family  31.3 
 
 		 263 aa  150  2e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.128917  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1075  transcriptional regulator, IclR family  33.6 
 
 		 266 aa  150  2e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0501  transcriptional regulator, IclR family  34.69 
 
 		 254 aa  149  5e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0417  IclR family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 268 aa  147  1.0000000000000001e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.116242 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0499  transcriptional regulator, IclR family  36.86 
 
 		 258 aa  147  2.0000000000000003e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0947  transcriptional regulator, IclR family  35.34 
 
 		 258 aa  145  7.0000000000000006e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.264338 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2531  transcriptional regulator, IclR family  35.96 
 
 		 259 aa  145  7.0000000000000006e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2325  transcriptional regulator, IclR family  34.01 
 
 		 258 aa  145  8.000000000000001e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1780  IclR family transcriptional regulator  35.57 
 
 		 272 aa  142  5e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3416  transcriptional regulator, IclR family  32.79 
 
 		 257 aa  139  4.999999999999999e-32  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3440  IclR family transcriptional regulator  33.63 
 
 		 273 aa  137  2e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.866579  normal  0.57268 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3702  transcriptional regulator, IclR family  31.49 
 
 		 252 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.8457  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2906  transcriptional regulator, IclR family  34.29 
 
 		 254 aa  136  4e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4879  transcriptional regulator, IclR family  33.33 
 
 		 277 aa  135  9e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2397  regulatory protein, IclR  35.37 
 
 		 263 aa  133  3e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.162621  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2596  IclR family transcriptional regulator  34.96 
 
 		 256 aa  132  6.999999999999999e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1985  transcriptional regulator KdgR  35.29 
 
 		 263 aa  130  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.364862  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1981  transcriptional regulator KdgR  35.29 
 
 		 263 aa  130  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.364283  normal  0.0913734 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1473  transcriptional regulator KdgR  35.29 
 
 		 263 aa  130  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0115946  normal  0.370857 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2043  transcriptional regulator KdgR  35.29 
 
 		 263 aa  130  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.374419  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1289  transcriptional regulator KdgR  35.29 
 
 		 263 aa  130  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000107384  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01798  predicted DNA-binding transcriptional regulator  35.29 
 
 		 263 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.440803  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01786  hypothetical protein  35.29 
 
 		 263 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.633166  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2095  transcriptional regulator KdgR  35.29 
 
 		 263 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000995956  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1360  transcriptional regulator KdgR  35.29 
 
 		 263 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000169219  normal  0.0136372 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1918  transcriptional regulator KdgR  35.29 
 
 		 263 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000201259  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2559  transcriptional regulator KdgR  35.29 
 
 		 263 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000361362  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1805  IclR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 263 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.954449  normal  0.233357 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5943  transcriptional regulator, IclR family  34.82 
 
 		 257 aa  129  3e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1161  transcriptional regulator, IclR family  34.35 
 
 		 267 aa  128  7.000000000000001e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0013559 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3844  transcriptional regulator, IclR family  30.68 
 
 		 270 aa  128  8.000000000000001e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0443  transcriptional regulator, TrmB  33.62 
 
 		 254 aa  128  8.000000000000001e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.915404  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4374  transcriptional regulator, IclR family  30.86 
 
 		 250 aa  128  9.000000000000001e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0433228  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3666  transcriptional regulator, IclR family  33.2 
 
 		 267 aa  127  2.0000000000000002e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2056  transcriptional regulator KdgR  34.87 
 
 		 263 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000211216  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2387  transcriptional regulator, IclR family  35.62 
 
 		 257 aa  127  2.0000000000000002e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0157724  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0882  IclR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 246 aa  126  3e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3940  transcriptional regulator, IclR family  34.15 
 
 		 256 aa  126  3e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0859  transcriptional regulator IclR-like protein  31.78 
 
 		 246 aa  126  3e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2510  transcriptional regulator, IclR family  33.64 
 
 		 308 aa  126  3e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00153166  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1855  transcriptional regulator, IclR family  34.25 
 
 		 280 aa  126  4.0000000000000003e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4056  transcriptional regulator, IclR family  37.16 
 
 		 281 aa  125  6e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3027  IclR family transcriptional regulator  34.06 
 
 		 260 aa  125  7e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000289902  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0116  IclR family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 550 aa  125  8.000000000000001e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3102  transcriptional regulator, IclR family  32.55 
 
 		 260 aa  124  1e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1949  transcriptional regulator, IclR family  32.48 
 
 		 263 aa  124  1e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00482853  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4797  transcriptional regulator, IclR family  31.67 
 
 		 258 aa  123  2e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1885  transcriptional regulator, IclR family  32.48 
 
 		 263 aa  124  2e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0160572  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3853  IclR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 263 aa  124  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.532852  hitchhiker  0.00959131 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4139  transcriptional regulator, IclR family  30.54 
 
 		 261 aa  124  2e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3960  transcriptional regulator, IclR family  33.48 
 
 		 255 aa  124  2e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0759  IclR family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 261 aa  123  3e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.46118e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3456  transcriptional regulator, IclR family  32.26 
 
 		 269 aa  123  3e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4386  transcriptional regulator, IclR family  32.67 
 
 		 257 aa  123  3e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.7103e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0514  IclR family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 260 aa  122  5e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000101936  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0458  regulatory protein, IclR  31.14 
 
 		 252 aa  122  5e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0309456 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2177  transcriptional regulator, IclR family  31.62 
 
 		 263 aa  122  6e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00508287  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4038  transcriptional regulator, IclR family  33.6 
 
 		 260 aa  121  9.999999999999999e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1318  IclR family transcriptional regulator  29.75 
 
 		 275 aa  121  9.999999999999999e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.486749  normal  0.878274 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2055  transcriptional regulator, IclR family  32.48 
 
 		 263 aa  121  9.999999999999999e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0903474  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3333  transcriptional regulator, IclR family  29.96 
 
 		 252 aa  120  3e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.950577  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0669  transcriptional regulator, IclR family  33.02 
 
 		 260 aa  120  3e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.4595400000000001e-34 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000924  transcriptional regulator KdgR KDG operon repressor  30.13 
 
 		 265 aa  119  3.9999999999999996e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3776  transcriptional repressor IclR  31.51 
 
 		 276 aa  118  7.999999999999999e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2122  IclR family transcriptional regulator  33.48 
 
 		 263 aa  118  7.999999999999999e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000124752  decreased coverage  0.000111832 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3644  regulatory protein, IclR  32.55 
 
 		 260 aa  118  9e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000806492  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0849  regulatory proteins, IclR  34.21 
 
 		 276 aa  117  9.999999999999999e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0769  IclR family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 260 aa  118  9.999999999999999e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0526753  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3546  regulatory protein, IclR  33.49 
 
 		 265 aa  118  9.999999999999999e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000366663  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0779  transcriptional regulator IclR  31.12 
 
 		 278 aa  117  9.999999999999999e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0813  transcriptional regulator, IclR family  32.92 
 
 		 249 aa  117  1.9999999999999998e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.225314  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0656  transcriptional regulator, IclR family  32.55 
 
 		 260 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000253097  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>