More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_2387 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012034  Athe_2387  transcriptional regulator, IclR family  100 
 
 		 257 aa  522  1e-147  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0157724  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1911  transcriptional regulator, IclR family  40.8 
 
 		 256 aa  206  4e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4386  transcriptional regulator, IclR family  40.08 
 
 		 257 aa  198  6e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.7103e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1178  IclR family transcriptional regulator  40.73 
 
 		 262 aa  196  3e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00493645  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1780  IclR family transcriptional regulator  39.11 
 
 		 272 aa  196  3e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2373  transcriptional regulator, IclR family  38.8 
 
 		 261 aa  195  6e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1855  transcriptional regulator, IclR family  38.87 
 
 		 280 aa  192  6e-48  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0417  IclR family transcriptional regulator  39.6 
 
 		 268 aa  190  1e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.116242 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1180  IclR family transcriptional regulator  40.8 
 
 		 267 aa  189  2.9999999999999997e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000286827  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3027  IclR family transcriptional regulator  39.6 
 
 		 260 aa  187  1e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000289902  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2527  transcriptional regulator, IclR family  38.06 
 
 		 265 aa  185  5e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00648168  normal  0.235147 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0514  IclR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 260 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000101936  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0443  transcriptional regulator, TrmB  40 
 
 		 254 aa  184  1.0000000000000001e-45  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.915404  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3102  transcriptional regulator, IclR family  37.55 
 
 		 260 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2531  transcriptional regulator, IclR family  36.72 
 
 		 259 aa  183  2.0000000000000003e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2833  IclR family transcriptional regulator  36.4 
 
 		 260 aa  183  3e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000013624  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3670  IclR family transcriptional regulator  39.43 
 
 		 267 aa  181  1e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.461825  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3702  transcriptional regulator, IclR family  36.84 
 
 		 252 aa  180  2e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.8457  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3644  regulatory protein, IclR  38.4 
 
 		 260 aa  180  2e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000806492  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2397  regulatory protein, IclR  38.96 
 
 		 263 aa  179  4e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.162621  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0669  transcriptional regulator, IclR family  37.2 
 
 		 260 aa  178  5.999999999999999e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.4595400000000001e-34 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01798  predicted DNA-binding transcriptional regulator  38.15 
 
 		 263 aa  177  1e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.440803  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01786  hypothetical protein  38.15 
 
 		 263 aa  177  1e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.633166  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1360  transcriptional regulator KdgR  38.15 
 
 		 263 aa  177  1e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000169219  normal  0.0136372 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0656  transcriptional regulator, IclR family  37.2 
 
 		 260 aa  177  1e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000253097  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1918  transcriptional regulator KdgR  38.15 
 
 		 263 aa  177  1e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000201259  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1805  IclR family transcriptional regulator  38.15 
 
 		 263 aa  177  1e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.954449  normal  0.233357 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2559  transcriptional regulator KdgR  38.15 
 
 		 263 aa  177  1e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000361362  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2095  transcriptional regulator KdgR  38.15 
 
 		 263 aa  177  1e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000995956  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2056  transcriptional regulator KdgR  38.15 
 
 		 263 aa  177  2e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000211216  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2055  transcriptional regulator, IclR family  36.55 
 
 		 263 aa  175  7e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0903474  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1949  transcriptional regulator, IclR family  37.35 
 
 		 263 aa  174  9.999999999999999e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00482853  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16320  Transcriptional regulator IclR  38.64 
 
 		 255 aa  174  1.9999999999999998e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  7.446e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1289  transcriptional regulator KdgR  37.75 
 
 		 263 aa  173  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000107384  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1985  transcriptional regulator KdgR  37.75 
 
 		 263 aa  173  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.364862  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1981  transcriptional regulator KdgR  37.75 
 
 		 263 aa  173  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.364283  normal  0.0913734 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1473  transcriptional regulator KdgR  37.75 
 
 		 263 aa  173  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0115946  normal  0.370857 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2177  transcriptional regulator, IclR family  36.14 
 
 		 263 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00508287  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2043  transcriptional regulator KdgR  37.75 
 
 		 263 aa  173  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.374419  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1624  transcriptional regulator, IclR family  34.82 
 
 		 275 aa  172  3.9999999999999995e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5478  transcriptional regulator, IclR family  40.09 
 
 		 249 aa  171  9e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0668  transcriptional regulator, IclR family  37.85 
 
 		 257 aa  171  1e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000062061  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1885  transcriptional regulator, IclR family  36.14 
 
 		 263 aa  171  1e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0160572  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0375  IclR family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 254 aa  170  2e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.665673 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1156  transcriptional regulator, IclR family  36.9 
 
 		 256 aa  169  3e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0417534  hitchhiker  0.00000481305 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0759  IclR family transcriptional regulator  38.65 
 
 		 261 aa  169  5e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.46118e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0370  IclR family transcriptional regulator  41.88 
 
 		 265 aa  166  4e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.470614  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2702  transcriptional regulator, IclR family  39.46 
 
 		 254 aa  166  4e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2208  transcriptional regulator, IclR family  34.41 
 
 		 290 aa  165  5.9999999999999996e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0859  transcriptional regulator IclR-like protein  36.03 
 
 		 246 aa  163  3e-39  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2510  transcriptional regulator, IclR family  37.55 
 
 		 308 aa  163  3e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00153166  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0882  IclR family transcriptional regulator  36.03 
 
 		 246 aa  163  3e-39  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000924  transcriptional regulator KdgR KDG operon repressor  36.44 
 
 		 265 aa  162  4.0000000000000004e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0779  transcriptional regulator IclR  36.95 
 
 		 278 aa  162  6e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0612  transcriptional regulator IclR  36.48 
 
 		 255 aa  161  9e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000145018 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2122  IclR family transcriptional regulator  35.34 
 
 		 263 aa  161  1e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000124752  decreased coverage  0.000111832 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2164  transcriptional regulator, IclR family  34.41 
 
 		 277 aa  159  3e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.851841  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2294  transcriptional regulator, IclR family  35.22 
 
 		 265 aa  159  3e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3109  IclR family transcriptional regulator  36.8 
 
 		 257 aa  158  7e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3333  transcriptional regulator, IclR family  31.17 
 
 		 252 aa  158  8e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.950577  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1793  IclR family transcriptional regulator  35.34 
 
 		 263 aa  156  2e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4383  IclR family transcriptional regulator  35.63 
 
 		 269 aa  157  2e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0499083 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1683  transcriptional regulator  35.34 
 
 		 263 aa  156  2e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1186  transcriptional regulator, IclR family  32.94 
 
 		 264 aa  157  2e-37  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000134584  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2653  transcriptional regulator  35.34 
 
 		 263 aa  156  3e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.618751  normal  0.01576 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1912  IclR family transcriptional regulator  34.98 
 
 		 283 aa  155  4e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2850  IclR family transcriptional regulator  34.96 
 
 		 260 aa  155  4e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000441287  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3922  regulatory proteins, IclR  33.79 
 
 		 279 aa  156  4e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.959177  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4346  regulatory protein, IclR  33.6 
 
 		 263 aa  155  6e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.361524  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3546  regulatory protein, IclR  35.08 
 
 		 265 aa  155  7e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000366663  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4893  transcriptional regulator, IclR family  35 
 
 		 262 aa  154  1e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5758  IclR family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 292 aa  154  2e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.201965  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3261  IclR family transcriptional regulator  32.94 
 
 		 284 aa  152  4e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0886  transcriptional regulator  30.89 
 
 		 280 aa  152  5.9999999999999996e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.574379  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1161  transcriptional regulator, IclR family  37.84 
 
 		 267 aa  152  5.9999999999999996e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0013559 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0458  regulatory protein, IclR  31.08 
 
 		 252 aa  152  5.9999999999999996e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0309456 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7726  IclR family transcriptional regulator  32.55 
 
 		 261 aa  152  7e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0457  transcriptional regulator IclR  33.2 
 
 		 295 aa  151  1e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2571  regulatory protein, IclR  31.85 
 
 		 258 aa  151  1e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.853506  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1885  IclR family transcriptional regulator  33.6 
 
 		 249 aa  149  3e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.216873 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2412  IclR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 258 aa  149  3e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2596  IclR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 256 aa  149  5e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2617  IclR family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 276 aa  149  6e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4307  transcriptional regulator IclR  35.32 
 
 		 273 aa  148  7e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0456166 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2064  IclR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 259 aa  147  1.0000000000000001e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.740052 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3711  transcriptional regulator, IclR family  36.24 
 
 		 257 aa  147  1.0000000000000001e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.498866 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3009  transcriptional regulator, IclR family  34.96 
 
 		 248 aa  147  2.0000000000000003e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.592723  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2698  IclR family transcriptional regulator  32.4 
 
 		 280 aa  146  3e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.505501  normal  0.569064 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0569  transcriptional regulator, IclR family  32.68 
 
 		 251 aa  146  3e-34  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3440  IclR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 273 aa  145  5e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.866579  normal  0.57268 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1318  IclR family transcriptional regulator  29.02 
 
 		 275 aa  145  7.0000000000000006e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.486749  normal  0.878274 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0724  transcriptional regulator, IclR family  35.1 
 
 		 246 aa  144  1e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0508551 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4310  Pca regulon regulatory protein PcaR  31.33 
 
 		 280 aa  144  1e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0116  IclR family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 550 aa  144  1e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2308  transcriptional regulator, IclR family  34.23 
 
 		 255 aa  144  2e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2309  transcriptional regulator, IclR family  32.51 
 
 		 253 aa  143  2e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4014  regulatory proteins, IclR  31.33 
 
 		 280 aa  144  2e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.604486  hitchhiker  0.00571873 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5403  transcriptional regulator, IclR family  32.93 
 
 		 290 aa  144  2e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.681342  normal  0.436291 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1015  IclR family transcriptional regulator  34.98 
 
 		 291 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.608912  hitchhiker  0.00000271522 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4038  transcriptional regulator, IclR family  34.73 
 
 		 260 aa  143  3e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>