More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_4647 on replicon NC_013745
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013745  Htur_4647  transcriptional regulator, IclR family  100 
 
 		 262 aa  535  1e-151  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4475  transcriptional regulator, IclR family  38.46 
 
 		 258 aa  186  4e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0192379  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3881  transcriptional regulator, IclR family  40.85 
 
 		 254 aa  176  4e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0445714  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4019  transcriptional regulator, IclR family  37.24 
 
 		 258 aa  171  1e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4694  transcriptional regulator, IclR family  40.5 
 
 		 255 aa  168  8e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.116545  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2872  transcriptional regulator, IclR family  36.51 
 
 		 255 aa  167  2e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3407  transcriptional regulator, IclR family  36.82 
 
 		 255 aa  165  6.9999999999999995e-40  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.351965  normal  0.802524 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2238  transcriptional regulator, IclR family  36.67 
 
 		 251 aa  164  1.0000000000000001e-39  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.399676  normal  0.216558 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4391  transcriptional regulator, IclR family  36.48 
 
 		 255 aa  163  3e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.143749  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2252  transcriptional regulator, IclR family  36.33 
 
 		 263 aa  162  6e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.128917  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0327  transcriptional regulator, IclR family  35.89 
 
 		 254 aa  160  2e-38  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.720721 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0824  transcriptional regulator, IclR family  39.56 
 
 		 264 aa  159  3e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4759  transcriptional regulator, IclR family  34.17 
 
 		 256 aa  158  1e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.635938  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4201  transcriptional regulator, IclR family  37.61 
 
 		 254 aa  157  2e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.191751  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4730  transcriptional regulator, IclR family  36.92 
 
 		 268 aa  154  2e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3532  transcriptional regulator, IclR family  36.36 
 
 		 256 aa  152  7e-36  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0822  transcriptional regulator, IclR family  37.38 
 
 		 258 aa  149  5e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2325  transcriptional regulator, IclR family  35.51 
 
 		 258 aa  148  1.0000000000000001e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1087  transcriptional regulator, IclR family  37.29 
 
 		 258 aa  146  4.0000000000000006e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4784  transcriptional regulator, IclR family  32.52 
 
 		 257 aa  145  6e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.820047  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1018  transcriptional regulator, IclR family  34.84 
 
 		 257 aa  140  1.9999999999999998e-32  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.142974  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4056  transcriptional regulator, IclR family  35.95 
 
 		 281 aa  139  3e-32  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0099  transcriptional regulator, IclR family  35.05 
 
 		 262 aa  139  7e-32  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4374  transcriptional regulator, IclR family  34.19 
 
 		 250 aa  138  1e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0433228  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3416  transcriptional regulator, IclR family  33.47 
 
 		 257 aa  137  1e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2575  transcriptional regulator, IclR family  31.12 
 
 		 262 aa  137  3.0000000000000003e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2861  transcriptional regulator, IclR family  34.9 
 
 		 248 aa  135  7.000000000000001e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2531  transcriptional regulator, IclR family  36.82 
 
 		 259 aa  135  9e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3940  transcriptional regulator, IclR family  38.4 
 
 		 256 aa  135  9.999999999999999e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1780  IclR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 272 aa  134  9.999999999999999e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3666  transcriptional regulator, IclR family  34.76 
 
 		 267 aa  134  1.9999999999999998e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3665  transcriptional regulator, IclR family  33.33 
 
 		 262 aa  133  1.9999999999999998e-30  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0813  transcriptional regulator, IclR family  34.73 
 
 		 249 aa  132  3.9999999999999996e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.225314  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4139  transcriptional regulator, IclR family  35.14 
 
 		 261 aa  132  5e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4386  transcriptional regulator, IclR family  38.24 
 
 		 257 aa  132  7.999999999999999e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.7103e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2373  transcriptional regulator, IclR family  33.04 
 
 		 261 aa  129  6e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4416  transcriptional regulator, IclR family  31.69 
 
 		 251 aa  127  2.0000000000000002e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1911  transcriptional regulator, IclR family  33.5 
 
 		 256 aa  126  4.0000000000000003e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0499  transcriptional regulator, IclR family  35.44 
 
 		 258 aa  125  5e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4413  transcriptional regulator, IclR family  30.74 
 
 		 251 aa  118  7.999999999999999e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0375  IclR family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 254 aa  117  3e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.665673 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0066  IclR family transcriptional regulator  31.38 
 
 		 284 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2850  IclR family transcriptional regulator  35.78 
 
 		 260 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000441287  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1949  transcriptional regulator, IclR family  28.87 
 
 		 263 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00482853  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4669  transcriptional regulator, IclR family  31.28 
 
 		 275 aa  114  2.0000000000000002e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5403  transcriptional regulator, IclR family  33.19 
 
 		 290 aa  114  2.0000000000000002e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.681342  normal  0.436291 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0101  transcriptional regulator, TrmB  34.31 
 
 		 249 aa  113  4.0000000000000004e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0417  IclR family transcriptional regulator  32.23 
 
 		 268 aa  113  4.0000000000000004e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.116242 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1156  transcriptional regulator, IclR family  34.86 
 
 		 256 aa  112  6e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0417534  hitchhiker  0.00000481305 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3456  transcriptional regulator, IclR family  32.46 
 
 		 269 aa  111  1.0000000000000001e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2055  transcriptional regulator, IclR family  28.94 
 
 		 263 aa  111  1.0000000000000001e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0903474  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1075  transcriptional regulator, IclR family  28.94 
 
 		 266 aa  110  2.0000000000000002e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2122  IclR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 263 aa  110  2.0000000000000002e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000124752  decreased coverage  0.000111832 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1161  transcriptional regulator, IclR family  31.98 
 
 		 267 aa  110  2.0000000000000002e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0013559 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2177  transcriptional regulator, IclR family  27.62 
 
 		 263 aa  110  3e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00508287  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2208  transcriptional regulator, IclR family  29.24 
 
 		 290 aa  109  5e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3702  transcriptional regulator, IclR family  29.18 
 
 		 252 aa  108  8.000000000000001e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.8457  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0612  transcriptional regulator IclR  32.83 
 
 		 255 aa  108  8.000000000000001e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000145018 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2906  transcriptional regulator, IclR family  31.82 
 
 		 254 aa  108  9.000000000000001e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0501  transcriptional regulator, IclR family  30.04 
 
 		 254 aa  108  1e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4381  transcriptional regulator, IclR family  32.9 
 
 		 254 aa  107  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0769  IclR family transcriptional regulator  33.19 
 
 		 260 aa  107  2e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0526753  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6219  IclR family transcriptional regulator  32.9 
 
 		 254 aa  107  2e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3844  transcriptional regulator, IclR family  31.67 
 
 		 270 aa  107  2e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1180  IclR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 267 aa  106  3e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000286827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0202  regulatory proteins, IclR  33.18 
 
 		 276 aa  107  3e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01798  predicted DNA-binding transcriptional regulator  28.03 
 
 		 263 aa  106  4e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.440803  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1360  transcriptional regulator KdgR  28.03 
 
 		 263 aa  106  4e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000169219  normal  0.0136372 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2056  transcriptional regulator KdgR  28.03 
 
 		 263 aa  106  4e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000211216  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1805  IclR family transcriptional regulator  28.03 
 
 		 263 aa  106  4e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.954449  normal  0.233357 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2559  transcriptional regulator KdgR  28.03 
 
 		 263 aa  106  4e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000361362  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01786  hypothetical protein  28.03 
 
 		 263 aa  106  4e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.633166  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1918  transcriptional regulator KdgR  28.03 
 
 		 263 aa  106  4e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000201259  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2095  transcriptional regulator KdgR  28.03 
 
 		 263 aa  106  4e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000995956  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0808  transcriptional regulator, IclR family  29.88 
 
 		 272 aa  105  6e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1624  transcriptional regulator, IclR family  31.84 
 
 		 275 aa  105  8e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2653  transcriptional regulator  28.87 
 
 		 263 aa  104  1e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.618751  normal  0.01576 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4879  transcriptional regulator, IclR family  33.48 
 
 		 277 aa  104  1e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1550  IclR family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 276 aa  104  1e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1793  IclR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 263 aa  104  1e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1683  transcriptional regulator  28.87 
 
 		 263 aa  104  1e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5758  IclR family transcriptional regulator  31.92 
 
 		 292 aa  104  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.201965  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1885  transcriptional regulator, IclR family  27.2 
 
 		 263 aa  104  1e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0160572  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1981  transcriptional regulator KdgR  28.45 
 
 		 263 aa  104  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.364283  normal  0.0913734 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2043  transcriptional regulator KdgR  28.45 
 
 		 263 aa  104  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.374419  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1289  transcriptional regulator KdgR  28.45 
 
 		 263 aa  104  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000107384  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1473  transcriptional regulator KdgR  28.45 
 
 		 263 aa  104  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0115946  normal  0.370857 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1985  transcriptional regulator KdgR  28.45 
 
 		 263 aa  104  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.364862  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2164  transcriptional regulator, IclR family  28.88 
 
 		 277 aa  103  3e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.851841  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3102  transcriptional regulator, IclR family  31.37 
 
 		 260 aa  103  3e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3712  IclR family transcriptional regulator  33.03 
 
 		 269 aa  103  4e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.382183  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2387  transcriptional regulator, IclR family  32.39 
 
 		 257 aa  103  4e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0157724  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000924  transcriptional regulator KdgR KDG operon repressor  29.31 
 
 		 265 aa  103  4e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3031  regulatory protein, IclR  32.03 
 
 		 276 aa  103  4e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0700  IclR family transcriptional regulator  32.05 
 
 		 254 aa  102  5e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.456524  decreased coverage  0.00240678 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16320  Transcriptional regulator IclR  29.65 
 
 		 255 aa  102  5e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  7.446e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2397  regulatory protein, IclR  28.51 
 
 		 263 aa  102  5e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.162621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0457  transcriptional regulator IclR  30.23 
 
 		 295 aa  102  8e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1318  IclR family transcriptional regulator  30.74 
 
 		 275 aa  102  9e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.486749  normal  0.878274 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3670  IclR family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 267 aa  101  1e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.461825  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>