More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_5403 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013739  Cwoe_5403  transcriptional regulator, IclR family  100 
 
 		 290 aa  585  1e-166  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.681342  normal  0.436291 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2531  transcriptional regulator, IclR family  42.34 
 
 		 259 aa  185  8e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0417  IclR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 268 aa  181  1e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.116242 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1911  transcriptional regulator, IclR family  36.14 
 
 		 256 aa  176  5e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2850  IclR family transcriptional regulator  41.7 
 
 		 260 aa  176  6e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000441287  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1180  IclR family transcriptional regulator  40.87 
 
 		 267 aa  167  1e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000286827  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2373  transcriptional regulator, IclR family  36.95 
 
 		 261 aa  167  2.9999999999999998e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1156  transcriptional regulator, IclR family  41.43 
 
 		 256 aa  164  1.0000000000000001e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0417534  hitchhiker  0.00000481305 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3670  IclR family transcriptional regulator  35.45 
 
 		 267 aa  161  1e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.461825  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3644  regulatory protein, IclR  37.45 
 
 		 260 aa  159  7e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000806492  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1178  IclR family transcriptional regulator  38.15 
 
 		 262 aa  158  8e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00493645  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2164  transcriptional regulator, IclR family  37.5 
 
 		 277 aa  158  1e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.851841  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5943  transcriptional regulator, IclR family  42.37 
 
 		 257 aa  157  2e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3440  IclR family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 273 aa  156  3e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.866579  normal  0.57268 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1780  IclR family transcriptional regulator  36.19 
 
 		 272 aa  155  1e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0669  transcriptional regulator, IclR family  37.07 
 
 		 260 aa  154  1e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.4595400000000001e-34 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3102  transcriptional regulator, IclR family  35.63 
 
 		 260 aa  154  2e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0375  IclR family transcriptional regulator  37.4 
 
 		 254 aa  154  2e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.665673 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16320  Transcriptional regulator IclR  38.67 
 
 		 255 aa  153  4e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  7.446e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0668  transcriptional regulator, IclR family  33.86 
 
 		 257 aa  153  4e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000062061  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0656  transcriptional regulator, IclR family  36.68 
 
 		 260 aa  151  1e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000253097  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2257  IclR family transcriptional regulator  43.19 
 
 		 259 aa  150  2e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.115222 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0514  IclR family transcriptional regulator  36.29 
 
 		 260 aa  150  2e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000101936  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0849  regulatory proteins, IclR  41.87 
 
 		 276 aa  150  2e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2833  IclR family transcriptional regulator  36.48 
 
 		 260 aa  150  2e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000013624  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4307  transcriptional regulator IclR  35.2 
 
 		 273 aa  150  2e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0456166 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2055  transcriptional regulator, IclR family  33.33 
 
 		 263 aa  150  3e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0903474  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1949  transcriptional regulator, IclR family  33.72 
 
 		 263 aa  149  4e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00482853  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1885  transcriptional regulator, IclR family  33.72 
 
 		 263 aa  149  7e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0160572  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0457  transcriptional regulator IclR  34 
 
 		 295 aa  148  9e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0712  transcriptional regulator, IclR family  41.77 
 
 		 265 aa  147  1.0000000000000001e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.93668  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3431  IclR family transcriptional regulator  40.79 
 
 		 251 aa  147  2.0000000000000003e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4386  transcriptional regulator, IclR family  33.87 
 
 		 257 aa  146  4.0000000000000006e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.7103e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2397  regulatory protein, IclR  32.56 
 
 		 263 aa  145  8.000000000000001e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.162621  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3702  transcriptional regulator, IclR family  34.8 
 
 		 252 aa  144  1e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.8457  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2387  transcriptional regulator, IclR family  32.93 
 
 		 257 aa  144  2e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0157724  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2596  IclR family transcriptional regulator  42.17 
 
 		 256 aa  144  2e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2177  transcriptional regulator, IclR family  32.95 
 
 		 263 aa  143  3e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00508287  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4762  transcriptional regulator, IclR family  38.62 
 
 		 248 aa  143  4e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0759  IclR family transcriptional regulator  35.74 
 
 		 261 aa  143  4e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.46118e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3027  IclR family transcriptional regulator  36.15 
 
 		 260 aa  142  5e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000289902  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3210  transcriptional regulator, IclR family  38.89 
 
 		 251 aa  142  6e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1985  transcriptional regulator KdgR  32.94 
 
 		 263 aa  142  8e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.364862  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1981  transcriptional regulator KdgR  32.94 
 
 		 263 aa  142  8e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.364283  normal  0.0913734 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2043  transcriptional regulator KdgR  32.94 
 
 		 263 aa  142  8e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.374419  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1473  transcriptional regulator KdgR  32.94 
 
 		 263 aa  142  8e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0115946  normal  0.370857 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1289  transcriptional regulator KdgR  32.94 
 
 		 263 aa  142  8e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000107384  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01798  predicted DNA-binding transcriptional regulator  33.33 
 
 		 263 aa  141  9.999999999999999e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.440803  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1918  transcriptional regulator KdgR  33.33 
 
 		 263 aa  141  9.999999999999999e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000201259  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1805  IclR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 263 aa  141  9.999999999999999e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.954449  normal  0.233357 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3546  regulatory protein, IclR  37.02 
 
 		 265 aa  141  9.999999999999999e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000366663  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2527  transcriptional regulator, IclR family  35.63 
 
 		 265 aa  141  9.999999999999999e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00648168  normal  0.235147 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0066  IclR family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 284 aa  141  9.999999999999999e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1855  transcriptional regulator, IclR family  34.13 
 
 		 280 aa  141  9.999999999999999e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2095  transcriptional regulator KdgR  33.33 
 
 		 263 aa  141  9.999999999999999e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000995956  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01786  hypothetical protein  33.33 
 
 		 263 aa  141  9.999999999999999e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.633166  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1360  transcriptional regulator KdgR  33.33 
 
 		 263 aa  141  9.999999999999999e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000169219  normal  0.0136372 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2559  transcriptional regulator KdgR  33.33 
 
 		 263 aa  141  9.999999999999999e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000361362  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2122  IclR family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 263 aa  141  1.9999999999999998e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000124752  decreased coverage  0.000111832 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2056  transcriptional regulator KdgR  33.33 
 
 		 263 aa  141  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000211216  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1885  IclR family transcriptional regulator  35.46 
 
 		 249 aa  140  3e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.216873 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2702  transcriptional regulator, IclR family  34.07 
 
 		 254 aa  139  3.9999999999999997e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4797  transcriptional regulator, IclR family  41.7 
 
 		 258 aa  138  8.999999999999999e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4531  IclR family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 283 aa  137  2e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.924227  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4604  regulatory proteins, IclR  38.4 
 
 		 251 aa  137  2e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2617  IclR family transcriptional regulator  35.08 
 
 		 276 aa  137  3.0000000000000003e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3853  IclR family transcriptional regulator  38.06 
 
 		 263 aa  137  3.0000000000000003e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.532852  hitchhiker  0.00959131 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0443  transcriptional regulator, TrmB  34.22 
 
 		 254 aa  135  7.000000000000001e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.915404  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1683  transcriptional regulator  31.78 
 
 		 263 aa  134  9.999999999999999e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2653  transcriptional regulator  31.78 
 
 		 263 aa  134  9.999999999999999e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.618751  normal  0.01576 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1793  IclR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 263 aa  134  9.999999999999999e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2208  transcriptional regulator, IclR family  33.73 
 
 		 290 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0265  transcriptional regulator, IclR family  41.32 
 
 		 264 aa  133  3e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0368  transcriptional repressor IclR  34.92 
 
 		 277 aa  133  3e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0458  regulatory protein, IclR  33.2 
 
 		 252 aa  133  3.9999999999999996e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0309456 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1407  transcriptional regulator, IclR family  34.25 
 
 		 257 aa  132  5e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3456  transcriptional regulator, IclR family  34.21 
 
 		 269 aa  132  6e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2890  transcriptional regulator, IclR family  36.84 
 
 		 266 aa  132  6.999999999999999e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2912  transcriptional regulator, IclR family  36.84 
 
 		 266 aa  132  6.999999999999999e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.138911  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2240  regulatory protein, IclR  35.22 
 
 		 262 aa  132  6.999999999999999e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3924  transcriptional repressor IclR  34.4 
 
 		 280 aa  132  7.999999999999999e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0367  transcriptional repressor IclR  34.4 
 
 		 280 aa  132  7.999999999999999e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.504781  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0297  transcriptional repressor IclR  34.4 
 
 		 280 aa  132  7.999999999999999e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0438568  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0370  IclR family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 265 aa  131  1.0000000000000001e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.470614  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1318  IclR family transcriptional regulator  33.46 
 
 		 275 aa  132  1.0000000000000001e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.486749  normal  0.878274 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09640  transcriptional regulator, IclR family  42.19 
 
 		 257 aa  130  2.0000000000000002e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.936146  normal  0.241147 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0453  transcriptional repressor IclR  35.55 
 
 		 277 aa  130  3e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0122119  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3333  transcriptional regulator, IclR family  33.2 
 
 		 252 aa  129  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.950577  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0859  transcriptional regulator IclR-like protein  28.23 
 
 		 246 aa  130  4.0000000000000003e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0882  IclR family transcriptional regulator  28.23 
 
 		 246 aa  130  4.0000000000000003e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0886  transcriptional regulator  32.4 
 
 		 280 aa  129  4.0000000000000003e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.574379  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5128  transcriptional regulator, IclR family  37.83 
 
 		 251 aa  129  5.0000000000000004e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1099  transcriptional regulator, IclR family  35.71 
 
 		 266 aa  129  5.0000000000000004e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00311315  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3712  IclR family transcriptional regulator  34.82 
 
 		 269 aa  129  6e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.382183  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2873  transcriptional regulator, IclR family  33.46 
 
 		 257 aa  129  6e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0130818 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1381  transcriptional regulator, IclR family  37.6 
 
 		 259 aa  129  7.000000000000001e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0265697  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3922  regulatory proteins, IclR  34.38 
 
 		 279 aa  129  7.000000000000001e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.959177  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0115  transcriptional regulator, IclR family  37.82 
 
 		 279 aa  129  7.000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.587027  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0221  transcriptional repressor IclR  35.71 
 
 		 275 aa  128  9.000000000000001e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0850662 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0533  transcriptional regulator, IclR family  38.12 
 
 		 247 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>