More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_2325 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013743  Htur_2325  transcriptional regulator, IclR family  100 
 
 		 258 aa  527  1e-149  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3416  transcriptional regulator, IclR family  75.49 
 
 		 257 aa  395  1e-109  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2872  transcriptional regulator, IclR family  43.9 
 
 		 255 aa  209  5e-53  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4759  transcriptional regulator, IclR family  41.13 
 
 		 256 aa  194  2e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.635938  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1018  transcriptional regulator, IclR family  44.9 
 
 		 257 aa  193  2e-48  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.142974  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0824  transcriptional regulator, IclR family  40.65 
 
 		 264 aa  193  2e-48  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4019  transcriptional regulator, IclR family  40.71 
 
 		 258 aa  191  1e-47  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1087  transcriptional regulator, IclR family  39.53 
 
 		 258 aa  187  2e-46  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0327  transcriptional regulator, IclR family  41.87 
 
 		 254 aa  185  6e-46  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.720721 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2252  transcriptional regulator, IclR family  41.46 
 
 		 263 aa  183  2.0000000000000003e-45  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.128917  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3407  transcriptional regulator, IclR family  39.84 
 
 		 255 aa  184  2.0000000000000003e-45  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.351965  normal  0.802524 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4391  transcriptional regulator, IclR family  38.21 
 
 		 255 aa  179  4e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.143749  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3532  transcriptional regulator, IclR family  40.49 
 
 		 256 aa  178  5.999999999999999e-44  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4475  transcriptional regulator, IclR family  36.61 
 
 		 258 aa  176  5e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0192379  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3665  transcriptional regulator, IclR family  37.74 
 
 		 262 aa  174  9.999999999999999e-43  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0501  transcriptional regulator, IclR family  40.47 
 
 		 254 aa  172  5e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0822  transcriptional regulator, IclR family  35.04 
 
 		 258 aa  167  2e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3881  transcriptional regulator, IclR family  38.21 
 
 		 254 aa  166  2.9999999999999998e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0445714  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0099  transcriptional regulator, IclR family  34.4 
 
 		 262 aa  162  5.0000000000000005e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4694  transcriptional regulator, IclR family  37.7 
 
 		 255 aa  161  9e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.116545  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2238  transcriptional regulator, IclR family  36.73 
 
 		 251 aa  160  2e-38  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.399676  normal  0.216558 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4139  transcriptional regulator, IclR family  38.91 
 
 		 261 aa  158  7e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2906  transcriptional regulator, IclR family  37.96 
 
 		 254 aa  158  1e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4413  transcriptional regulator, IclR family  38.06 
 
 		 251 aa  157  1e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3666  transcriptional regulator, IclR family  35.63 
 
 		 267 aa  157  1e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0808  transcriptional regulator, IclR family  35.55 
 
 		 272 aa  156  3e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4056  transcriptional regulator, IclR family  37.45 
 
 		 281 aa  155  5.0000000000000005e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4416  transcriptional regulator, IclR family  35.95 
 
 		 251 aa  153  2.9999999999999998e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1075  transcriptional regulator, IclR family  34.12 
 
 		 266 aa  152  5.9999999999999996e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3940  transcriptional regulator, IclR family  38.74 
 
 		 256 aa  152  5.9999999999999996e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4374  transcriptional regulator, IclR family  33.47 
 
 		 250 aa  151  1e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0433228  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2575  transcriptional regulator, IclR family  35.97 
 
 		 262 aa  149  6e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4647  transcriptional regulator, IclR family  35.51 
 
 		 262 aa  148  9e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0499  transcriptional regulator, IclR family  40.17 
 
 		 258 aa  147  1.0000000000000001e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0947  transcriptional regulator, IclR family  34.51 
 
 		 258 aa  145  6e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.264338 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4201  transcriptional regulator, IclR family  34.01 
 
 		 254 aa  145  8.000000000000001e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.191751  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4879  transcriptional regulator, IclR family  35.39 
 
 		 277 aa  142  5e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0813  transcriptional regulator, IclR family  35.12 
 
 		 249 aa  141  9.999999999999999e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.225314  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3844  transcriptional regulator, IclR family  35.06 
 
 		 270 aa  138  8.999999999999999e-32  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4669  transcriptional regulator, IclR family  34.4 
 
 		 275 aa  138  1e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4730  transcriptional regulator, IclR family  33.48 
 
 		 268 aa  137  1e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0101  transcriptional regulator, TrmB  36.29 
 
 		 249 aa  134  9.999999999999999e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4784  transcriptional regulator, IclR family  32.02 
 
 		 257 aa  127  2.0000000000000002e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.820047  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0417  IclR family transcriptional regulator  36.87 
 
 		 268 aa  126  3e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.116242 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0375  IclR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 254 aa  124  2e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.665673 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0769  IclR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 260 aa  119  3.9999999999999996e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0526753  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2531  transcriptional regulator, IclR family  33.33 
 
 		 259 aa  117  9.999999999999999e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1911  transcriptional regulator, IclR family  32.17 
 
 		 256 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2861  transcriptional regulator, IclR family  36.03 
 
 		 248 aa  116  3e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2373  transcriptional regulator, IclR family  33.48 
 
 		 261 aa  115  5e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1780  IclR family transcriptional regulator  32.34 
 
 		 272 aa  114  1.0000000000000001e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2397  regulatory protein, IclR  30.8 
 
 		 263 aa  113  3e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.162621  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2833  IclR family transcriptional regulator  30.52 
 
 		 260 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000013624  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1180  IclR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 267 aa  112  7.000000000000001e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000286827  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4386  transcriptional regulator, IclR family  31.73 
 
 		 257 aa  111  1.0000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.7103e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3853  IclR family transcriptional regulator  33.19 
 
 		 263 aa  109  4.0000000000000004e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.532852  hitchhiker  0.00959131 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1855  transcriptional regulator, IclR family  33.78 
 
 		 280 aa  108  6e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1912  IclR family transcriptional regulator  34.73 
 
 		 283 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2055  transcriptional regulator, IclR family  29.6 
 
 		 263 aa  108  1e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0903474  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2698  IclR family transcriptional regulator  29.53 
 
 		 280 aa  107  2e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.505501  normal  0.569064 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0514  IclR family transcriptional regulator  30.24 
 
 		 260 aa  105  5e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000101936  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3440  IclR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 273 aa  105  7e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.866579  normal  0.57268 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1825  transcriptional regulator, IclR family  35.9 
 
 		 266 aa  105  8e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.191409  normal  0.0157827 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1985  transcriptional regulator KdgR  29.6 
 
 		 263 aa  104  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.364862  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3456  transcriptional regulator, IclR family  31.62 
 
 		 269 aa  104  1e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1473  transcriptional regulator KdgR  29.6 
 
 		 263 aa  104  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0115946  normal  0.370857 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2122  IclR family transcriptional regulator  30.32 
 
 		 263 aa  104  1e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000124752  decreased coverage  0.000111832 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2043  transcriptional regulator KdgR  29.6 
 
 		 263 aa  104  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.374419  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1981  transcriptional regulator KdgR  29.6 
 
 		 263 aa  104  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.364283  normal  0.0913734 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1289  transcriptional regulator KdgR  29.6 
 
 		 263 aa  104  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000107384  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0920  IclR family transcriptional regulator  33.47 
 
 		 282 aa  103  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.687031  normal  0.0182204 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2850  IclR family transcriptional regulator  33.2 
 
 		 260 aa  103  2e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000441287  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5403  transcriptional regulator, IclR family  33.63 
 
 		 290 aa  103  3e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.681342  normal  0.436291 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2257  IclR family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 259 aa  103  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.115222 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1161  transcriptional regulator, IclR family  28.76 
 
 		 267 aa  103  3e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0013559 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3102  transcriptional regulator, IclR family  29.67 
 
 		 260 aa  103  4e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01798  predicted DNA-binding transcriptional regulator  28.4 
 
 		 263 aa  102  6e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.440803  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2095  transcriptional regulator KdgR  28.4 
 
 		 263 aa  102  6e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000995956  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2559  transcriptional regulator KdgR  28.4 
 
 		 263 aa  102  6e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000361362  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2147  transcriptional regulator, IclR family  28.97 
 
 		 250 aa  102  6e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01786  hypothetical protein  28.4 
 
 		 263 aa  102  6e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.633166  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1805  IclR family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 263 aa  102  6e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.954449  normal  0.233357 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1360  transcriptional regulator KdgR  28.4 
 
 		 263 aa  102  6e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000169219  normal  0.0136372 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1918  transcriptional regulator KdgR  28.4 
 
 		 263 aa  102  6e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000201259  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1949  transcriptional regulator, IclR family  29.26 
 
 		 263 aa  102  8e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00482853  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2387  transcriptional regulator, IclR family  28.8 
 
 		 257 aa  101  1e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0157724  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2056  transcriptional regulator KdgR  28.4 
 
 		 263 aa  101  1e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000211216  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3089  transcriptional regulator, IclR family  28.97 
 
 		 250 aa  101  1e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2177  transcriptional regulator, IclR family  28.82 
 
 		 263 aa  100  2e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00508287  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2596  IclR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 256 aa  100  2e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3031  regulatory protein, IclR  29.13 
 
 		 276 aa  100  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3121  transcriptional regulator, IclR family  28.97 
 
 		 250 aa  100  3e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000351533  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0202  regulatory proteins, IclR  28.7 
 
 		 276 aa  100  3e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4762  transcriptional regulator, IclR family  30.67 
 
 		 248 aa  99.8  4e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2822  IclR family transcriptional regulator  28.05 
 
 		 264 aa  99  7e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0759  IclR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 261 aa  98.6  8e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.46118e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2571  regulatory protein, IclR  30.73 
 
 		 258 aa  98.6  9e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.853506  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1550  IclR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 276 aa  97.8  1e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0370  IclR family transcriptional regulator  31.47 
 
 		 265 aa  98.2  1e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.470614  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1624  transcriptional regulator, IclR family  29.71 
 
 		 275 aa  97.8  1e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>