More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_4374 on replicon NC_013744
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013744  Htur_4374  transcriptional regulator, IclR family  100 
 
 
250 aa  511  1e-144  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0433228  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0813  transcriptional regulator, IclR family  76 
 
 
249 aa  387  1e-107  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.225314  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3881  transcriptional regulator, IclR family  44.88 
 
 
254 aa  208  9e-53  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0445714  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3407  transcriptional regulator, IclR family  39.34 
 
 
255 aa  202  5e-51  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.351965  normal  0.802524 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2238  transcriptional regulator, IclR family  40.98 
 
 
251 aa  194  8.000000000000001e-49  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.399676  normal  0.216558 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4416  transcriptional regulator, IclR family  38.37 
 
 
251 aa  193  3e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4475  transcriptional regulator, IclR family  40.16 
 
 
258 aa  185  8e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0192379  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4391  transcriptional regulator, IclR family  39.34 
 
 
255 aa  181  1e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.143749  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4694  transcriptional regulator, IclR family  39.51 
 
 
255 aa  179  4e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.116545  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4413  transcriptional regulator, IclR family  37.76 
 
 
251 aa  177  2e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0327  transcriptional regulator, IclR family  37.45 
 
 
254 aa  162  4.0000000000000004e-39  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.720721 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1087  transcriptional regulator, IclR family  34.01 
 
 
258 aa  158  7e-38  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1018  transcriptional regulator, IclR family  37.65 
 
 
257 aa  157  1e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.142974  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0822  transcriptional regulator, IclR family  35.59 
 
 
258 aa  156  3e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0808  transcriptional regulator, IclR family  37.4 
 
 
272 aa  155  5.0000000000000005e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2872  transcriptional regulator, IclR family  34.71 
 
 
255 aa  154  1e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4019  transcriptional regulator, IclR family  34.84 
 
 
258 aa  154  2e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0099  transcriptional regulator, IclR family  31.43 
 
 
262 aa  152  4e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4759  transcriptional regulator, IclR family  33.47 
 
 
256 aa  151  8.999999999999999e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.635938  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2325  transcriptional regulator, IclR family  33.47 
 
 
258 aa  151  1e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2252  transcriptional regulator, IclR family  34.43 
 
 
263 aa  148  6e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.128917  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1156  transcriptional regulator, IclR family  35.48 
 
 
256 aa  146  4.0000000000000006e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0417534  hitchhiker  0.00000481305 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4784  transcriptional regulator, IclR family  34.02 
 
 
257 aa  144  1e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.820047  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1075  transcriptional regulator, IclR family  32.17 
 
 
266 aa  144  1e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0824  transcriptional regulator, IclR family  33.61 
 
 
264 aa  142  6e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0886  transcriptional regulator  33.05 
 
 
280 aa  141  8e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.574379  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0947  transcriptional regulator, IclR family  33.33 
 
 
258 aa  140  9.999999999999999e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.264338 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3532  transcriptional regulator, IclR family  33.94 
 
 
256 aa  140  1.9999999999999998e-32  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3416  transcriptional regulator, IclR family  31.54 
 
 
257 aa  140  3e-32  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2906  transcriptional regulator, IclR family  34.27 
 
 
254 aa  139  4.999999999999999e-32  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4647  transcriptional regulator, IclR family  34.19 
 
 
262 aa  138  8.999999999999999e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2531  transcriptional regulator, IclR family  31.35 
 
 
259 aa  137  2e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3952  transcriptional repressor IclR  32.5 
 
 
277 aa  133  3e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.398782  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1911  transcriptional regulator, IclR family  30.08 
 
 
256 aa  132  5e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0712  transcriptional regulator, IclR family  31.15 
 
 
265 aa  131  9e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.93668  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3776  transcriptional repressor IclR  31.85 
 
 
276 aa  131  9e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0066  IclR family transcriptional regulator  34.03 
 
 
284 aa  131  1.0000000000000001e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2373  transcriptional regulator, IclR family  32 
 
 
261 aa  130  1.0000000000000001e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3440  IclR family transcriptional regulator  34.3 
 
 
273 aa  130  1.0000000000000001e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.866579  normal  0.57268 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4762  transcriptional regulator, IclR family  33.9 
 
 
248 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0453  transcriptional repressor IclR  33.33 
 
 
277 aa  130  2.0000000000000002e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0122119  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2575  transcriptional regulator, IclR family  31.4 
 
 
262 aa  130  3e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0501  transcriptional regulator, IclR family  33.73 
 
 
254 aa  129  4.0000000000000003e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1780  IclR family transcriptional regulator  31.58 
 
 
272 aa  129  6e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1318  IclR family transcriptional regulator  33.06 
 
 
275 aa  129  7.000000000000001e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.486749  normal  0.878274 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0849  regulatory proteins, IclR  33.47 
 
 
276 aa  128  9.000000000000001e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4201  transcriptional regulator, IclR family  30.86 
 
 
254 aa  128  9.000000000000001e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.191751  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1855  transcriptional regulator, IclR family  33.88 
 
 
280 aa  128  9.000000000000001e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0375  IclR family transcriptional regulator  31.98 
 
 
254 aa  127  1.0000000000000001e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.665673 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3665  transcriptional regulator, IclR family  31.71 
 
 
262 aa  128  1.0000000000000001e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3702  transcriptional regulator, IclR family  30.08 
 
 
252 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.8457  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0417  IclR family transcriptional regulator  32.11 
 
 
268 aa  126  4.0000000000000003e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.116242 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2861  transcriptional regulator, IclR family  35.89 
 
 
248 aa  126  4.0000000000000003e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1180  IclR family transcriptional regulator  32.53 
 
 
267 aa  125  5e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000286827  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2734  IclR family transcriptional regulator  32.08 
 
 
249 aa  125  6e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  7.16584e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2785  IclR family transcriptional regulator  32.08 
 
 
249 aa  125  9e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000253598  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2997  IclR family transcriptional regulator  32.08 
 
 
249 aa  125  9e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000512601  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3261  IclR family transcriptional regulator  35.53 
 
 
284 aa  124  1e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0882  IclR family transcriptional regulator  30.33 
 
 
246 aa  124  1e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0368  transcriptional repressor IclR  32.08 
 
 
277 aa  124  1e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0859  transcriptional regulator IclR-like protein  30.33 
 
 
246 aa  124  1e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0499  transcriptional regulator, IclR family  33.76 
 
 
258 aa  123  2e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4386  transcriptional regulator, IclR family  32 
 
 
257 aa  124  2e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.7103e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4879  transcriptional regulator, IclR family  31.4 
 
 
277 aa  124  2e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2995  transcriptional regulator, IclR family  31.67 
 
 
249 aa  124  2e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.71341e-17 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2571  regulatory protein, IclR  30.49 
 
 
258 aa  123  2e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.853506  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2715  IclR family transcriptional regulator  31.67 
 
 
249 aa  123  3e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000240532  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2850  IclR family transcriptional regulator  34.02 
 
 
260 aa  122  4e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000441287  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5403  transcriptional regulator, IclR family  32.91 
 
 
290 aa  122  5e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.681342  normal  0.436291 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3940  transcriptional regulator, IclR family  33.47 
 
 
256 aa  122  5e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4730  transcriptional regulator, IclR family  32.31 
 
 
268 aa  122  5e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3033  IclR family transcriptional regulator  31.67 
 
 
249 aa  122  7e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000487376  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16320  Transcriptional regulator IclR  34.39 
 
 
255 aa  122  7e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  7.446e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3031  transcriptional regulator, IclR family  31.25 
 
 
249 aa  122  7e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000276549  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0367  transcriptional repressor IclR  31.87 
 
 
280 aa  121  9.999999999999999e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.504781  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3924  transcriptional repressor IclR  31.87 
 
 
280 aa  121  9.999999999999999e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3666  transcriptional regulator, IclR family  29.03 
 
 
267 aa  121  9.999999999999999e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0457  transcriptional regulator IclR  30.74 
 
 
295 aa  121  9.999999999999999e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0297  transcriptional repressor IclR  31.87 
 
 
280 aa  121  9.999999999999999e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0438568  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4139  transcriptional regulator, IclR family  31 
 
 
261 aa  120  1.9999999999999998e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1178  IclR family transcriptional regulator  32.14 
 
 
262 aa  120  3e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00493645  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2698  IclR family transcriptional regulator  35.02 
 
 
280 aa  120  3e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.505501  normal  0.569064 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3922  regulatory proteins, IclR  33.47 
 
 
279 aa  119  6e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.959177  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0443  transcriptional regulator, TrmB  32.39 
 
 
254 aa  119  6e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.915404  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2324  regulatory protein IclR  33.33 
 
 
250 aa  119  7e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000642248  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1604  IclR family transcriptional regulator  30.96 
 
 
259 aa  117  9.999999999999999e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.379428  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2412  IclR family transcriptional regulator  29.67 
 
 
258 aa  117  9.999999999999999e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03890  DNA-binding transcriptional repressor  29.84 
 
 
274 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3979  transcriptional regulator, IclR family  29.84 
 
 
274 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2248  transcriptional regulator, IclR family  30.83 
 
 
249 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000546627  hitchhiker  0.000278056 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4562  transcriptional repressor IclR  29.84 
 
 
274 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4491  transcriptional repressor IclR  29.84 
 
 
276 aa  117  1.9999999999999998e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.880691  normal  0.328338 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2997  transcriptional regulator, IclR family  30.42 
 
 
249 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000293237  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4471  transcriptional repressor IclR  29.84 
 
 
274 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.215784  normal  0.0860899 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4012  transcriptional repressor IclR  29.84 
 
 
274 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.992009  normal  0.0359052 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03850  hypothetical protein  29.84 
 
 
274 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4307  transcriptional regulator IclR  32.24 
 
 
273 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0456166 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5488  transcriptional repressor IclR  29.84 
 
 
274 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.901357  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4254  transcriptional repressor IclR  29.84 
 
 
274 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.084393  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0416  regulatory proteins, IclR  27 
 
 
246 aa  116  3.9999999999999997e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000505949  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>