More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_4669 on replicon NC_013745
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013745  Htur_4669  transcriptional regulator, IclR family  100 
 
 
275 aa  560  1e-158  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3881  transcriptional regulator, IclR family  43.55 
 
 
254 aa  213  2.9999999999999995e-54  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0445714  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4475  transcriptional regulator, IclR family  42.68 
 
 
258 aa  200  1.9999999999999998e-50  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0192379  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4391  transcriptional regulator, IclR family  40.73 
 
 
255 aa  196  3e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.143749  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3407  transcriptional regulator, IclR family  39.92 
 
 
255 aa  196  5.000000000000001e-49  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.351965  normal  0.802524 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0327  transcriptional regulator, IclR family  38.58 
 
 
254 aa  185  6e-46  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.720721 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1087  transcriptional regulator, IclR family  38.31 
 
 
258 aa  181  1e-44  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3665  transcriptional regulator, IclR family  39.11 
 
 
262 aa  174  9.999999999999999e-43  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2238  transcriptional regulator, IclR family  37.14 
 
 
251 aa  171  1e-41  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.399676  normal  0.216558 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4694  transcriptional regulator, IclR family  38.11 
 
 
255 aa  170  2e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.116545  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0947  transcriptional regulator, IclR family  40.73 
 
 
258 aa  169  5e-41  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.264338 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0808  transcriptional regulator, IclR family  38.06 
 
 
272 aa  166  5e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4784  transcriptional regulator, IclR family  37.93 
 
 
257 aa  165  9e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.820047  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2872  transcriptional regulator, IclR family  36.61 
 
 
255 aa  163  3e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4201  transcriptional regulator, IclR family  35.89 
 
 
254 aa  161  9e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.191751  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2252  transcriptional regulator, IclR family  36.44 
 
 
263 aa  158  7e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.128917  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2575  transcriptional regulator, IclR family  36.33 
 
 
262 aa  156  3e-37  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4416  transcriptional regulator, IclR family  35.37 
 
 
251 aa  154  1e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0822  transcriptional regulator, IclR family  34.16 
 
 
258 aa  154  2e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4413  transcriptional regulator, IclR family  37.75 
 
 
251 aa  153  2e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2325  transcriptional regulator, IclR family  34.4 
 
 
258 aa  152  4e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1018  transcriptional regulator, IclR family  34.94 
 
 
257 aa  151  8.999999999999999e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.142974  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0824  transcriptional regulator, IclR family  36.14 
 
 
264 aa  150  2e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4759  transcriptional regulator, IclR family  34.43 
 
 
256 aa  149  4e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.635938  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3416  transcriptional regulator, IclR family  34.55 
 
 
257 aa  147  2.0000000000000003e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3532  transcriptional regulator, IclR family  34.69 
 
 
256 aa  145  7.0000000000000006e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0099  transcriptional regulator, IclR family  32.8 
 
 
262 aa  145  9e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0375  IclR family transcriptional regulator  35.27 
 
 
254 aa  141  9.999999999999999e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.665673 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4019  transcriptional regulator, IclR family  32.11 
 
 
258 aa  136  3.0000000000000003e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1075  transcriptional regulator, IclR family  30.31 
 
 
266 aa  134  1.9999999999999998e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2906  transcriptional regulator, IclR family  33.6 
 
 
254 aa  132  9e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0501  transcriptional regulator, IclR family  33.47 
 
 
254 aa  131  1.0000000000000001e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4879  transcriptional regulator, IclR family  31.2 
 
 
277 aa  127  2.0000000000000002e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3666  transcriptional regulator, IclR family  31.18 
 
 
267 aa  126  3e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2861  transcriptional regulator, IclR family  35.54 
 
 
248 aa  126  5e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4374  transcriptional regulator, IclR family  30.74 
 
 
250 aa  125  5e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0433228  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0370  IclR family transcriptional regulator  35.09 
 
 
265 aa  124  1e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.470614  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4647  transcriptional regulator, IclR family  31.28 
 
 
262 aa  124  2e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4730  transcriptional regulator, IclR family  32.13 
 
 
268 aa  121  9.999999999999999e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1156  transcriptional regulator, IclR family  33.77 
 
 
256 aa  119  4.9999999999999996e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0417534  hitchhiker  0.00000481305 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19700  transcriptional regulator, IclR family  33.76 
 
 
272 aa  119  6e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.089385  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3109  IclR family transcriptional regulator  33.77 
 
 
257 aa  119  7e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3456  transcriptional regulator, IclR family  33.07 
 
 
269 aa  119  7e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0886  transcriptional regulator  30.21 
 
 
280 aa  119  7.999999999999999e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.574379  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3844  transcriptional regulator, IclR family  31.39 
 
 
270 aa  119  7.999999999999999e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0813  transcriptional regulator, IclR family  31.56 
 
 
249 aa  118  9e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.225314  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3940  transcriptional regulator, IclR family  33.73 
 
 
256 aa  118  9.999999999999999e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0101  transcriptional regulator, TrmB  33.06 
 
 
249 aa  117  9.999999999999999e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0514  IclR family transcriptional regulator  34.36 
 
 
260 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000101936  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3027  IclR family transcriptional regulator  32 
 
 
260 aa  117  3e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000289902  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0669  transcriptional regulator, IclR family  33.33 
 
 
260 aa  117  3e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.4595400000000001e-34 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1780  IclR family transcriptional regulator  31.17 
 
 
272 aa  116  3.9999999999999997e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0759  IclR family transcriptional regulator  34.48 
 
 
261 aa  116  5e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.46118e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0499  transcriptional regulator, IclR family  32.91 
 
 
258 aa  115  6e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2617  IclR family transcriptional regulator  28.97 
 
 
276 aa  115  7.999999999999999e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3102  transcriptional regulator, IclR family  34.36 
 
 
260 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3853  IclR family transcriptional regulator  32.47 
 
 
263 aa  114  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.532852  hitchhiker  0.00959131 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0656  transcriptional regulator, IclR family  32.47 
 
 
260 aa  113  3e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000253097  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4139  transcriptional regulator, IclR family  30.35 
 
 
261 aa  113  4.0000000000000004e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2698  IclR family transcriptional regulator  30.84 
 
 
280 aa  113  4.0000000000000004e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.505501  normal  0.569064 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1911  transcriptional regulator, IclR family  32.6 
 
 
256 aa  113  4.0000000000000004e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3644  regulatory protein, IclR  33.33 
 
 
260 aa  113  4.0000000000000004e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000806492  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2833  IclR family transcriptional regulator  32.76 
 
 
260 aa  112  8.000000000000001e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000013624  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1161  transcriptional regulator, IclR family  30.6 
 
 
267 aa  110  3e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0013559 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6211  IclR family transcriptional regulator  30.87 
 
 
282 aa  110  3e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.253024 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2850  IclR family transcriptional regulator  32.48 
 
 
260 aa  108  7.000000000000001e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000441287  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3546  regulatory protein, IclR  32.02 
 
 
265 aa  108  7.000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000366663  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2527  transcriptional regulator, IclR family  29.65 
 
 
265 aa  108  8.000000000000001e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00648168  normal  0.235147 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03890  DNA-binding transcriptional repressor  28.93 
 
 
274 aa  108  1e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4562  transcriptional repressor IclR  28.93 
 
 
274 aa  108  1e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3979  transcriptional regulator, IclR family  28.93 
 
 
274 aa  108  1e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1180  IclR family transcriptional regulator  32.91 
 
 
267 aa  108  1e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000286827  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5488  transcriptional repressor IclR  28.93 
 
 
274 aa  108  1e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.901357  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03850  hypothetical protein  28.93 
 
 
274 aa  108  1e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4012  transcriptional repressor IclR  28.93 
 
 
274 aa  108  1e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.992009  normal  0.0359052 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4254  transcriptional repressor IclR  28.93 
 
 
274 aa  108  1e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.084393  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4471  transcriptional repressor IclR  28.93 
 
 
274 aa  108  1e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.215784  normal  0.0860899 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4597  transcriptional repressor IclR  29.87 
 
 
274 aa  107  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4399  transcriptional repressor IclR  29.87 
 
 
274 aa  107  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.241135  normal  0.788445 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2373  transcriptional regulator, IclR family  32.16 
 
 
261 aa  107  2e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4524  transcriptional repressor IclR  29.87 
 
 
274 aa  107  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4521  transcriptional repressor IclR  29.87 
 
 
274 aa  107  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.693212  normal  0.182303 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4434  transcriptional repressor IclR  29.87 
 
 
274 aa  107  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1178  IclR family transcriptional regulator  30.26 
 
 
262 aa  107  3e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00493645  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16320  Transcriptional regulator IclR  31.11 
 
 
255 aa  106  3e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  7.446e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3307  IclR family transcriptional regulator  27.27 
 
 
269 aa  107  3e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3087  transcriptional regulator, TrmB  34.96 
 
 
267 aa  107  3e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.515072  normal  0.390338 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3440  IclR family transcriptional regulator  26.75 
 
 
273 aa  106  5e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.866579  normal  0.57268 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3776  transcriptional repressor IclR  29.87 
 
 
276 aa  105  7e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0221  transcriptional repressor IclR  29.52 
 
 
275 aa  105  1e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0850662 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3261  IclR family transcriptional regulator  28.7 
 
 
284 aa  103  2e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1318  IclR family transcriptional regulator  27.85 
 
 
275 aa  104  2e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.486749  normal  0.878274 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0050  IclR family transcriptional regulator  29.82 
 
 
257 aa  103  3e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.676674 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0458  regulatory protein, IclR  29.91 
 
 
252 aa  103  3e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0309456 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2503  regulatory proteins, IclR  34.5 
 
 
262 aa  103  4e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3712  IclR family transcriptional regulator  30.77 
 
 
269 aa  102  8e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.382183  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0882  IclR family transcriptional regulator  29.07 
 
 
246 aa  101  1e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3952  transcriptional repressor IclR  29 
 
 
277 aa  101  1e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.398782  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4491  transcriptional repressor IclR  29.44 
 
 
276 aa  102  1e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.880691  normal  0.328338 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0859  transcriptional regulator IclR-like protein  29.07 
 
 
246 aa  101  1e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>