More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_3027 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007517  Gmet_3027  IclR family transcriptional regulator  100 
 
 
260 aa  535  1e-151  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000289902  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0514  IclR family transcriptional regulator  90.38 
 
 
260 aa  495  1e-139  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000101936  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3644  regulatory protein, IclR  85.77 
 
 
260 aa  468  1.0000000000000001e-131  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000806492  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0669  transcriptional regulator, IclR family  83.46 
 
 
260 aa  454  1e-127  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.4595400000000001e-34 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0656  transcriptional regulator, IclR family  83.46 
 
 
260 aa  452  1.0000000000000001e-126  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000253097  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3102  transcriptional regulator, IclR family  79.23 
 
 
260 aa  433  1e-120  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2833  IclR family transcriptional regulator  77.31 
 
 
260 aa  424  1e-118  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000013624  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0759  IclR family transcriptional regulator  77.01 
 
 
261 aa  417  9.999999999999999e-116  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.46118e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3546  regulatory protein, IclR  68.36 
 
 
265 aa  367  1e-100  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000366663  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0370  IclR family transcriptional regulator  67.57 
 
 
265 aa  355  3.9999999999999996e-97  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.470614  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3109  IclR family transcriptional regulator  66 
 
 
257 aa  333  2e-90  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4346  regulatory protein, IclR  57.69 
 
 
263 aa  305  4.0000000000000004e-82  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.361524  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2064  IclR family transcriptional regulator  50.78 
 
 
259 aa  273  2.0000000000000002e-72  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.740052 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2873  transcriptional regulator, IclR family  52.23 
 
 
257 aa  259  3e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0130818 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1407  transcriptional regulator, IclR family  49.61 
 
 
257 aa  253  2.0000000000000002e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2259  IclR family transcriptional regulator  50.59 
 
 
260 aa  250  2e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.10057  hitchhiker  0.0000000211035 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0375  IclR family transcriptional regulator  43.31 
 
 
254 aa  217  1e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.665673 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1180  IclR family transcriptional regulator  42.63 
 
 
267 aa  201  9e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000286827  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1624  transcriptional regulator, IclR family  41.2 
 
 
275 aa  196  3e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2531  transcriptional regulator, IclR family  39.92 
 
 
259 aa  192  6e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1911  transcriptional regulator, IclR family  38.34 
 
 
256 aa  189  4e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2387  transcriptional regulator, IclR family  39.6 
 
 
257 aa  187  1e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0157724  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1186  transcriptional regulator, IclR family  38.4 
 
 
264 aa  187  1e-46  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000134584  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16320  Transcriptional regulator IclR  39.11 
 
 
255 aa  187  2e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  7.446e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1418  regulatory protein, IclR  36.58 
 
 
254 aa  186  2e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000240863  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0741  IclR family transcriptional regulator  36.58 
 
 
255 aa  185  7e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000156602  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2373  transcriptional regulator, IclR family  37.85 
 
 
261 aa  183  3e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1855  transcriptional regulator, IclR family  38.28 
 
 
280 aa  182  5.0000000000000004e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3702  transcriptional regulator, IclR family  38.96 
 
 
252 aa  181  7e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.8457  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2294  transcriptional regulator, IclR family  39.84 
 
 
265 aa  181  8.000000000000001e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1780  IclR family transcriptional regulator  39.11 
 
 
272 aa  180  2.9999999999999997e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2308  transcriptional regulator, IclR family  36.86 
 
 
255 aa  179  4e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1072  IclR family transcriptional regulator  35.14 
 
 
256 aa  178  8e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0478344  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1178  IclR family transcriptional regulator  38.31 
 
 
262 aa  176  2e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00493645  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0417  IclR family transcriptional regulator  36.29 
 
 
268 aa  175  8e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.116242 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4386  transcriptional regulator, IclR family  35.69 
 
 
257 aa  171  9e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.7103e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2164  transcriptional regulator, IclR family  33.73 
 
 
277 aa  165  5e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.851841  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2850  IclR family transcriptional regulator  38.43 
 
 
260 aa  166  5e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000441287  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3333  transcriptional regulator, IclR family  36.14 
 
 
252 aa  165  5.9999999999999996e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.950577  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1156  transcriptional regulator, IclR family  38.1 
 
 
256 aa  165  6.9999999999999995e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0417534  hitchhiker  0.00000481305 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0458  regulatory protein, IclR  36.14 
 
 
252 aa  164  1.0000000000000001e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0309456 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2702  transcriptional regulator, IclR family  41.07 
 
 
254 aa  160  3e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2527  transcriptional regulator, IclR family  34.27 
 
 
265 aa  159  3e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00648168  normal  0.235147 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01798  predicted DNA-binding transcriptional regulator  34.88 
 
 
263 aa  157  2e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.440803  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2571  regulatory protein, IclR  32.94 
 
 
258 aa  157  2e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.853506  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1918  transcriptional regulator KdgR  34.88 
 
 
263 aa  157  2e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000201259  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2559  transcriptional regulator KdgR  34.88 
 
 
263 aa  157  2e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000361362  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2397  regulatory protein, IclR  35.52 
 
 
263 aa  157  2e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.162621  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1805  IclR family transcriptional regulator  34.88 
 
 
263 aa  157  2e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.954449  normal  0.233357 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01786  hypothetical protein  34.88 
 
 
263 aa  157  2e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.633166  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2095  transcriptional regulator KdgR  34.88 
 
 
263 aa  157  2e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000995956  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1360  transcriptional regulator KdgR  34.88 
 
 
263 aa  157  2e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000169219  normal  0.0136372 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1473  transcriptional regulator KdgR  35.27 
 
 
263 aa  156  3e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0115946  normal  0.370857 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1981  transcriptional regulator KdgR  35.27 
 
 
263 aa  156  3e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.364283  normal  0.0913734 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1985  transcriptional regulator KdgR  35.27 
 
 
263 aa  156  3e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.364862  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1289  transcriptional regulator KdgR  35.27 
 
 
263 aa  156  3e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000107384  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3712  IclR family transcriptional regulator  34.8 
 
 
269 aa  156  3e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.382183  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2043  transcriptional regulator KdgR  35.27 
 
 
263 aa  156  3e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.374419  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2056  transcriptional regulator KdgR  34.88 
 
 
263 aa  156  3e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000211216  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2617  IclR family transcriptional regulator  33.91 
 
 
276 aa  154  1e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2055  transcriptional regulator, IclR family  34.75 
 
 
263 aa  154  1e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0903474  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2309  transcriptional regulator, IclR family  35.46 
 
 
253 aa  154  2e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3853  IclR family transcriptional regulator  35.08 
 
 
263 aa  153  2.9999999999999998e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.532852  hitchhiker  0.00959131 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0769  IclR family transcriptional regulator  37.9 
 
 
260 aa  152  5e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0526753  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2912  transcriptional regulator, IclR family  35.86 
 
 
266 aa  152  7e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.138911  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2890  transcriptional regulator, IclR family  35.86 
 
 
266 aa  152  7e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2412  IclR family transcriptional regulator  32.54 
 
 
258 aa  151  8.999999999999999e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0668  transcriptional regulator, IclR family  36.55 
 
 
257 aa  151  1e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000062061  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2510  transcriptional regulator, IclR family  34.36 
 
 
308 aa  150  3e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00153166  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0443  transcriptional regulator, TrmB  36 
 
 
254 aa  149  3e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.915404  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3440  IclR family transcriptional regulator  33.47 
 
 
273 aa  149  5e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.866579  normal  0.57268 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2354  IclR family transcriptional regulator  33.47 
 
 
258 aa  148  9e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.185931  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2032  transcriptional regulator, IclR family  36.65 
 
 
268 aa  148  1.0000000000000001e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0882  IclR family transcriptional regulator  30.65 
 
 
246 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0859  transcriptional regulator IclR-like protein  30.65 
 
 
246 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1949  transcriptional regulator, IclR family  33.59 
 
 
263 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00482853  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4762  transcriptional regulator, IclR family  34.31 
 
 
248 aa  146  3e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3307  IclR family transcriptional regulator  31.58 
 
 
269 aa  146  3e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3456  transcriptional regulator, IclR family  31.6 
 
 
269 aa  145  5e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2760  IclR family transcriptional regulator  33.6 
 
 
261 aa  145  5e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2122  IclR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
263 aa  145  6e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000124752  decreased coverage  0.000111832 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1885  transcriptional regulator, IclR family  33.2 
 
 
263 aa  145  8.000000000000001e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0160572  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2177  transcriptional regulator, IclR family  32.82 
 
 
263 aa  144  1e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00508287  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2690  transcriptional regulator, IclR family  31.73 
 
 
267 aa  144  1e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000551158  normal  0.164594 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3670  IclR family transcriptional regulator  36.36 
 
 
267 aa  144  2e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.461825  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2503  regulatory proteins, IclR  36.82 
 
 
262 aa  143  3e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2466  IclR family transcriptional regulator  36.82 
 
 
262 aa  143  3e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2511  regulatory proteins, IclR  36.82 
 
 
262 aa  143  3e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.433919 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5403  transcriptional regulator, IclR family  36.15 
 
 
290 aa  142  4e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.681342  normal  0.436291 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1395  transcriptional regulator, IclR family  31.91 
 
 
258 aa  142  5e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000767969  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4604  regulatory proteins, IclR  35.8 
 
 
251 aa  141  8e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7726  IclR family transcriptional regulator  35.25 
 
 
261 aa  141  9.999999999999999e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4491  transcriptional repressor IclR  31.73 
 
 
276 aa  140  1.9999999999999998e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.880691  normal  0.328338 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0262  IclR family transcriptional regulator  32.92 
 
 
275 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5247  IclR family transcriptional regulator  32.51 
 
 
262 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0886  transcriptional regulator  30.86 
 
 
280 aa  140  1.9999999999999998e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.574379  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4901  IclR family transcriptional regulator  32.51 
 
 
275 aa  139  3e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.182359  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5933  transcriptional regulator, IclR family  33.2 
 
 
274 aa  139  3e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.196761  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5369  IclR family transcriptional regulator  32.51 
 
 
275 aa  139  3e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.154296  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0116  IclR family transcriptional regulator  35.92 
 
 
550 aa  140  3e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>