More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_4879 on replicon NC_013746
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013746  Htur_4879  transcriptional regulator, IclR family  100 
 
 
277 aa  572  1.0000000000000001e-162  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4391  transcriptional regulator, IclR family  37.8 
 
 
255 aa  174  9.999999999999999e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.143749  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4019  transcriptional regulator, IclR family  36.07 
 
 
258 aa  172  3.9999999999999995e-42  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3407  transcriptional regulator, IclR family  38.52 
 
 
255 aa  171  1e-41  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.351965  normal  0.802524 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3666  transcriptional regulator, IclR family  39.22 
 
 
267 aa  170  2e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3665  transcriptional regulator, IclR family  39.2 
 
 
262 aa  170  2e-41  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3881  transcriptional regulator, IclR family  37.65 
 
 
254 aa  169  6e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0445714  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2575  transcriptional regulator, IclR family  38.55 
 
 
262 aa  168  8e-41  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2252  transcriptional regulator, IclR family  35.74 
 
 
263 aa  168  9e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.128917  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2872  transcriptional regulator, IclR family  36.69 
 
 
255 aa  167  1e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0824  transcriptional regulator, IclR family  38.06 
 
 
264 aa  167  2e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4475  transcriptional regulator, IclR family  37.2 
 
 
258 aa  166  5.9999999999999996e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0192379  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3532  transcriptional regulator, IclR family  36.99 
 
 
256 aa  165  8e-40  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0099  transcriptional regulator, IclR family  36.59 
 
 
262 aa  160  3e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1075  transcriptional regulator, IclR family  34.8 
 
 
266 aa  160  3e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0327  transcriptional regulator, IclR family  34.69 
 
 
254 aa  159  5e-38  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.720721 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1018  transcriptional regulator, IclR family  36.76 
 
 
257 aa  154  2e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.142974  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4730  transcriptional regulator, IclR family  34.92 
 
 
268 aa  149  5e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4759  transcriptional regulator, IclR family  34.96 
 
 
256 aa  148  9e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.635938  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3416  transcriptional regulator, IclR family  35.43 
 
 
257 aa  144  2e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0499  transcriptional regulator, IclR family  39.38 
 
 
258 aa  143  3e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2325  transcriptional regulator, IclR family  35.39 
 
 
258 aa  142  5e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2373  transcriptional regulator, IclR family  36.44 
 
 
261 aa  142  6e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2238  transcriptional regulator, IclR family  32.39 
 
 
251 aa  140  1.9999999999999998e-32  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.399676  normal  0.216558 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4784  transcriptional regulator, IclR family  34.16 
 
 
257 aa  140  1.9999999999999998e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.820047  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1087  transcriptional regulator, IclR family  36.64 
 
 
258 aa  140  3e-32  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4416  transcriptional regulator, IclR family  33.33 
 
 
251 aa  140  3e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0501  transcriptional regulator, IclR family  32.51 
 
 
254 aa  138  8.999999999999999e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0947  transcriptional regulator, IclR family  34.94 
 
 
258 aa  137  3.0000000000000003e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.264338 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4139  transcriptional regulator, IclR family  33.61 
 
 
261 aa  136  3.0000000000000003e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1911  transcriptional regulator, IclR family  34.03 
 
 
256 aa  135  6.0000000000000005e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4201  transcriptional regulator, IclR family  33.33 
 
 
254 aa  135  9.999999999999999e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.191751  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0808  transcriptional regulator, IclR family  33.06 
 
 
272 aa  129  4.0000000000000003e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0822  transcriptional regulator, IclR family  34.94 
 
 
258 aa  127  2.0000000000000002e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4413  transcriptional regulator, IclR family  33.61 
 
 
251 aa  125  5e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3940  transcriptional regulator, IclR family  37.29 
 
 
256 aa  125  8.000000000000001e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4374  transcriptional regulator, IclR family  31.4 
 
 
250 aa  124  2e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0433228  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2906  transcriptional regulator, IclR family  31.28 
 
 
254 aa  124  2e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4056  transcriptional regulator, IclR family  34.18 
 
 
281 aa  124  2e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4694  transcriptional regulator, IclR family  32.11 
 
 
255 aa  122  6e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.116545  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0813  transcriptional regulator, IclR family  30.99 
 
 
249 aa  120  3e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.225314  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0417  IclR family transcriptional regulator  34.6 
 
 
268 aa  116  3.9999999999999997e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.116242 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4669  transcriptional regulator, IclR family  31.2 
 
 
275 aa  113  3e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0443  transcriptional regulator, TrmB  31.62 
 
 
254 aa  111  1.0000000000000001e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.915404  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0457  transcriptional regulator IclR  30.14 
 
 
295 aa  110  4.0000000000000004e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1318  IclR family transcriptional regulator  32.42 
 
 
275 aa  109  4.0000000000000004e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.486749  normal  0.878274 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4307  transcriptional regulator IclR  27.69 
 
 
273 aa  109  6e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0456166 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1780  IclR family transcriptional regulator  31.58 
 
 
272 aa  108  7.000000000000001e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0859  transcriptional regulator IclR-like protein  29.39 
 
 
246 aa  108  9.000000000000001e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0882  IclR family transcriptional regulator  29.39 
 
 
246 aa  108  9.000000000000001e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2617  IclR family transcriptional regulator  30.17 
 
 
276 aa  107  2e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3031  regulatory protein, IclR  30.18 
 
 
276 aa  106  4e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2698  IclR family transcriptional regulator  28.35 
 
 
280 aa  106  5e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.505501  normal  0.569064 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4647  transcriptional regulator, IclR family  33.48 
 
 
262 aa  104  1e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0202  regulatory proteins, IclR  30.18 
 
 
276 aa  105  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1156  transcriptional regulator, IclR family  33.94 
 
 
256 aa  103  2e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0417534  hitchhiker  0.00000481305 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1161  transcriptional regulator, IclR family  29.2 
 
 
267 aa  104  2e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0013559 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3844  transcriptional regulator, IclR family  28.7 
 
 
270 aa  103  4e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5478  transcriptional regulator, IclR family  31.82 
 
 
249 aa  102  7e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2133  IclR family transcriptional regulator  31.77 
 
 
258 aa  102  7e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6211  IclR family transcriptional regulator  30.57 
 
 
282 aa  102  8e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.253024 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4386  transcriptional regulator, IclR family  31.39 
 
 
257 aa  101  1e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.7103e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1550  IclR family transcriptional regulator  29.73 
 
 
276 aa  100  2e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3261  IclR family transcriptional regulator  26.99 
 
 
284 aa  100  2e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2861  transcriptional regulator, IclR family  32.14 
 
 
248 aa  99.8  4e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3702  transcriptional regulator, IclR family  28.37 
 
 
252 aa  99.8  5e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.8457  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4762  transcriptional regulator, IclR family  30.36 
 
 
248 aa  99.8  5e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0115  transcriptional regulator, IclR family  28.95 
 
 
279 aa  99.4  6e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.587027  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0375  IclR family transcriptional regulator  28.34 
 
 
254 aa  99.4  6e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.665673 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4797  transcriptional regulator, IclR family  32.06 
 
 
258 aa  99.4  6e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2873  IclR family transcriptional regulator  31.03 
 
 
269 aa  99  7e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.394804 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0101  transcriptional regulator, TrmB  30.61 
 
 
249 aa  97.8  2e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2527  transcriptional regulator, IclR family  29.18 
 
 
265 aa  97.8  2e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00648168  normal  0.235147 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2164  transcriptional regulator, IclR family  26.94 
 
 
277 aa  97.8  2e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.851841  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4432  IclR family transcriptional regulator  27.95 
 
 
271 aa  95.9  7e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1855  transcriptional regulator, IclR family  33.5 
 
 
280 aa  95.5  8e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2309  transcriptional regulator, IclR family  29.59 
 
 
253 aa  95.5  9e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3440  IclR family transcriptional regulator  28.44 
 
 
273 aa  95.5  9e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.866579  normal  0.57268 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2850  IclR family transcriptional regulator  28.46 
 
 
260 aa  94.7  1e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000441287  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2531  transcriptional regulator, IclR family  29.66 
 
 
259 aa  95.1  1e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0779  transcriptional regulator IclR  30.73 
 
 
278 aa  95.1  1e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0769  IclR family transcriptional regulator  28.93 
 
 
260 aa  94  2e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0526753  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4531  IclR family transcriptional regulator  27.1 
 
 
283 aa  94  2e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.924227  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3922  regulatory proteins, IclR  30.67 
 
 
279 aa  94.7  2e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.959177  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0116  IclR family transcriptional regulator  31.08 
 
 
550 aa  94.7  2e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1714  regulatory protein, IclR  26.94 
 
 
249 aa  94.4  2e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.872796  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3960  transcriptional regulator, IclR family  29.33 
 
 
255 aa  92.4  8e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2294  transcriptional regulator, IclR family  31.16 
 
 
265 aa  92  9e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1912  IclR family transcriptional regulator  30.48 
 
 
283 aa  91.7  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1186  transcriptional regulator, IclR family  28.07 
 
 
264 aa  92  1e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000134584  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4887  transcriptional regulator, IclR family  26.79 
 
 
255 aa  91.7  1e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2149  IclR family transcriptional regulator, putative  27.31 
 
 
248 aa  91.3  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.999761  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0178  transcriptional regulator, IclR family  28.44 
 
 
281 aa  90.5  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0050  IclR family transcriptional regulator  31.11 
 
 
257 aa  90.5  2e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.676674 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2596  IclR family transcriptional regulator  31.2 
 
 
256 aa  90.9  2e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0886  transcriptional regulator  25.68 
 
 
280 aa  90.9  2e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.574379  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0458  regulatory protein, IclR  29.74 
 
 
252 aa  90.9  2e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0309456 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3307  IclR family transcriptional regulator  27.2 
 
 
269 aa  90.1  3e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6211  IclR family transcriptional regulator  26.14 
 
 
250 aa  90.5  3e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0668  regulatory proteins, IclR  31.84 
 
 
242 aa  89.7  4e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0128525  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>