More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_0779 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_0779  transcriptional regulator IclR  100 
 
 
278 aa  569  1e-161  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000924  transcriptional regulator KdgR KDG operon repressor  64.57 
 
 
265 aa  338  5.9999999999999996e-92  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01798  predicted DNA-binding transcriptional regulator  58.91 
 
 
263 aa  312  3.9999999999999997e-84  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.440803  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1805  IclR family transcriptional regulator  58.91 
 
 
263 aa  312  3.9999999999999997e-84  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.954449  normal  0.233357 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01786  hypothetical protein  58.91 
 
 
263 aa  312  3.9999999999999997e-84  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.633166  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1918  transcriptional regulator KdgR  58.91 
 
 
263 aa  312  3.9999999999999997e-84  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000201259  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2559  transcriptional regulator KdgR  58.91 
 
 
263 aa  312  3.9999999999999997e-84  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000361362  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2095  transcriptional regulator KdgR  58.91 
 
 
263 aa  312  3.9999999999999997e-84  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000995956  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1360  transcriptional regulator KdgR  58.91 
 
 
263 aa  312  3.9999999999999997e-84  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000169219  normal  0.0136372 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1289  transcriptional regulator KdgR  58.69 
 
 
263 aa  312  4.999999999999999e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000107384  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1981  transcriptional regulator KdgR  58.69 
 
 
263 aa  312  4.999999999999999e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.364283  normal  0.0913734 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1985  transcriptional regulator KdgR  58.69 
 
 
263 aa  312  4.999999999999999e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.364862  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2043  transcriptional regulator KdgR  58.69 
 
 
263 aa  312  4.999999999999999e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.374419  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1473  transcriptional regulator KdgR  58.69 
 
 
263 aa  312  4.999999999999999e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0115946  normal  0.370857 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2056  transcriptional regulator KdgR  58.91 
 
 
263 aa  311  9e-84  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000211216  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2397  regulatory protein, IclR  59.36 
 
 
263 aa  310  2e-83  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.162621  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1885  transcriptional regulator, IclR family  58.57 
 
 
263 aa  300  2e-80  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0160572  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2055  transcriptional regulator, IclR family  56.97 
 
 
263 aa  298  5e-80  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0903474  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2177  transcriptional regulator, IclR family  58.17 
 
 
263 aa  298  9e-80  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00508287  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1949  transcriptional regulator, IclR family  56.97 
 
 
263 aa  295  4e-79  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00482853  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2122  IclR family transcriptional regulator  55.04 
 
 
263 aa  292  5e-78  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000124752  decreased coverage  0.000111832 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1683  transcriptional regulator  56.57 
 
 
263 aa  286  2.9999999999999996e-76  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1793  IclR family transcriptional regulator  56.57 
 
 
263 aa  286  2.9999999999999996e-76  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2653  transcriptional regulator  56.18 
 
 
263 aa  285  8e-76  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.618751  normal  0.01576 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2208  transcriptional regulator, IclR family  53.91 
 
 
290 aa  279  4e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5758  IclR family transcriptional regulator  55.65 
 
 
292 aa  275  5e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.201965  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0417  IclR family transcriptional regulator  40.08 
 
 
268 aa  185  8e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.116242 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1911  transcriptional regulator, IclR family  37.5 
 
 
256 aa  175  9e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2527  transcriptional regulator, IclR family  33.99 
 
 
265 aa  164  2.0000000000000002e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00648168  normal  0.235147 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2373  transcriptional regulator, IclR family  35.08 
 
 
261 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2387  transcriptional regulator, IclR family  36.95 
 
 
257 aa  162  7e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0157724  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2531  transcriptional regulator, IclR family  34.14 
 
 
259 aa  160  3e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2617  IclR family transcriptional regulator  33.74 
 
 
276 aa  156  4e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3702  transcriptional regulator, IclR family  33.2 
 
 
252 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.8457  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3333  transcriptional regulator, IclR family  33.2 
 
 
252 aa  150  2e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.950577  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1156  transcriptional regulator, IclR family  34.94 
 
 
256 aa  150  2e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0417534  hitchhiker  0.00000481305 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3670  IclR family transcriptional regulator  34.96 
 
 
267 aa  149  5e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.461825  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0668  transcriptional regulator, IclR family  33.47 
 
 
257 aa  148  1.0000000000000001e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000062061  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0443  transcriptional regulator, TrmB  36.33 
 
 
254 aa  145  5e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.915404  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1161  transcriptional regulator, IclR family  33.73 
 
 
267 aa  145  8.000000000000001e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0013559 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0458  regulatory protein, IclR  32.79 
 
 
252 aa  145  9e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0309456 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0375  IclR family transcriptional regulator  35.63 
 
 
254 aa  144  1e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.665673 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0569  transcriptional regulator, IclR family  33.87 
 
 
251 aa  145  1e-33  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1855  transcriptional regulator, IclR family  33.59 
 
 
280 aa  143  3e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0859  transcriptional regulator IclR-like protein  34.41 
 
 
246 aa  142  4e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0882  IclR family transcriptional regulator  34.41 
 
 
246 aa  142  4e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1166  IclR family transcriptional regulator  35.14 
 
 
271 aa  142  5e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2850  IclR family transcriptional regulator  33.47 
 
 
260 aa  141  9.999999999999999e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000441287  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2164  transcriptional regulator, IclR family  32.11 
 
 
277 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.851841  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1780  IclR family transcriptional regulator  32.79 
 
 
272 aa  140  1.9999999999999998e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2240  regulatory protein, IclR  32.42 
 
 
262 aa  140  1.9999999999999998e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0547  transcriptional regulator, IclR family  29.8 
 
 
265 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.244078  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3440  IclR family transcriptional regulator  30 
 
 
273 aa  137  2e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.866579  normal  0.57268 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5478  transcriptional regulator, IclR family  35.71 
 
 
249 aa  135  6.0000000000000005e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0504  transcriptional regulator, IclR family  30.98 
 
 
266 aa  135  7.000000000000001e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4386  transcriptional regulator, IclR family  32.13 
 
 
257 aa  134  9.999999999999999e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.7103e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1178  IclR family transcriptional regulator  33.47 
 
 
262 aa  135  9.999999999999999e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00493645  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1099  transcriptional regulator, IclR family  33.96 
 
 
266 aa  132  3.9999999999999996e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00311315  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1180  IclR family transcriptional regulator  31.91 
 
 
267 aa  132  5e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000286827  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0758  IclR family transcriptional regulator  29.89 
 
 
262 aa  132  5e-30  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.00765311  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3027  IclR family transcriptional regulator  33.91 
 
 
260 aa  131  1.0000000000000001e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000289902  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0886  transcriptional regulator  28.63 
 
 
280 aa  130  2.0000000000000002e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.574379  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0370  IclR family transcriptional regulator  34.93 
 
 
265 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.470614  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0439  transcriptional regulator IclR  31.17 
 
 
286 aa  130  3e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.28447 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0514  IclR family transcriptional regulator  32.61 
 
 
260 aa  129  4.0000000000000003e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000101936  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1885  IclR family transcriptional regulator  31.71 
 
 
249 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.216873 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0416  regulatory proteins, IclR  30.49 
 
 
246 aa  129  4.0000000000000003e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000505949  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0440  DNA-binding transcriptional repressor AllR  31.52 
 
 
271 aa  129  5.0000000000000004e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0717823  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0066  IclR family transcriptional regulator  30.33 
 
 
284 aa  129  5.0000000000000004e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2335  transcriptional regulator, IclR family  32.79 
 
 
249 aa  129  6e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3102  transcriptional regulator, IclR family  31.91 
 
 
260 aa  129  6e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5128  transcriptional regulator, IclR family  30.4 
 
 
251 aa  128  8.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0724  transcriptional regulator, IclR family  33.49 
 
 
246 aa  128  9.000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0508551 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00456  DNA-binding transcriptional repressor  31.13 
 
 
271 aa  127  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.832726  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3106  transcriptional regulator, IclR family  31.13 
 
 
271 aa  127  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0580  DNA-binding transcriptional repressor AllR  31.13 
 
 
271 aa  127  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0759  IclR family transcriptional regulator  35.22 
 
 
261 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.46118e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3116  DNA-binding transcriptional repressor AllR  31.13 
 
 
271 aa  127  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.129581 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0543  DNA-binding transcriptional repressor AllR  31.13 
 
 
271 aa  127  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00461  hypothetical protein  31.13 
 
 
271 aa  127  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4411  regulatory proteins, IclR  33.61 
 
 
267 aa  128  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.547579  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0668  regulatory proteins, IclR  32.92 
 
 
242 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0128525  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6621  transcriptional regulator, IclR family  30.92 
 
 
273 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.104953  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0457  transcriptional regulator IclR  28.39 
 
 
295 aa  127  3e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3109  IclR family transcriptional regulator  33.62 
 
 
257 aa  126  4.0000000000000003e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0607  DNA-binding transcriptional repressor AllR  31.54 
 
 
256 aa  126  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0549  DNA-binding transcriptional repressor AllR  31.54 
 
 
256 aa  126  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2294  transcriptional regulator, IclR family  33.07 
 
 
265 aa  125  7e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3881  transcriptional regulator, IclR family  31.47 
 
 
254 aa  125  9e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0445714  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4762  transcriptional regulator, IclR family  30.29 
 
 
248 aa  124  1e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1604  IclR family transcriptional regulator  28.51 
 
 
259 aa  124  1e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.379428  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03724  putative transcriptional regulator  29.28 
 
 
255 aa  124  2e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5569  IclR family transcriptional regulator  31.98 
 
 
319 aa  124  2e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.197648  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4307  transcriptional regulator IclR  26.25 
 
 
273 aa  124  2e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0456166 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2768  IclR family transcriptional regulator  30.71 
 
 
299 aa  124  2e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.538606  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2308  transcriptional regulator, IclR family  31.43 
 
 
255 aa  124  2e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4214  IclR family transcriptional regulator  29.28 
 
 
284 aa  124  2e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00389286 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03673  hypothetical protein  29.28 
 
 
284 aa  124  2e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0198  Transcriptional regulator IclR  29.8 
 
 
265 aa  123  3e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.101079  normal  0.134776 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3699  IclR family transcriptional regulator  30.31 
 
 
299 aa  123  3e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.258779  normal  0.616719 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>