More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_3960 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_3960  transcriptional regulator, IclR family  100 
 
 
255 aa  498  1e-140  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4887  transcriptional regulator, IclR family  54.62 
 
 
255 aa  257  1e-67  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0178  transcriptional regulator, IclR family  49.19 
 
 
281 aa  209  4e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1780  IclR family transcriptional regulator  43.44 
 
 
272 aa  162  7e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4038  transcriptional regulator, IclR family  41.83 
 
 
260 aa  149  4e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2164  transcriptional regulator, IclR family  37.14 
 
 
277 aa  142  4e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.851841  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2617  IclR family transcriptional regulator  37.4 
 
 
276 aa  142  5e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2510  transcriptional regulator, IclR family  40.16 
 
 
308 aa  141  8e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00153166  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1180  IclR family transcriptional regulator  36.43 
 
 
267 aa  139  3.9999999999999997e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000286827  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2571  regulatory protein, IclR  37.4 
 
 
258 aa  139  3.9999999999999997e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.853506  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0222  Transcriptional regulator IclR  35.63 
 
 
267 aa  137  1e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.300165  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2412  IclR family transcriptional regulator  37.4 
 
 
258 aa  138  1e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1186  transcriptional regulator, IclR family  31.38 
 
 
264 aa  137  2e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000134584  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1092  IclR family transcriptional regulator  40.93 
 
 
257 aa  135  8e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0515709 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16320  Transcriptional regulator IclR  35.19 
 
 
255 aa  135  8e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  7.446e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5943  transcriptional regulator, IclR family  39 
 
 
257 aa  134  1.9999999999999998e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2225  Transcriptional regulator IclR  39.19 
 
 
249 aa  133  3e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2373  transcriptional regulator, IclR family  34.82 
 
 
261 aa  132  3.9999999999999996e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4762  transcriptional regulator, IclR family  35.66 
 
 
248 aa  131  9e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1911  transcriptional regulator, IclR family  32.39 
 
 
256 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3711  transcriptional regulator, IclR family  36.67 
 
 
257 aa  130  2.0000000000000002e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.498866 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1018  regulatory proteins, IclR  40.18 
 
 
266 aa  129  7.000000000000001e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.069044  normal  0.18825 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3702  transcriptional regulator, IclR family  30.4 
 
 
252 aa  128  8.000000000000001e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.8457  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2503  regulatory proteins, IclR  37.55 
 
 
262 aa  128  9.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3431  IclR family transcriptional regulator  35.96 
 
 
251 aa  127  1.0000000000000001e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3776  transcriptional repressor IclR  35.24 
 
 
276 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3333  transcriptional regulator, IclR family  33.74 
 
 
252 aa  126  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.950577  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3440  IclR family transcriptional regulator  31.98 
 
 
273 aa  126  4.0000000000000003e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.866579  normal  0.57268 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2586  transcriptional regulator, IclR family  35.59 
 
 
268 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00119641 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2466  IclR family transcriptional regulator  37.14 
 
 
262 aa  126  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2511  regulatory proteins, IclR  37.14 
 
 
262 aa  126  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.433919 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0668  regulatory proteins, IclR  36.15 
 
 
242 aa  125  5e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0128525  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1161  transcriptional regulator, IclR family  32.67 
 
 
267 aa  125  5e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0013559 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1546  IclR family transcriptional regulator  35.59 
 
 
268 aa  125  6e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0208849  normal  0.0159222 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0368  transcriptional repressor IclR  33.73 
 
 
277 aa  125  9e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3952  transcriptional repressor IclR  34.19 
 
 
277 aa  124  1e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.398782  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0886  transcriptional regulator  33.33 
 
 
280 aa  124  1e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.574379  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2055  transcriptional regulator, IclR family  30.77 
 
 
263 aa  124  1e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0903474  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5438  IclR family transcriptional regulator  34.96 
 
 
269 aa  123  2e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.442503  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1138  IclR family transcriptional regulator  34.75 
 
 
269 aa  123  2e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.211589  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4201  transcriptional regulator, IclR family  33.48 
 
 
254 aa  124  2e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.191751  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5945  IclR family transcriptional regulator  34.96 
 
 
269 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0779  transcriptional regulator IclR  31.3 
 
 
278 aa  123  2e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2149  IclR family transcriptional regulator  34.96 
 
 
269 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0618427  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2132  IclR family transcriptional regulator  34.96 
 
 
269 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0887225  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0532  transcriptional regulator, IclR family  43.69 
 
 
253 aa  124  2e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0453  transcriptional repressor IclR  34.62 
 
 
277 aa  123  3e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0122119  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3210  transcriptional regulator, IclR family  34.52 
 
 
251 aa  123  3e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1465  IclR family transcriptional regulator  35.14 
 
 
268 aa  123  3e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0393345  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1099  transcriptional regulator, IclR family  33.2 
 
 
266 aa  122  4e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00311315  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2739  IclR regulatory protein  34.96 
 
 
270 aa  123  4e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1869  IclR family transcriptional regulator  34.96 
 
 
270 aa  122  4e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.32806  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6211  IclR family transcriptional regulator  34.75 
 
 
250 aa  122  4e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2606  IclR family transcriptional regulator  34.96 
 
 
270 aa  123  4e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.339666  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2661  IclR family transcriptional regulator  34.96 
 
 
270 aa  123  4e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2531  transcriptional regulator, IclR family  34.82 
 
 
259 aa  122  5e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1949  transcriptional regulator, IclR family  31.17 
 
 
263 aa  122  6e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00482853  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3903  putative transcriptional regulator  35.06 
 
 
251 aa  122  6e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.575083  normal  0.758857 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3800  putative transcriptional regulator  35.06 
 
 
251 aa  122  6e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3734  putative transcriptional regulator  35.06 
 
 
251 aa  122  6e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3842  putative transcriptional regulator  35.06 
 
 
251 aa  122  6e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.312233  normal  0.510339 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0458  regulatory protein, IclR  33.33 
 
 
252 aa  122  8e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0309456 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2169  IclR family transcriptional regulator  34.68 
 
 
269 aa  121  9e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2042  IclR family transcriptional regulator  34.68 
 
 
269 aa  121  9e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2032  transcriptional regulator, IclR family  37.25 
 
 
268 aa  120  1.9999999999999998e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2122  IclR family transcriptional regulator  30.89 
 
 
263 aa  120  1.9999999999999998e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000124752  decreased coverage  0.000111832 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1486  transcriptional regulator, IclR family  39.82 
 
 
260 aa  120  1.9999999999999998e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0569  transcriptional regulator, IclR family  27.71 
 
 
251 aa  119  3e-26  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1714  IclR family transcriptional regulator  34.51 
 
 
270 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.760018  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0367  transcriptional repressor IclR  32.67 
 
 
280 aa  119  3.9999999999999996e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.504781  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0297  transcriptional repressor IclR  32.67 
 
 
280 aa  119  3.9999999999999996e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0438568  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2223  IclR family transcriptional regulator  34.51 
 
 
270 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3670  IclR family transcriptional regulator  37.22 
 
 
267 aa  119  3.9999999999999996e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.461825  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3097  IclR family transcriptional regulator  34.51 
 
 
270 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.070392  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1495  IclR family transcriptional regulator  34.51 
 
 
270 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.684109  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3924  transcriptional repressor IclR  32.67 
 
 
280 aa  119  3.9999999999999996e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2177  transcriptional regulator, IclR family  29.96 
 
 
263 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00508287  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09640  transcriptional regulator, IclR family  36.89 
 
 
257 aa  119  6e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.936146  normal  0.241147 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0612  transcriptional regulator IclR  34.2 
 
 
255 aa  119  6e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000145018 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4491  transcriptional repressor IclR  32.4 
 
 
276 aa  119  6e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.880691  normal  0.328338 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2199  beta-ketoadipate pathway transcription regulator  37.67 
 
 
273 aa  118  7e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.745324  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0223  Transcriptional regulator IclR  38.99 
 
 
246 aa  118  7.999999999999999e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.093608  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2575  transcriptional regulator, IclR family  34.5 
 
 
262 aa  118  9e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2387  transcriptional regulator, IclR family  30.94 
 
 
257 aa  118  9e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0157724  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03890  DNA-binding transcriptional repressor  33.04 
 
 
274 aa  117  9.999999999999999e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3979  transcriptional regulator, IclR family  33.04 
 
 
274 aa  117  9.999999999999999e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03850  hypothetical protein  33.04 
 
 
274 aa  117  9.999999999999999e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4254  transcriptional repressor IclR  33.04 
 
 
274 aa  117  9.999999999999999e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.084393  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4562  transcriptional repressor IclR  33.04 
 
 
274 aa  117  9.999999999999999e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4471  transcriptional repressor IclR  33.04 
 
 
274 aa  117  9.999999999999999e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.215784  normal  0.0860899 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4012  transcriptional repressor IclR  33.04 
 
 
274 aa  117  9.999999999999999e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.992009  normal  0.0359052 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3922  regulatory proteins, IclR  35.89 
 
 
279 aa  118  9.999999999999999e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.959177  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5488  transcriptional repressor IclR  33.04 
 
 
274 aa  117  9.999999999999999e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.901357  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0115  transcriptional regulator, IclR family  33.2 
 
 
279 aa  117  1.9999999999999998e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.587027  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1885  transcriptional regulator, IclR family  29.96 
 
 
263 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0160572  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0712  transcriptional regulator, IclR family  35.29 
 
 
265 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.93668  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2208  transcriptional regulator, IclR family  32.46 
 
 
290 aa  116  3e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2170  IclR family transcriptional regulator  38.66 
 
 
252 aa  116  3e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2850  IclR family transcriptional regulator  35.65 
 
 
260 aa  116  3e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000441287  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2596  IclR family transcriptional regulator  35.75 
 
 
256 aa  116  3e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>