More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_2872 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013743  Htur_2872  transcriptional regulator, IclR family  100 
 
 		 255 aa  517  1e-146  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1018  transcriptional regulator, IclR family  68.36 
 
 		 257 aa  361  6e-99  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.142974  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4391  transcriptional regulator, IclR family  41.57 
 
 		 255 aa  212  4.9999999999999996e-54  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.143749  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0327  transcriptional regulator, IclR family  42.75 
 
 		 254 aa  209  2e-53  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.720721 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3881  transcriptional regulator, IclR family  41.5 
 
 		 254 aa  210  2e-53  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0445714  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3532  transcriptional regulator, IclR family  44.08 
 
 		 256 aa  209  3e-53  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2325  transcriptional regulator, IclR family  43.9 
 
 		 258 aa  209  5e-53  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4475  transcriptional regulator, IclR family  41.11 
 
 		 258 aa  208  7e-53  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0192379  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2575  transcriptional regulator, IclR family  45.93 
 
 		 262 aa  207  9e-53  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0099  transcriptional regulator, IclR family  41.5 
 
 		 262 aa  206  3e-52  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3407  transcriptional regulator, IclR family  40 
 
 		 255 aa  205  5e-52  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.351965  normal  0.802524 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4416  transcriptional regulator, IclR family  40.24 
 
 		 251 aa  203  2e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4019  transcriptional regulator, IclR family  40.16 
 
 		 258 aa  202  4e-51  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3416  transcriptional regulator, IclR family  40.74 
 
 		 257 aa  199  1.9999999999999998e-50  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0824  transcriptional regulator, IclR family  39.29 
 
 		 264 aa  197  2.0000000000000003e-49  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3665  transcriptional regulator, IclR family  39.92 
 
 		 262 aa  193  2e-48  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4784  transcriptional regulator, IclR family  41.5 
 
 		 257 aa  191  9e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.820047  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2238  transcriptional regulator, IclR family  39.43 
 
 		 251 aa  190  2e-47  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.399676  normal  0.216558 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2252  transcriptional regulator, IclR family  39.43 
 
 		 263 aa  188  5.999999999999999e-47  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.128917  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4694  transcriptional regulator, IclR family  41.11 
 
 		 255 aa  187  1e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.116545  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1087  transcriptional regulator, IclR family  38.46 
 
 		 258 aa  183  3e-45  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4759  transcriptional regulator, IclR family  38.62 
 
 		 256 aa  182  5.0000000000000004e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.635938  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0808  transcriptional regulator, IclR family  40.32 
 
 		 272 aa  180  2.9999999999999997e-44  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0822  transcriptional regulator, IclR family  37.85 
 
 		 258 aa  177  2e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1075  transcriptional regulator, IclR family  37.4 
 
 		 266 aa  177  2e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3666  transcriptional regulator, IclR family  38.1 
 
 		 267 aa  173  2.9999999999999996e-42  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0947  transcriptional regulator, IclR family  38.46 
 
 		 258 aa  172  6.999999999999999e-42  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.264338 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0499  transcriptional regulator, IclR family  39.44 
 
 		 258 aa  171  1e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2906  transcriptional regulator, IclR family  37.96 
 
 		 254 aa  168  7e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4413  transcriptional regulator, IclR family  39.43 
 
 		 251 aa  168  7e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4879  transcriptional regulator, IclR family  36.69 
 
 		 277 aa  167  1e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4647  transcriptional regulator, IclR family  36.51 
 
 		 262 aa  167  2e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4730  transcriptional regulator, IclR family  37.88 
 
 		 268 aa  166  2.9999999999999998e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4201  transcriptional regulator, IclR family  35.08 
 
 		 254 aa  160  2e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.191751  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0501  transcriptional regulator, IclR family  38.21 
 
 		 254 aa  159  5e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3940  transcriptional regulator, IclR family  39.68 
 
 		 256 aa  157  2e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4139  transcriptional regulator, IclR family  37.1 
 
 		 261 aa  155  6e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4374  transcriptional regulator, IclR family  34.71 
 
 		 250 aa  154  1e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0433228  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4669  transcriptional regulator, IclR family  36.61 
 
 		 275 aa  154  2e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4056  transcriptional regulator, IclR family  36.84 
 
 		 281 aa  149  6e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2373  transcriptional regulator, IclR family  35.09 
 
 		 261 aa  146  3e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1911  transcriptional regulator, IclR family  33.78 
 
 		 256 aa  145  8.000000000000001e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0813  transcriptional regulator, IclR family  38.46 
 
 		 249 aa  140  1.9999999999999998e-32  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.225314  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0101  transcriptional regulator, TrmB  37.82 
 
 		 249 aa  140  3e-32  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3456  transcriptional regulator, IclR family  35.06 
 
 		 269 aa  137  1e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4386  transcriptional regulator, IclR family  35.71 
 
 		 257 aa  136  3.0000000000000003e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.7103e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3844  transcriptional regulator, IclR family  32.44 
 
 		 270 aa  136  3.0000000000000003e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2531  transcriptional regulator, IclR family  34.91 
 
 		 259 aa  135  7.000000000000001e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3712  IclR family transcriptional regulator  34.71 
 
 		 269 aa  132  6.999999999999999e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.382183  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3027  IclR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 260 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000289902  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2833  IclR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 260 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000013624  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3109  IclR family transcriptional regulator  31.85 
 
 		 257 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30950  transcriptional regulator, IclR family  34.39 
 
 		 277 aa  127  3e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.648334  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0417  IclR family transcriptional regulator  35.04 
 
 		 268 aa  126  3e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.116242 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3440  IclR family transcriptional regulator  31.38 
 
 		 273 aa  126  3e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.866579  normal  0.57268 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3853  IclR family transcriptional regulator  35.86 
 
 		 263 aa  126  4.0000000000000003e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.532852  hitchhiker  0.00959131 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0882  IclR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 246 aa  125  6e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0859  transcriptional regulator IclR-like protein  28.95 
 
 		 246 aa  125  6e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3031  regulatory protein, IclR  32.6 
 
 		 276 aa  125  8.000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1550  IclR family transcriptional regulator  33.48 
 
 		 276 aa  124  1e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0375  IclR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 254 aa  123  2e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.665673 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0066  IclR family transcriptional regulator  35.24 
 
 		 284 aa  124  2e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0202  regulatory proteins, IclR  33.04 
 
 		 276 aa  123  2e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3702  transcriptional regulator, IclR family  32.31 
 
 		 252 aa  123  3e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.8457  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0759  IclR family transcriptional regulator  31.23 
 
 		 261 aa  122  4e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.46118e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3644  regulatory protein, IclR  31.45 
 
 		 260 aa  122  6e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000806492  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0370  IclR family transcriptional regulator  33.19 
 
 		 265 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.470614  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0514  IclR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 260 aa  119  3e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000101936  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1156  transcriptional regulator, IclR family  33.93 
 
 		 256 aa  119  3e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0417534  hitchhiker  0.00000481305 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2064  IclR family transcriptional regulator  30.12 
 
 		 259 aa  119  3.9999999999999996e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.740052 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0668  transcriptional regulator, IclR family  31.08 
 
 		 257 aa  119  3.9999999999999996e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000062061  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0669  transcriptional regulator, IclR family  30.65 
 
 		 260 aa  119  4.9999999999999996e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.4595400000000001e-34 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19700  transcriptional regulator, IclR family  32.92 
 
 		 272 aa  118  7e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.089385  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0656  transcriptional regulator, IclR family  30.65 
 
 		 260 aa  117  9.999999999999999e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000253097  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1161  transcriptional regulator, IclR family  30.4 
 
 		 267 aa  117  1.9999999999999998e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0013559 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0443  transcriptional regulator, TrmB  32.47 
 
 		 254 aa  116  3e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.915404  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2617  IclR family transcriptional regulator  29.58 
 
 		 276 aa  116  3.9999999999999997e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1318  IclR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 275 aa  115  6e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.486749  normal  0.878274 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3776  transcriptional repressor IclR  29.1 
 
 		 276 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4531  IclR family transcriptional regulator  32.64 
 
 		 283 aa  114  1.0000000000000001e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.924227  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0297  transcriptional repressor IclR  29.92 
 
 		 280 aa  114  2.0000000000000002e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0438568  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3924  transcriptional repressor IclR  29.92 
 
 		 280 aa  114  2.0000000000000002e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1180  IclR family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 267 aa  113  2.0000000000000002e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000286827  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0367  transcriptional repressor IclR  29.92 
 
 		 280 aa  114  2.0000000000000002e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.504781  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3102  transcriptional regulator, IclR family  29.84 
 
 		 260 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0769  IclR family transcriptional regulator  33.48 
 
 		 260 aa  112  7.000000000000001e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0526753  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4762  transcriptional regulator, IclR family  32.17 
 
 		 248 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0368  transcriptional repressor IclR  29.8 
 
 		 277 aa  111  1.0000000000000001e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0115  transcriptional regulator, IclR family  30.99 
 
 		 279 aa  111  1.0000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.587027  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6211  IclR family transcriptional regulator  32.19 
 
 		 282 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.253024 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0457  transcriptional regulator IclR  30.99 
 
 		 295 aa  109  3e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2861  transcriptional regulator, IclR family  32.38 
 
 		 248 aa  110  3e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3952  transcriptional repressor IclR  27.87 
 
 		 277 aa  110  3e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.398782  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2850  IclR family transcriptional regulator  29.83 
 
 		 260 aa  109  3e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000441287  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4797  transcriptional regulator, IclR family  32.37 
 
 		 258 aa  109  4.0000000000000004e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1624  transcriptional regulator, IclR family  29.96 
 
 		 275 aa  109  5e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2702  transcriptional regulator, IclR family  29.91 
 
 		 254 aa  109  5e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1239  IclR family transcriptional regulator  31.42 
 
 		 252 aa  108  7.000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2596  IclR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 256 aa  108  7.000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2890  transcriptional regulator, IclR family  32.19 
 
 		 266 aa  108  9.000000000000001e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>