More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aaci_1624 on replicon NC_013205
Organism: Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013205  Aaci_1624  transcriptional regulator, IclR family  100 
 
 
275 aa  563  1.0000000000000001e-159  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2294  transcriptional regulator, IclR family  51.17 
 
 
265 aa  258  1e-67  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2308  transcriptional regulator, IclR family  46.22 
 
 
255 aa  242  3.9999999999999997e-63  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2309  transcriptional regulator, IclR family  42.04 
 
 
253 aa  205  6e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3644  regulatory protein, IclR  40.4 
 
 
260 aa  201  8e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000806492  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0514  IclR family transcriptional regulator  41.77 
 
 
260 aa  199  6e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000101936  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3102  transcriptional regulator, IclR family  41.04 
 
 
260 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3027  IclR family transcriptional regulator  41.2 
 
 
260 aa  196  3e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000289902  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0375  IclR family transcriptional regulator  40.89 
 
 
254 aa  192  6e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.665673 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2833  IclR family transcriptional regulator  38.71 
 
 
260 aa  186  2e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000013624  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0669  transcriptional regulator, IclR family  38.8 
 
 
260 aa  186  3e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.4595400000000001e-34 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0656  transcriptional regulator, IclR family  37.35 
 
 
260 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000253097  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0759  IclR family transcriptional regulator  38 
 
 
261 aa  183  3e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.46118e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3670  IclR family transcriptional regulator  37.92 
 
 
267 aa  179  5.999999999999999e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.461825  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1911  transcriptional regulator, IclR family  35.6 
 
 
256 aa  178  1e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0370  IclR family transcriptional regulator  39.61 
 
 
265 aa  174  9.999999999999999e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.470614  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2387  transcriptional regulator, IclR family  34.82 
 
 
257 aa  172  5e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0157724  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2149  IclR family transcriptional regulator, putative  37.5 
 
 
248 aa  171  1e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.999761  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3109  IclR family transcriptional regulator  40.49 
 
 
257 aa  169  5e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2373  transcriptional regulator, IclR family  36.03 
 
 
261 aa  168  8e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2531  transcriptional regulator, IclR family  37.1 
 
 
259 aa  167  2e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1855  transcriptional regulator, IclR family  38.19 
 
 
280 aa  166  2.9999999999999998e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3546  regulatory protein, IclR  36.19 
 
 
265 aa  166  4e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000366663  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4346  regulatory protein, IclR  37.5 
 
 
263 aa  166  4e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.361524  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2064  IclR family transcriptional regulator  37.85 
 
 
259 aa  166  5e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.740052 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1780  IclR family transcriptional regulator  34.82 
 
 
272 aa  164  1.0000000000000001e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2912  transcriptional regulator, IclR family  38.7 
 
 
266 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.138911  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2890  transcriptional regulator, IclR family  38.7 
 
 
266 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2571  regulatory protein, IclR  35.57 
 
 
258 aa  162  6e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.853506  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4386  transcriptional regulator, IclR family  34.92 
 
 
257 aa  162  7e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.7103e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2702  transcriptional regulator, IclR family  35.2 
 
 
254 aa  160  2e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30950  transcriptional regulator, IclR family  34.51 
 
 
277 aa  157  2e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.648334  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1178  IclR family transcriptional regulator  33.98 
 
 
262 aa  155  8e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00493645  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2873  transcriptional regulator, IclR family  35.37 
 
 
257 aa  154  1e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0130818 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0668  transcriptional regulator, IclR family  33.6 
 
 
257 aa  154  1e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000062061  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2412  IclR family transcriptional regulator  33.99 
 
 
258 aa  152  4e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4095  IclR family transcriptional regulator  36.47 
 
 
269 aa  152  7e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.129203  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0417  IclR family transcriptional regulator  34.4 
 
 
268 aa  152  8e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.116242 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2032  transcriptional regulator, IclR family  37.75 
 
 
268 aa  151  1e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0465  IclR family transcriptional regulator  34.43 
 
 
268 aa  150  2e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0093222  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2850  IclR family transcriptional regulator  36.73 
 
 
260 aa  149  7e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000441287  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2285  transcriptional regulator, IclR family  33.85 
 
 
259 aa  147  1.0000000000000001e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1407  transcriptional regulator, IclR family  34.15 
 
 
257 aa  148  1.0000000000000001e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2397  regulatory protein, IclR  33.33 
 
 
263 aa  147  2.0000000000000003e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.162621  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3333  transcriptional regulator, IclR family  33.47 
 
 
252 aa  145  7.0000000000000006e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.950577  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1805  IclR family transcriptional regulator  32.92 
 
 
263 aa  145  8.000000000000001e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.954449  normal  0.233357 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01798  predicted DNA-binding transcriptional regulator  32.92 
 
 
263 aa  145  8.000000000000001e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.440803  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1918  transcriptional regulator KdgR  32.92 
 
 
263 aa  145  8.000000000000001e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000201259  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2095  transcriptional regulator KdgR  32.92 
 
 
263 aa  145  8.000000000000001e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000995956  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01786  hypothetical protein  32.92 
 
 
263 aa  145  8.000000000000001e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.633166  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2559  transcriptional regulator KdgR  32.92 
 
 
263 aa  145  8.000000000000001e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000361362  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1180  IclR family transcriptional regulator  32.31 
 
 
267 aa  145  8.000000000000001e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000286827  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1360  transcriptional regulator KdgR  32.92 
 
 
263 aa  145  8.000000000000001e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000169219  normal  0.0136372 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0533  transcriptional regulator, IclR family  39.27 
 
 
247 aa  144  1e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16320  Transcriptional regulator IclR  36.73 
 
 
255 aa  144  2e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  7.446e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2056  transcriptional regulator KdgR  32.92 
 
 
263 aa  144  2e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000211216  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0443  transcriptional regulator, TrmB  34.69 
 
 
254 aa  142  5e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.915404  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2122  IclR family transcriptional regulator  30.2 
 
 
263 aa  141  9.999999999999999e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000124752  decreased coverage  0.000111832 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0458  regulatory protein, IclR  33.06 
 
 
252 aa  140  1.9999999999999998e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0309456 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2617  IclR family transcriptional regulator  34.22 
 
 
276 aa  140  1.9999999999999998e-32  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3853  IclR family transcriptional regulator  32.79 
 
 
263 aa  140  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.532852  hitchhiker  0.00959131 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6599  putative transcriptional regulator, IclR family  35.32 
 
 
273 aa  140  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0547312  normal  0.643607 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3712  IclR family transcriptional regulator  35.71 
 
 
269 aa  140  1.9999999999999998e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.382183  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7726  IclR family transcriptional regulator  35.86 
 
 
261 aa  140  3e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0769  IclR family transcriptional regulator  35.11 
 
 
260 aa  139  3.9999999999999997e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0526753  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3702  transcriptional regulator, IclR family  30.36 
 
 
252 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.8457  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2259  IclR family transcriptional regulator  32.13 
 
 
260 aa  139  4.999999999999999e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.10057  hitchhiker  0.0000000211035 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2055  transcriptional regulator, IclR family  31.4 
 
 
263 aa  139  6e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0903474  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2653  transcriptional regulator  31.82 
 
 
263 aa  138  7.999999999999999e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.618751  normal  0.01576 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2778  IclR family transcriptional regulator  35.34 
 
 
253 aa  138  8.999999999999999e-32  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0655324  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1981  transcriptional regulator KdgR  29.96 
 
 
263 aa  138  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.364283  normal  0.0913734 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1289  transcriptional regulator KdgR  29.96 
 
 
263 aa  138  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000107384  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2043  transcriptional regulator KdgR  29.96 
 
 
263 aa  138  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.374419  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1473  transcriptional regulator KdgR  29.96 
 
 
263 aa  138  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0115946  normal  0.370857 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2466  IclR family transcriptional regulator  33.07 
 
 
262 aa  138  1e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1985  transcriptional regulator KdgR  29.96 
 
 
263 aa  138  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.364862  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2511  regulatory proteins, IclR  33.07 
 
 
262 aa  138  1e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.433919 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2503  regulatory proteins, IclR  33.07 
 
 
262 aa  138  1e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1793  IclR family transcriptional regulator  31.25 
 
 
263 aa  137  2e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2177  transcriptional regulator, IclR family  31.82 
 
 
263 aa  137  2e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00508287  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1239  IclR family transcriptional regulator  33.77 
 
 
252 aa  137  2e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1418  regulatory protein, IclR  29.3 
 
 
254 aa  137  2e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000240863  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0882  IclR family transcriptional regulator  31.98 
 
 
246 aa  137  2e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1683  transcriptional regulator  31.25 
 
 
263 aa  137  2e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5758  IclR family transcriptional regulator  32.52 
 
 
292 aa  137  2e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.201965  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2164  transcriptional regulator, IclR family  33.19 
 
 
277 aa  137  2e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.851841  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0859  transcriptional regulator IclR-like protein  31.98 
 
 
246 aa  137  2e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6634  IclR family transcriptional regulator  38.79 
 
 
283 aa  135  5e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0992864  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3087  transcriptional regulator, TrmB  34.14 
 
 
267 aa  135  7.000000000000001e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.515072  normal  0.390338 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1042  IclR family transcriptional regulator  32.18 
 
 
261 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00956933  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1949  transcriptional regulator, IclR family  30.58 
 
 
263 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00482853  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000924  transcriptional regulator KdgR KDG operon repressor  28.69 
 
 
265 aa  134  1.9999999999999998e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2380  IclR family transcriptional regulator  36.05 
 
 
291 aa  133  3e-30  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.610686  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1018  transcriptional regulator, IclR family  34.5 
 
 
257 aa  133  3e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.142974  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2240  regulatory protein, IclR  32.93 
 
 
262 aa  133  3.9999999999999996e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5545  regulatory protein, IclR  30.95 
 
 
251 aa  132  6e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1912  IclR family transcriptional regulator  30.33 
 
 
283 aa  132  6e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1885  transcriptional regulator, IclR family  31.4 
 
 
263 aa  132  6.999999999999999e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0160572  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4383  IclR family transcriptional regulator  34.75 
 
 
269 aa  132  7.999999999999999e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0499083 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3456  transcriptional regulator, IclR family  33.33 
 
 
269 aa  131  1.0000000000000001e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>