More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_2575 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_2575  transcriptional regulator, IclR family  100 
 
 		 262 aa  525  1e-148  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3532  transcriptional regulator, IclR family  48.98 
 
 		 256 aa  223  2e-57  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0824  transcriptional regulator, IclR family  45.56 
 
 		 264 aa  213  1.9999999999999998e-54  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4019  transcriptional regulator, IclR family  41.5 
 
 		 258 aa  209  4e-53  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2872  transcriptional regulator, IclR family  45.93 
 
 		 255 aa  207  1e-52  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1018  transcriptional regulator, IclR family  45.75 
 
 		 257 aa  204  1e-51  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.142974  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3881  transcriptional regulator, IclR family  42.68 
 
 		 254 aa  202  4e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0445714  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2252  transcriptional regulator, IclR family  42.91 
 
 		 263 aa  202  6e-51  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.128917  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2906  transcriptional regulator, IclR family  42.04 
 
 		 254 aa  194  1e-48  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1087  transcriptional regulator, IclR family  41.94 
 
 		 258 aa  188  8e-47  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0099  transcriptional regulator, IclR family  36.9 
 
 		 262 aa  182  5.0000000000000004e-45  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0501  transcriptional regulator, IclR family  39.3 
 
 		 254 aa  180  2e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4391  transcriptional regulator, IclR family  37.45 
 
 		 255 aa  177  2e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.143749  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3407  transcriptional regulator, IclR family  39.43 
 
 		 255 aa  172  3.9999999999999995e-42  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.351965  normal  0.802524 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4759  transcriptional regulator, IclR family  37.5 
 
 		 256 aa  172  5.999999999999999e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.635938  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0327  transcriptional regulator, IclR family  38.46 
 
 		 254 aa  171  1e-41  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.720721 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4784  transcriptional regulator, IclR family  39.43 
 
 		 257 aa  170  2e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.820047  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4201  transcriptional regulator, IclR family  38.62 
 
 		 254 aa  169  5e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.191751  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4879  transcriptional regulator, IclR family  38.55 
 
 		 277 aa  168  7e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4416  transcriptional regulator, IclR family  37.25 
 
 		 251 aa  166  2.9999999999999998e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4475  transcriptional regulator, IclR family  38.17 
 
 		 258 aa  166  5e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0192379  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2238  transcriptional regulator, IclR family  38.78 
 
 		 251 aa  163  2.0000000000000002e-39  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.399676  normal  0.216558 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0499  transcriptional regulator, IclR family  42.54 
 
 		 258 aa  162  6e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0822  transcriptional regulator, IclR family  38.52 
 
 		 258 aa  160  1e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0808  transcriptional regulator, IclR family  38.06 
 
 		 272 aa  158  1e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1075  transcriptional regulator, IclR family  36.67 
 
 		 266 aa  156  4e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3940  transcriptional regulator, IclR family  39.43 
 
 		 256 aa  155  8e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4730  transcriptional regulator, IclR family  34.65 
 
 		 268 aa  152  4e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4694  transcriptional regulator, IclR family  38.52 
 
 		 255 aa  149  3e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.116545  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3665  transcriptional regulator, IclR family  35.02 
 
 		 262 aa  150  3e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2325  transcriptional regulator, IclR family  35.97 
 
 		 258 aa  149  6e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3416  transcriptional regulator, IclR family  36.44 
 
 		 257 aa  148  9e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4413  transcriptional regulator, IclR family  35.77 
 
 		 251 aa  147  2.0000000000000003e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3666  transcriptional regulator, IclR family  34.78 
 
 		 267 aa  144  2e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4669  transcriptional regulator, IclR family  36.33 
 
 		 275 aa  142  4e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0947  transcriptional regulator, IclR family  35.08 
 
 		 258 aa  142  5e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.264338 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4139  transcriptional regulator, IclR family  36.77 
 
 		 261 aa  139  3.9999999999999997e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4647  transcriptional regulator, IclR family  31.12 
 
 		 262 aa  137  3.0000000000000003e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4374  transcriptional regulator, IclR family  31.4 
 
 		 250 aa  130  3e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0433228  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4056  transcriptional regulator, IclR family  32.81 
 
 		 281 aa  130  3e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3844  transcriptional regulator, IclR family  30.68 
 
 		 270 aa  129  4.0000000000000003e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1156  transcriptional regulator, IclR family  36.21 
 
 		 256 aa  128  9.000000000000001e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0417534  hitchhiker  0.00000481305 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0813  transcriptional regulator, IclR family  32.23 
 
 		 249 aa  125  5e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.225314  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16320  Transcriptional regulator IclR  36.36 
 
 		 255 aa  125  7e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  7.446e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0443  transcriptional regulator, TrmB  33.89 
 
 		 254 aa  121  9.999999999999999e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.915404  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2531  transcriptional regulator, IclR family  34.56 
 
 		 259 aa  120  1.9999999999999998e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0882  IclR family transcriptional regulator  28.34 
 
 		 246 aa  120  3e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0859  transcriptional regulator IclR-like protein  28.34 
 
 		 246 aa  120  3e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0514  IclR family transcriptional regulator  32.13 
 
 		 260 aa  119  6e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000101936  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2861  transcriptional regulator, IclR family  36.73 
 
 		 248 aa  119  7e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1911  transcriptional regulator, IclR family  30.3 
 
 		 256 aa  118  7.999999999999999e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3960  transcriptional regulator, IclR family  34.5 
 
 		 255 aa  118  9.999999999999999e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3440  IclR family transcriptional regulator  29.75 
 
 		 273 aa  117  9.999999999999999e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.866579  normal  0.57268 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0101  transcriptional regulator, TrmB  33.61 
 
 		 249 aa  116  3e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2373  transcriptional regulator, IclR family  31.17 
 
 		 261 aa  117  3e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1780  IclR family transcriptional regulator  32.37 
 
 		 272 aa  116  3e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3261  IclR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 284 aa  116  3e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3027  IclR family transcriptional regulator  30.24 
 
 		 260 aa  115  7.999999999999999e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000289902  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6211  IclR family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 282 aa  115  8.999999999999998e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.253024 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30950  transcriptional regulator, IclR family  32.54 
 
 		 277 aa  114  2.0000000000000002e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.648334  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0439  transcriptional regulator IclR  36.41 
 
 		 286 aa  113  3e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.28447 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0886  transcriptional regulator  29.91 
 
 		 280 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.574379  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0457  transcriptional regulator IclR  31.2 
 
 		 295 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2397  regulatory protein, IclR  30.3 
 
 		 263 aa  109  3e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.162621  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5943  transcriptional regulator, IclR family  32.68 
 
 		 257 aa  109  5e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2760  IclR family transcriptional regulator  32.44 
 
 		 261 aa  108  6e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2698  IclR family transcriptional regulator  28.63 
 
 		 280 aa  108  6e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.505501  normal  0.569064 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1855  transcriptional regulator, IclR family  32.17 
 
 		 280 aa  108  6e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1161  transcriptional regulator, IclR family  30.43 
 
 		 267 aa  108  8.000000000000001e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0013559 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3411  transcription regulator protein  30.67 
 
 		 262 aa  108  1e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.531114 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0759  IclR family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 261 aa  108  1e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.46118e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0375  IclR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 254 aa  107  1e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.665673 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3922  regulatory proteins, IclR  33.2 
 
 		 279 aa  108  1e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.959177  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13060  transcriptional regulator, IclR family  30.97 
 
 		 264 aa  107  1e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3031  regulatory protein, IclR  30.3 
 
 		 276 aa  107  2e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01798  predicted DNA-binding transcriptional regulator  30.6 
 
 		 263 aa  106  3e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.440803  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2559  transcriptional regulator KdgR  30.6 
 
 		 263 aa  106  3e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000361362  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01786  hypothetical protein  30.6 
 
 		 263 aa  106  3e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.633166  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2095  transcriptional regulator KdgR  30.6 
 
 		 263 aa  106  3e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000995956  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1805  IclR family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 263 aa  106  3e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.954449  normal  0.233357 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2571  regulatory protein, IclR  29.96 
 
 		 258 aa  106  3e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.853506  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1360  transcriptional regulator KdgR  30.6 
 
 		 263 aa  106  3e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000169219  normal  0.0136372 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1918  transcriptional regulator KdgR  30.6 
 
 		 263 aa  106  3e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000201259  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3644  regulatory protein, IclR  30.21 
 
 		 260 aa  106  3e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000806492  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2850  IclR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 260 aa  106  4e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000441287  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0116  IclR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 550 aa  106  4e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1998  IclR family transcriptional regulator  31.44 
 
 		 250 aa  105  5e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.21615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0779  transcriptional regulator IclR  28.45 
 
 		 278 aa  105  5e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2056  transcriptional regulator KdgR  30.6 
 
 		 263 aa  105  6e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000211216  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2596  IclR family transcriptional regulator  30.04 
 
 		 256 aa  105  7e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2718  transcriptional regulator, IclR family  32.48 
 
 		 265 aa  105  8e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2387  transcriptional regulator, IclR family  27.39 
 
 		 257 aa  104  1e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0157724  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0417  IclR family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 268 aa  103  2e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.116242 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5403  transcriptional regulator, IclR family  33.04 
 
 		 290 aa  104  2e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.681342  normal  0.436291 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2833  IclR family transcriptional regulator  30.13 
 
 		 260 aa  104  2e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000013624  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2412  IclR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 258 aa  104  2e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4383  IclR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 269 aa  103  3e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0499083 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0202  regulatory proteins, IclR  29.44 
 
 		 276 aa  103  3e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0669  transcriptional regulator, IclR family  29.36 
 
 		 260 aa  102  5e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.4595400000000001e-34 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1318  IclR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 275 aa  102  7e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.486749  normal  0.878274 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>