More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_5943 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_5943  transcriptional regulator, IclR family  100 
 
 		 257 aa  501  1e-141  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09640  transcriptional regulator, IclR family  73.03 
 
 		 257 aa  316  3e-85  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.936146  normal  0.241147 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4762  transcriptional regulator, IclR family  64.96 
 
 		 248 aa  303  2.0000000000000002e-81  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0849  regulatory proteins, IclR  63.75 
 
 		 276 aa  293  2e-78  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2596  IclR family transcriptional regulator  63.2 
 
 		 256 aa  293  2e-78  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0712  transcriptional regulator, IclR family  63.49 
 
 		 265 aa  289  3e-77  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.93668  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3431  IclR family transcriptional regulator  59.09 
 
 		 251 aa  289  4e-77  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3210  transcriptional regulator, IclR family  58.26 
 
 		 251 aa  285  7e-76  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0265  transcriptional regulator, IclR family  61.8 
 
 		 264 aa  277  1e-73  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4797  transcriptional regulator, IclR family  65.77 
 
 		 258 aa  273  2.0000000000000002e-72  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2257  IclR family transcriptional regulator  58.9 
 
 		 259 aa  249  2e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.115222 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2032  transcriptional regulator, IclR family  58.74 
 
 		 254 aa  248  1e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.716752  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3174  regulatory protein, IclR  56.58 
 
 		 264 aa  246  3e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.234934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2225  Transcriptional regulator IclR  58.18 
 
 		 249 aa  244  9.999999999999999e-64  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08220  transcriptional regulator, IclR family  54.17 
 
 		 257 aa  243  1.9999999999999999e-63  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6969  IclR family transcriptional regulator  56.07 
 
 		 283 aa  229  4e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.255259  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2850  IclR family transcriptional regulator  42.56 
 
 		 260 aa  174  9e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000441287  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1156  transcriptional regulator, IclR family  47.01 
 
 		 256 aa  166  4e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0417534  hitchhiker  0.00000481305 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3440  IclR family transcriptional regulator  40 
 
 		 273 aa  160  2e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.866579  normal  0.57268 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1180  IclR family transcriptional regulator  38.22 
 
 		 267 aa  157  2e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000286827  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5403  transcriptional regulator, IclR family  42.37 
 
 		 290 aa  157  2e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.681342  normal  0.436291 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16320  Transcriptional regulator IclR  39.57 
 
 		 255 aa  155  7e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  7.446e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1911  transcriptional regulator, IclR family  34.43 
 
 		 256 aa  150  2e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2373  transcriptional regulator, IclR family  35.66 
 
 		 261 aa  146  4.0000000000000006e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0417  IclR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 268 aa  145  9e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.116242 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1780  IclR family transcriptional regulator  38.37 
 
 		 272 aa  142  5e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2531  transcriptional regulator, IclR family  37.9 
 
 		 259 aa  141  9e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3924  transcriptional repressor IclR  35.66 
 
 		 280 aa  137  1e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0367  transcriptional repressor IclR  35.66 
 
 		 280 aa  137  1e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.504781  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0297  transcriptional repressor IclR  35.66 
 
 		 280 aa  137  1e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0438568  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3776  transcriptional repressor IclR  35.62 
 
 		 276 aa  137  2e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0368  transcriptional repressor IclR  38.63 
 
 		 277 aa  136  3.0000000000000003e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3702  transcriptional regulator, IclR family  32.38 
 
 		 252 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.8457  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03890  DNA-binding transcriptional repressor  37.28 
 
 		 274 aa  135  7.000000000000001e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3979  transcriptional regulator, IclR family  37.28 
 
 		 274 aa  135  7.000000000000001e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5488  transcriptional repressor IclR  37.28 
 
 		 274 aa  135  7.000000000000001e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.901357  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4254  transcriptional repressor IclR  37.28 
 
 		 274 aa  135  7.000000000000001e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.084393  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03850  hypothetical protein  37.28 
 
 		 274 aa  135  7.000000000000001e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4562  transcriptional repressor IclR  37.28 
 
 		 274 aa  135  7.000000000000001e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4471  transcriptional repressor IclR  37.28 
 
 		 274 aa  135  7.000000000000001e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.215784  normal  0.0860899 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4012  transcriptional repressor IclR  37.28 
 
 		 274 aa  135  7.000000000000001e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.992009  normal  0.0359052 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3952  transcriptional repressor IclR  35.93 
 
 		 277 aa  134  9.999999999999999e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.398782  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0066  IclR family transcriptional regulator  37.65 
 
 		 284 aa  134  9.999999999999999e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3960  transcriptional regulator, IclR family  39 
 
 		 255 aa  134  1.9999999999999998e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0453  transcriptional repressor IclR  36.48 
 
 		 277 aa  133  3e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0122119  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2760  IclR family transcriptional regulator  42.04 
 
 		 261 aa  132  3.9999999999999996e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2617  IclR family transcriptional regulator  37.6 
 
 		 276 aa  132  6e-30  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0882  IclR family transcriptional regulator  30.45 
 
 		 246 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0859  transcriptional regulator IclR-like protein  30.45 
 
 		 246 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4038  transcriptional regulator, IclR family  39.74 
 
 		 260 aa  131  1.0000000000000001e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0443  transcriptional regulator, TrmB  33.33 
 
 		 254 aa  130  3e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.915404  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7933  transcriptional regulator  40.52 
 
 		 267 aa  130  3e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.829715  normal  0.789852 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4201  transcriptional regulator, IclR family  34.82 
 
 		 254 aa  129  4.0000000000000003e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.191751  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4730  transcriptional regulator, IclR family  36.86 
 
 		 268 aa  129  5.0000000000000004e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4491  transcriptional repressor IclR  37.12 
 
 		 276 aa  128  8.000000000000001e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.880691  normal  0.328338 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4399  transcriptional repressor IclR  36.4 
 
 		 274 aa  127  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.241135  normal  0.788445 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4434  transcriptional repressor IclR  36.4 
 
 		 274 aa  127  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4524  transcriptional repressor IclR  36.4 
 
 		 274 aa  127  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4386  transcriptional regulator, IclR family  33.91 
 
 		 257 aa  127  1.0000000000000001e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.7103e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4597  transcriptional repressor IclR  36.4 
 
 		 274 aa  127  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4521  transcriptional repressor IclR  36.4 
 
 		 274 aa  127  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.693212  normal  0.182303 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1949  transcriptional regulator, IclR family  32.42 
 
 		 263 aa  127  1.0000000000000001e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00482853  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0876  IclR family transcriptional regulator  36.1 
 
 		 295 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2387  transcriptional regulator, IclR family  31.84 
 
 		 257 aa  127  2.0000000000000002e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0157724  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0668  transcriptional regulator, IclR family  33.33 
 
 		 257 aa  126  4.0000000000000003e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000062061  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0221  transcriptional repressor IclR  35.22 
 
 		 275 aa  126  4.0000000000000003e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0850662 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3922  regulatory proteins, IclR  38.86 
 
 		 279 aa  125  5e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.959177  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2164  transcriptional regulator, IclR family  40.71 
 
 		 277 aa  125  5e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.851841  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4887  transcriptional regulator, IclR family  37.39 
 
 		 255 aa  125  8.000000000000001e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2055  transcriptional regulator, IclR family  30.86 
 
 		 263 aa  125  9e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0903474  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3407  transcriptional regulator, IclR family  38.22 
 
 		 255 aa  124  1e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.351965  normal  0.802524 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0886  transcriptional regulator  34.51 
 
 		 280 aa  124  1e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.574379  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0178  transcriptional regulator, IclR family  37.99 
 
 		 281 aa  123  2e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1178  IclR family transcriptional regulator  36.48 
 
 		 262 aa  124  2e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00493645  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1318  IclR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 275 aa  124  2e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.486749  normal  0.878274 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3881  transcriptional regulator, IclR family  35.71 
 
 		 254 aa  124  2e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0445714  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0457  transcriptional regulator IclR  34.71 
 
 		 295 aa  123  3e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0115  transcriptional regulator, IclR family  34.38 
 
 		 279 aa  123  4e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.587027  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0740  regulatory protein IclR  34.48 
 
 		 277 aa  122  6e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01798  predicted DNA-binding transcriptional regulator  31.37 
 
 		 263 aa  121  9e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.440803  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2095  transcriptional regulator KdgR  31.37 
 
 		 263 aa  121  9e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000995956  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01786  hypothetical protein  31.37 
 
 		 263 aa  121  9e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.633166  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1918  transcriptional regulator KdgR  31.37 
 
 		 263 aa  121  9e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000201259  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1360  transcriptional regulator KdgR  31.37 
 
 		 263 aa  121  9e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000169219  normal  0.0136372 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1805  IclR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 263 aa  121  9e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.954449  normal  0.233357 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2559  transcriptional regulator KdgR  31.37 
 
 		 263 aa  121  9e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000361362  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1998  IclR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 250 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.21615  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1993  IclR family transcriptional regulator  35.02 
 
 		 275 aa  121  9.999999999999999e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.080856  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1289  transcriptional regulator KdgR  31.37 
 
 		 263 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000107384  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1985  transcriptional regulator KdgR  31.37 
 
 		 263 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.364862  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1473  transcriptional regulator KdgR  31.37 
 
 		 263 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0115946  normal  0.370857 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2718  transcriptional regulator, IclR family  33.47 
 
 		 265 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2043  transcriptional regulator KdgR  31.37 
 
 		 263 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.374419  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1981  transcriptional regulator KdgR  31.37 
 
 		 263 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.364283  normal  0.0913734 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2122  IclR family transcriptional regulator  30.92 
 
 		 263 aa  120  3e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000124752  decreased coverage  0.000111832 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1087  transcriptional regulator, IclR family  35.4 
 
 		 258 aa  120  3e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3712  IclR family transcriptional regulator  40.25 
 
 		 269 aa  120  3e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.382183  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1161  transcriptional regulator, IclR family  35.56 
 
 		 267 aa  119  3.9999999999999996e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0013559 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2370  IclR family transcriptional regulator  35.84 
 
 		 268 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4675  transcriptional regulator, IclR family  41.2 
 
 		 272 aa  119  4.9999999999999996e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.236119  normal  0.713971 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>