More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_4056 on replicon NC_013924
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013924  Nmag_4056  transcriptional regulator, IclR family  100 
 
 		 281 aa  576  1.0000000000000001e-163  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4139  transcriptional regulator, IclR family  44.69 
 
 		 261 aa  191  1e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0499  transcriptional regulator, IclR family  45.61 
 
 		 258 aa  189  4e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3666  transcriptional regulator, IclR family  41.02 
 
 		 267 aa  189  4e-47  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4730  transcriptional regulator, IclR family  40.08 
 
 		 268 aa  180  2e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3844  transcriptional regulator, IclR family  38.8 
 
 		 270 aa  178  8e-44  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4019  transcriptional regulator, IclR family  36.33 
 
 		 258 aa  162  5.0000000000000005e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2252  transcriptional regulator, IclR family  36.25 
 
 		 263 aa  161  9e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.128917  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3407  transcriptional regulator, IclR family  37.75 
 
 		 255 aa  155  5.0000000000000005e-37  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.351965  normal  0.802524 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2325  transcriptional regulator, IclR family  37.45 
 
 		 258 aa  155  6e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2238  transcriptional regulator, IclR family  36.51 
 
 		 251 aa  155  8e-37  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.399676  normal  0.216558 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0824  transcriptional regulator, IclR family  35.8 
 
 		 264 aa  150  2e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3532  transcriptional regulator, IclR family  37.5 
 
 		 256 aa  149  4e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3665  transcriptional regulator, IclR family  35.15 
 
 		 262 aa  149  6e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2872  transcriptional regulator, IclR family  36.84 
 
 		 255 aa  149  7e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3416  transcriptional regulator, IclR family  36.49 
 
 		 257 aa  146  5e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4694  transcriptional regulator, IclR family  38.4 
 
 		 255 aa  145  9e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.116545  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3881  transcriptional regulator, IclR family  36.71 
 
 		 254 aa  144  1e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0445714  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0822  transcriptional regulator, IclR family  35.62 
 
 		 258 aa  142  5e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0099  transcriptional regulator, IclR family  35.04 
 
 		 262 aa  140  3e-32  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4391  transcriptional regulator, IclR family  35.71 
 
 		 255 aa  140  3e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.143749  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4647  transcriptional regulator, IclR family  35.95 
 
 		 262 aa  139  3.9999999999999997e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4475  transcriptional regulator, IclR family  35.02 
 
 		 258 aa  135  5e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0192379  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1075  transcriptional regulator, IclR family  29.53 
 
 		 266 aa  135  6.0000000000000005e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1018  transcriptional regulator, IclR family  36.32 
 
 		 257 aa  134  9.999999999999999e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.142974  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0501  transcriptional regulator, IclR family  35.68 
 
 		 254 aa  134  1.9999999999999998e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1087  transcriptional regulator, IclR family  35.98 
 
 		 258 aa  134  1.9999999999999998e-30  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0808  transcriptional regulator, IclR family  32.26 
 
 		 272 aa  133  3.9999999999999996e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4413  transcriptional regulator, IclR family  35.44 
 
 		 251 aa  132  6.999999999999999e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2906  transcriptional regulator, IclR family  33.74 
 
 		 254 aa  132  6.999999999999999e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4416  transcriptional regulator, IclR family  33.9 
 
 		 251 aa  130  2.0000000000000002e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2575  transcriptional regulator, IclR family  32.81 
 
 		 262 aa  130  3e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4784  transcriptional regulator, IclR family  33.61 
 
 		 257 aa  127  1.0000000000000001e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.820047  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4201  transcriptional regulator, IclR family  37.16 
 
 		 254 aa  125  8.000000000000001e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.191751  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4879  transcriptional regulator, IclR family  34.18 
 
 		 277 aa  124  2e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0947  transcriptional regulator, IclR family  31.12 
 
 		 258 aa  121  9.999999999999999e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.264338 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0327  transcriptional regulator, IclR family  35.96 
 
 		 254 aa  119  6e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.720721 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4759  transcriptional regulator, IclR family  29.25 
 
 		 256 aa  112  5e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.635938  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4374  transcriptional regulator, IclR family  27.27 
 
 		 250 aa  108  8.000000000000001e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0433228  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1911  transcriptional regulator, IclR family  31.33 
 
 		 256 aa  105  9e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0417  IclR family transcriptional regulator  32 
 
 		 268 aa  105  1e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.116242 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1180  IclR family transcriptional regulator  30.68 
 
 		 267 aa  103  4e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000286827  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0368  transcriptional repressor IclR  28.93 
 
 		 277 aa  102  6e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2373  transcriptional regulator, IclR family  31.62 
 
 		 261 aa  99.8  4e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3031  regulatory protein, IclR  30.59 
 
 		 276 aa  100  4e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3776  transcriptional repressor IclR  27.69 
 
 		 276 aa  99  7e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0430  IclR family transcriptional regulator  30.38 
 
 		 255 aa  99  7e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0855586  normal  0.805764 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0202  regulatory proteins, IclR  29.68 
 
 		 276 aa  99  7e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3952  transcriptional repressor IclR  27.27 
 
 		 277 aa  98.6  1e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.398782  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3940  transcriptional regulator, IclR family  32.77 
 
 		 256 aa  98.2  1e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3102  transcriptional regulator, IclR family  33.61 
 
 		 260 aa  97.4  2e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1550  IclR family transcriptional regulator  29.68 
 
 		 276 aa  96.7  3e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4307  transcriptional regulator IclR  28.22 
 
 		 273 aa  97.1  3e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0456166 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0101  transcriptional regulator, TrmB  30.49 
 
 		 249 aa  96.3  5e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2850  IclR family transcriptional regulator  29.3 
 
 		 260 aa  95.9  6e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000441287  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2861  transcriptional regulator, IclR family  32.77 
 
 		 248 aa  96.3  6e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2531  transcriptional regulator, IclR family  28.74 
 
 		 259 aa  95.5  8e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0066  IclR family transcriptional regulator  28.76 
 
 		 284 aa  94  3e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2833  IclR family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 260 aa  93.6  3e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000013624  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1604  IclR family transcriptional regulator  29.07 
 
 		 259 aa  93.6  4e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.379428  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1318  IclR family transcriptional regulator  30.29 
 
 		 275 aa  93.2  4e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.486749  normal  0.878274 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0115  transcriptional regulator, IclR family  26.59 
 
 		 279 aa  92.8  5e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.587027  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0453  transcriptional repressor IclR  26.41 
 
 		 277 aa  92.8  6e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0122119  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4386  transcriptional regulator, IclR family  32.05 
 
 		 257 aa  92.4  8e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.7103e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0849  regulatory proteins, IclR  27.27 
 
 		 276 aa  92  9e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0813  transcriptional regulator, IclR family  29.54 
 
 		 249 aa  91.7  1e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.225314  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1780  IclR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 272 aa  91.3  2e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1855  transcriptional regulator, IclR family  31.67 
 
 		 280 aa  91.3  2e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4491  transcriptional repressor IclR  26.72 
 
 		 276 aa  90.9  2e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.880691  normal  0.328338 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03890  DNA-binding transcriptional repressor  26.29 
 
 		 274 aa  90.5  3e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3979  transcriptional regulator, IclR family  26.29 
 
 		 274 aa  90.5  3e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4012  transcriptional repressor IclR  26.29 
 
 		 274 aa  90.5  3e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.992009  normal  0.0359052 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5488  transcriptional repressor IclR  26.29 
 
 		 274 aa  90.5  3e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.901357  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4254  transcriptional repressor IclR  26.29 
 
 		 274 aa  90.5  3e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.084393  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4471  transcriptional repressor IclR  26.29 
 
 		 274 aa  90.5  3e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.215784  normal  0.0860899 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4562  transcriptional repressor IclR  26.29 
 
 		 274 aa  90.5  3e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03850  hypothetical protein  26.29 
 
 		 274 aa  90.5  3e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0514  IclR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 260 aa  89.4  5e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000101936  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4597  transcriptional repressor IclR  26.32 
 
 		 274 aa  89.4  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4521  transcriptional repressor IclR  26.32 
 
 		 274 aa  89.4  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.693212  normal  0.182303 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4524  transcriptional repressor IclR  26.32 
 
 		 274 aa  89.4  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3027  IclR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 260 aa  89.4  6e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000289902  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4434  transcriptional repressor IclR  26.32 
 
 		 274 aa  89.4  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4399  transcriptional repressor IclR  26.32 
 
 		 274 aa  89.4  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.241135  normal  0.788445 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3924  transcriptional repressor IclR  24.6 
 
 		 280 aa  89  7e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0367  transcriptional repressor IclR  24.6 
 
 		 280 aa  89  7e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.504781  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0297  transcriptional repressor IclR  24.6 
 
 		 280 aa  89  7e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0438568  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1161  transcriptional regulator, IclR family  27.15 
 
 		 267 aa  89  8e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0013559 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0669  transcriptional regulator, IclR family  33.05 
 
 		 260 aa  87  3e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.4595400000000001e-34 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3644  regulatory protein, IclR  32.63 
 
 		 260 aa  87  3e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000806492  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4797  transcriptional regulator, IclR family  29.91 
 
 		 258 aa  86.7  4e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4669  transcriptional regulator, IclR family  29.3 
 
 		 275 aa  86.7  4e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4531  IclR family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 283 aa  86.3  5e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.924227  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3702  transcriptional regulator, IclR family  27.8 
 
 		 252 aa  85.9  6e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.8457  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4383  IclR family transcriptional regulator  27.57 
 
 		 269 aa  85.9  7e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0499083 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0656  transcriptional regulator, IclR family  32.63 
 
 		 260 aa  85.9  7e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000253097  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2571  regulatory protein, IclR  30.84 
 
 		 258 aa  85.5  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.853506  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3712  IclR family transcriptional regulator  27.23 
 
 		 269 aa  85.1  0.000000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.382183  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0457  transcriptional regulator IclR  27.76 
 
 		 295 aa  84.7  0.000000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0116  IclR family transcriptional regulator  27.47 
 
 		 550 aa  85.1  0.000000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>