More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aaci_2531 on replicon NC_013205
Organism: Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013205  Aaci_2531  transcriptional regulator, IclR family  100 
 
 
259 aa  522  1e-147  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1911  transcriptional regulator, IclR family  51.2 
 
 
256 aa  269  4e-71  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2373  transcriptional regulator, IclR family  50.81 
 
 
261 aa  258  7e-68  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0417  IclR family transcriptional regulator  46.37 
 
 
268 aa  224  8e-58  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.116242 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1780  IclR family transcriptional regulator  44.76 
 
 
272 aa  209  2e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4386  transcriptional regulator, IclR family  39.92 
 
 
257 aa  204  1e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.7103e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3702  transcriptional regulator, IclR family  38.87 
 
 
252 aa  204  2e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.8457  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0375  IclR family transcriptional regulator  42.06 
 
 
254 aa  197  1.0000000000000001e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.665673 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1180  IclR family transcriptional regulator  43.53 
 
 
267 aa  192  3e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000286827  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3027  IclR family transcriptional regulator  39.92 
 
 
260 aa  192  6e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000289902  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2850  IclR family transcriptional regulator  42.86 
 
 
260 aa  191  1e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000441287  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0514  IclR family transcriptional regulator  39.53 
 
 
260 aa  190  2e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000101936  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3102  transcriptional regulator, IclR family  37.15 
 
 
260 aa  188  8e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2122  IclR family transcriptional regulator  40.49 
 
 
263 aa  187  1e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000124752  decreased coverage  0.000111832 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3333  transcriptional regulator, IclR family  37.25 
 
 
252 aa  187  2e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.950577  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1855  transcriptional regulator, IclR family  38.1 
 
 
280 aa  187  2e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0669  transcriptional regulator, IclR family  37.94 
 
 
260 aa  187  2e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.4595400000000001e-34 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3644  regulatory protein, IclR  37.94 
 
 
260 aa  187  2e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000806492  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5403  transcriptional regulator, IclR family  42.34 
 
 
290 aa  185  6e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.681342  normal  0.436291 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2653  transcriptional regulator  40.16 
 
 
263 aa  185  7e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.618751  normal  0.01576 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1156  transcriptional regulator, IclR family  40.4 
 
 
256 aa  185  7e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0417534  hitchhiker  0.00000481305 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0458  regulatory protein, IclR  36.84 
 
 
252 aa  185  7e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0309456 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1683  transcriptional regulator  40.16 
 
 
263 aa  185  8e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1793  IclR family transcriptional regulator  40.16 
 
 
263 aa  185  8e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1949  transcriptional regulator, IclR family  39.52 
 
 
263 aa  184  1.0000000000000001e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00482853  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2387  transcriptional regulator, IclR family  36.72 
 
 
257 aa  183  2.0000000000000003e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0157724  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0656  transcriptional regulator, IclR family  37.55 
 
 
260 aa  183  2.0000000000000003e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000253097  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2397  regulatory protein, IclR  39.11 
 
 
263 aa  184  2.0000000000000003e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.162621  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1985  transcriptional regulator KdgR  39.36 
 
 
263 aa  183  3e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.364862  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1981  transcriptional regulator KdgR  39.36 
 
 
263 aa  183  3e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.364283  normal  0.0913734 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1289  transcriptional regulator KdgR  39.36 
 
 
263 aa  183  3e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000107384  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1473  transcriptional regulator KdgR  39.36 
 
 
263 aa  183  3e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0115946  normal  0.370857 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2177  transcriptional regulator, IclR family  39.11 
 
 
263 aa  183  3e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00508287  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2055  transcriptional regulator, IclR family  38.71 
 
 
263 aa  182  3e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0903474  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2043  transcriptional regulator KdgR  39.36 
 
 
263 aa  183  3e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.374419  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01786  hypothetical protein  39.11 
 
 
263 aa  182  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.633166  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01798  predicted DNA-binding transcriptional regulator  39.11 
 
 
263 aa  182  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.440803  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2095  transcriptional regulator KdgR  39.11 
 
 
263 aa  182  4.0000000000000006e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000995956  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1918  transcriptional regulator KdgR  39.11 
 
 
263 aa  182  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000201259  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1805  IclR family transcriptional regulator  39.11 
 
 
263 aa  182  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.954449  normal  0.233357 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2559  transcriptional regulator KdgR  39.11 
 
 
263 aa  182  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000361362  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1360  transcriptional regulator KdgR  39.11 
 
 
263 aa  182  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000169219  normal  0.0136372 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0066  IclR family transcriptional regulator  39.27 
 
 
284 aa  182  4.0000000000000006e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1885  transcriptional regulator, IclR family  39.11 
 
 
263 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0160572  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0612  transcriptional regulator IclR  39.34 
 
 
255 aa  182  5.0000000000000004e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000145018 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2056  transcriptional regulator KdgR  39.11 
 
 
263 aa  181  1e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000211216  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2510  transcriptional regulator, IclR family  41.48 
 
 
308 aa  181  2e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00153166  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7726  IclR family transcriptional regulator  42 
 
 
261 aa  180  2e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0759  IclR family transcriptional regulator  38.58 
 
 
261 aa  179  4e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.46118e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1178  IclR family transcriptional regulator  38.96 
 
 
262 aa  178  1e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00493645  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2833  IclR family transcriptional regulator  35.57 
 
 
260 aa  176  3e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000013624  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5758  IclR family transcriptional regulator  36.65 
 
 
292 aa  175  5e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.201965  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2240  regulatory protein, IclR  41.13 
 
 
262 aa  176  5e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3440  IclR family transcriptional regulator  37.8 
 
 
273 aa  175  7e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.866579  normal  0.57268 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3670  IclR family transcriptional regulator  37.4 
 
 
267 aa  175  8e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.461825  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2308  transcriptional regulator, IclR family  37.1 
 
 
255 aa  173  1.9999999999999998e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4675  transcriptional regulator, IclR family  44.44 
 
 
272 aa  173  2.9999999999999996e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.236119  normal  0.713971 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2294  transcriptional regulator, IclR family  39.84 
 
 
265 aa  172  5e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2164  transcriptional regulator, IclR family  37.8 
 
 
277 aa  172  5.999999999999999e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.851841  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2571  regulatory protein, IclR  37.85 
 
 
258 aa  172  6.999999999999999e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.853506  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2208  transcriptional regulator, IclR family  35.29 
 
 
290 aa  171  1e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3853  IclR family transcriptional regulator  38.06 
 
 
263 aa  170  2e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.532852  hitchhiker  0.00959131 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1318  IclR family transcriptional regulator  36.9 
 
 
275 aa  169  5e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.486749  normal  0.878274 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4762  transcriptional regulator, IclR family  41.84 
 
 
248 aa  168  7e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0457  transcriptional regulator IclR  35.6 
 
 
295 aa  168  8e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16320  Transcriptional regulator IclR  36.44 
 
 
255 aa  168  9e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  7.446e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0668  transcriptional regulator, IclR family  34.54 
 
 
257 aa  168  1e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000062061  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1624  transcriptional regulator, IclR family  37.1 
 
 
275 aa  167  1e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2008  transcriptional regulator IclR  35.25 
 
 
260 aa  167  1e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2412  IclR family transcriptional regulator  37.85 
 
 
258 aa  168  1e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0370  IclR family transcriptional regulator  38.98 
 
 
265 aa  167  2e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.470614  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6599  putative transcriptional regulator, IclR family  38.43 
 
 
273 aa  167  2e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0547312  normal  0.643607 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0443  transcriptional regulator, TrmB  36.33 
 
 
254 aa  167  2e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.915404  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2527  transcriptional regulator, IclR family  37.65 
 
 
265 aa  167  2e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00648168  normal  0.235147 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3712  IclR family transcriptional regulator  37.6 
 
 
269 aa  164  1.0000000000000001e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.382183  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3546  regulatory protein, IclR  37.6 
 
 
265 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000366663  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3109  IclR family transcriptional regulator  39.36 
 
 
257 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1912  IclR family transcriptional regulator  40.66 
 
 
283 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3776  transcriptional repressor IclR  36.63 
 
 
276 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4491  transcriptional repressor IclR  37.9 
 
 
276 aa  163  3e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.880691  normal  0.328338 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0886  transcriptional regulator  32.68 
 
 
280 aa  163  3e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.574379  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0368  transcriptional repressor IclR  37.45 
 
 
277 aa  163  3e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0367  transcriptional repressor IclR  36.69 
 
 
280 aa  162  4.0000000000000004e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.504781  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0297  transcriptional repressor IclR  36.69 
 
 
280 aa  162  4.0000000000000004e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0438568  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3924  transcriptional repressor IclR  36.69 
 
 
280 aa  162  4.0000000000000004e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0453  transcriptional repressor IclR  37.85 
 
 
277 aa  162  5.0000000000000005e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0122119  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3952  transcriptional repressor IclR  36.73 
 
 
277 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.398782  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000924  transcriptional regulator KdgR KDG operon repressor  34.41 
 
 
265 aa  161  9e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0849  regulatory proteins, IclR  39.92 
 
 
276 aa  161  1e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2702  transcriptional regulator, IclR family  34.92 
 
 
254 aa  160  2e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0779  transcriptional regulator IclR  34.14 
 
 
278 aa  160  2e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0882  IclR family transcriptional regulator  34.01 
 
 
246 aa  159  3e-38  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3456  transcriptional regulator, IclR family  35.74 
 
 
269 aa  160  3e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0532  transcriptional regulator, IclR family  40.08 
 
 
253 aa  159  3e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0859  transcriptional regulator IclR-like protein  34.01 
 
 
246 aa  159  3e-38  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4475  transcriptional regulator, IclR family  34.19 
 
 
258 aa  159  4e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0192379  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0712  transcriptional regulator, IclR family  40.73 
 
 
265 aa  159  5e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.93668  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0668  regulatory proteins, IclR  38.75 
 
 
242 aa  159  5e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0128525  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1885  IclR family transcriptional regulator  37.05 
 
 
249 aa  158  8e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.216873 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2309  transcriptional regulator, IclR family  35.77 
 
 
253 aa  156  3e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>